More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1491 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1491  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 
340 aa  664    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.961051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5231  hypothetical protein  53.1 
 
 
344 aa  349  5e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1483  hypothetical protein  54.9 
 
 
333 aa  347  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1926  hypothetical protein  52.98 
 
 
337 aa  342  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5291  hypothetical protein  53.39 
 
 
344 aa  340  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5118  membrane protein  53.39 
 
 
344 aa  340  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5133  membrane protein  53.39 
 
 
344 aa  340  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000220099  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5688  hypothetical protein  53.39 
 
 
344 aa  340  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5533  hypothetical protein  53.39 
 
 
344 aa  340  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5570  hypothetical protein  53.39 
 
 
344 aa  340  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3416  hypothetical protein  52.68 
 
 
337 aa  340  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000602255 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2006  hypothetical protein  53.75 
 
 
337 aa  338  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.277817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5562  membrane protein YdbI  56.13 
 
 
317 aa  333  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5618  hypothetical protein  55.81 
 
 
314 aa  333  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5387  hypothetical protein  56.13 
 
 
314 aa  333  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.514486  normal  0.849251 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1783  hypothetical protein  54.05 
 
 
337 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.431279  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1762  hypothetical protein  54.05 
 
 
337 aa  333  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0301209  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1740  hypothetical protein  54.05 
 
 
337 aa  333  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2027  hypothetical protein  54.05 
 
 
337 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0291717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1922  hypothetical protein  54.05 
 
 
337 aa  333  4e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.409458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1958  hypothetical protein  53.75 
 
 
337 aa  332  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000222767 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3955  hypothetical protein  54.33 
 
 
347 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1797  hypothetical protein  53.25 
 
 
339 aa  322  6e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.341958  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0039  permease  42.48 
 
 
349 aa  282  6.000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3344  protein of unknown function UPF0118  47.6 
 
 
343 aa  281  9e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.395635  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0130  hypothetical protein  41.67 
 
 
341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1793  permease  31.69 
 
 
331 aa  156  5.0000000000000005e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384748  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0313  permease  31.04 
 
 
347 aa  146  4.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0642  protein of unknown function UPF0118  30.69 
 
 
390 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1519  hypothetical protein  26.32 
 
 
331 aa  87  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3397  hypothetical protein  26.26 
 
 
412 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.947024  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1482  hypothetical protein  25.41 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3544  protein of unknown function UPF0118  30.85 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3480  protein of unknown function UPF0118  30.32 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  23.73 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  22.55 
 
 
390 aa  79  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3462  hypothetical protein  24.79 
 
 
418 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0247174 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  27.42 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2922  protein of unknown function UPF0118  24.92 
 
 
357 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.512956  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0546  hypothetical protein  22.94 
 
 
318 aa  72.4  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0657  permease  22.44 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.036358  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  25.14 
 
 
383 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2385  protein of unknown function UPF0118  29.86 
 
 
542 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  22.05 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  22.36 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  22.36 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  22.36 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  22.36 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  22.05 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  24.17 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2478  hypothetical protein  23.92 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  24.84 
 
 
354 aa  67  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  24.04 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  21.15 
 
 
361 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4544  hypothetical protein  21.85 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0928  permease  23.58 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.335153 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  21.76 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5305  hypothetical protein  22.06 
 
 
464 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.111321  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  21.75 
 
 
373 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  21.75 
 
 
348 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  23.85 
 
 
361 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  21.75 
 
 
361 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  20.4 
 
 
416 aa  63.5  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  29.88 
 
 
357 aa  63.9  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  22.8 
 
 
396 aa  63.5  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3012  protein of unknown function UPF0118  27.37 
 
 
369 aa  63.2  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  20.98 
 
 
371 aa  63.2  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  22.4 
 
 
400 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  22.71 
 
 
351 aa  62  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4001  hypothetical protein  22.93 
 
 
368 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  24.15 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1156  permease  20.92 
 
 
382 aa  61.6  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0866214  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  26.29 
 
 
377 aa  60.8  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  20.24 
 
 
371 aa  60.8  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2818  hypothetical protein  23.03 
 
 
363 aa  59.3  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0566  hypothetical protein  22.54 
 
 
394 aa  59.7  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.182463  normal  0.0679598 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2417  hypothetical protein  28.24 
 
 
366 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.798484  hitchhiker  0.00111788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1651  hypothetical protein  28.24 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3488  sporulation integral membrane protein YtvI  23.13 
 
 
374 aa  58.9  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000381599  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  23.26 
 
 
387 aa  58.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  21.09 
 
 
344 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  22.22 
 
 
366 aa  58.9  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  22.55 
 
 
366 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2392  hypothetical protein  25.08 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  22.89 
 
 
381 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  22.89 
 
 
381 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2345  hypothetical protein  27.86 
 
 
366 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000997744 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  23.03 
 
 
348 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2203  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 
397 aa  57.8  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0681126  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  22.12 
 
 
381 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1973  hypothetical protein  24.7 
 
 
369 aa  57.4  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0953876  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  20.48 
 
 
436 aa  57.4  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2454  hypothetical protein  22.48 
 
 
346 aa  56.6  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2006  hypothetical protein  21.62 
 
 
363 aa  56.6  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000247505  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  23.96 
 
 
348 aa  56.6  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1464  hypothetical protein  30.15 
 
 
354 aa  56.6  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.209689  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1233  protein of unknown function UPF0118  28.48 
 
 
370 aa  56.6  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1450  hypothetical protein  22.02 
 
 
350 aa  56.2  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.996482  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2493  protein of unknown function UPF0118  27.55 
 
 
360 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544644  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1785  hypothetical protein  27.55 
 
 
360 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.539102  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>