226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1726 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04171  predicted endoglucanase with Zn-dependent exopeptidase domain  84.14 
 
 
373 aa  652    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1729  putative sgc region protein SgcX  99.19 
 
 
372 aa  762    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3694  peptidase M42 family protein  84.14 
 
 
373 aa  652    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1549  putative sgc region protein SgcX  98.92 
 
 
372 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1730  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  764    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.771203 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1726  sgc region protein SgcX  100 
 
 
372 aa  764    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04133  hypothetical protein  84.14 
 
 
373 aa  652    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1790  sgc region protein SgcX  99.46 
 
 
372 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00171255  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3752  peptidase M42 family protein  46.82 
 
 
366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  36.44 
 
 
350 aa  224  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  34.17 
 
 
350 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  34.45 
 
 
350 aa  219  6e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  34.68 
 
 
350 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1551  cellulase  34.17 
 
 
350 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  34.58 
 
 
351 aa  217  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2113  peptidase M42  35.38 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  37.1 
 
 
357 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1201  peptidase M42 family protein  35.98 
 
 
345 aa  203  4e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214071  normal  0.0232682 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  35.57 
 
 
384 aa  202  5e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  35.41 
 
 
349 aa  202  9e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0912  peptidase M42  33.71 
 
 
345 aa  194  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  36.02 
 
 
362 aa  192  5e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2043  M42 family peptidase  32.95 
 
 
358 aa  192  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2409  Cellulase  32.77 
 
 
348 aa  187  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0934  peptidase M42 family protein  34.94 
 
 
349 aa  187  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0537  peptidase M42 family protein  35.14 
 
 
359 aa  179  4.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.349139 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  33.89 
 
 
362 aa  178  1e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0608  peptidase M42  32.55 
 
 
349 aa  178  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0364864  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0542  cellulase  33.33 
 
 
362 aa  177  4e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192278  hitchhiker  0.00117454 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1761  peptidase M42 family protein  32.58 
 
 
348 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2482  cellulase  33.91 
 
 
358 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000313372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2531  cellulase  33.91 
 
 
358 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000126946  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1045  Glutamyl aminopeptidase  33.05 
 
 
360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0097  cellulase  34 
 
 
334 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0313  Cellulase  31.74 
 
 
342 aa  171  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1760  peptidase M42 family protein  31.58 
 
 
328 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0999  peptidase M42 family protein  36.57 
 
 
351 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  33.52 
 
 
362 aa  170  3e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0820  peptidase M42 family protein  34.38 
 
 
357 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1505  cellulase  33.14 
 
 
345 aa  169  7e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4467  M42 family peptidase  31.05 
 
 
361 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0619409  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4815  M42 family peptidase  31.05 
 
 
361 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000499602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3257  cellulase  31.2 
 
 
361 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4313  glucanase/ deblocking aminopeptidase  30.77 
 
 
361 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230763  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4702  M42 family peptidase  30.77 
 
 
361 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00201284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4302  glucanase/ deblocking aminopeptidase  30.77 
 
 
361 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000481551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4695  peptidase, M42 family  30.77 
 
 
361 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000157013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4686  peptidase, M42 family  30.77 
 
 
361 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.124679999999999e-51 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4402  cellulase  30.68 
 
 
361 aa  167  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.078585  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0803  Cellulase  31.18 
 
 
362 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0609  peptidase M42  32.56 
 
 
325 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489423  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1216  putative lyase/synthase  31.9 
 
 
356 aa  166  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0144913  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0558  peptidase, M42 family  30.61 
 
 
361 aa  166  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000121832  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4679  peptidase, M42 family  30.61 
 
 
361 aa  166  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2655  Cellulase  31.5 
 
 
361 aa  166  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3125  peptidase M42 family protein  34.17 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.612233  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0522  hypothetical protein  29.71 
 
 
374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2259  Cellulase  31.09 
 
 
358 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0943649  unclonable  0.0000000415481 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0546  hypothetical protein  29.71 
 
 
374 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1495  Cellulase  29.85 
 
 
353 aa  161  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0354  peptidase M42 family protein  33.05 
 
 
346 aa  161  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.326213  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0232  peptidase M42 family protein  32.39 
 
 
352 aa  160  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0349  peptidase M42 family protein  32.1 
 
 
352 aa  159  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1305  glutamyl-aminopeptidase  30.26 
 
 
361 aa  159  7e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000937587  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1759  cellulase  31.5 
 
 
339 aa  159  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4885  glutamyl aminopeptidase  31.1 
 
 
360 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2767  peptidase M42 family protein  32 
 
 
339 aa  158  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0206  cellulase  31.25 
 
 
350 aa  157  3e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2294  peptidase M42  33.53 
 
 
356 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1702  cellulase  32.08 
 
 
339 aa  157  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2478  Cellulase  31.99 
 
 
359 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1994  peptidase M42  33.24 
 
 
354 aa  156  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000914633  normal  0.691904 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4428  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  29.15 
 
 
356 aa  155  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1077  cellulase  31.2 
 
 
336 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0394198  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1385  peptidase M42 family protein  30.24 
 
 
357 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03783  predicted endo-1,4-beta-glucanase  28.53 
 
 
356 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4086  Cellulase  28.53 
 
 
356 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4126  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  28.53 
 
 
356 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0378  peptidase M42 family protein  30.14 
 
 
327 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03732  hypothetical protein  28.53 
 
 
356 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0376  peptidase M42 family protein  30.23 
 
 
346 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4119  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  28.53 
 
 
356 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0680  peptidase M42 family protein  28.25 
 
 
336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0048  peptidase M42 family protein  30.97 
 
 
355 aa  153  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4288  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  28.86 
 
 
356 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0724  peptidase M42 family protein  31.91 
 
 
350 aa  153  5e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.143036  normal  0.785387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0058  peptidase M42 family protein  31.25 
 
 
355 aa  153  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0590  hypothetical protein  32.24 
 
 
352 aa  151  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2766  peptidase M42 family protein  32.43 
 
 
336 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2196  hydrolase, putative  32.63 
 
 
354 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1213  peptidase M42 family protein  31.46 
 
 
344 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2745  Glutamyl aminopeptidase  28.53 
 
 
358 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000840882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2768  peptidase M42 family protein  33.05 
 
 
353 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1676  peptidase M42 family protein  32.38 
 
 
346 aa  150  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0738  peptidase M42  32.75 
 
 
353 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.511886  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1376  peptidase M42 family protein  29.45 
 
 
354 aa  150  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376322  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5349  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  28.57 
 
 
356 aa  149  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1121  peptidase M42 family protein  29.8 
 
 
334 aa  149  9e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0687  Glutamyl aminopeptidase  28.37 
 
 
359 aa  149  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0278  endo-1,4-beta-glucanase  28.09 
 
 
363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>