69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0369 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0369  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 112 aa  228  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1245  anti-sigma-factor antagonist  63.55 
 
 		 110 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1622  anti-sigma-factor antagonist  34.83 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3036  anti-sigma-factor antagonist  31.52 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000270393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  21.43 
 
 		 111 aa  52.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4098  anti-sigma-factor antagonist  30.34 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.217078  normal  0.168859 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3288  anti-sigma-factor antagonist  29.35 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0822137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  24.49 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  25.74 
 
 		 183 aa  48.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2945  anti-sigma-factor antagonist  20 
 
 		 113 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1453  anti-sigma-factor antagonist  23.81 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0890138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  23.71 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1255  anti-sigma-factor antagonist  20.37 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.681714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3486  anti-sigma-factor antagonist  23.96 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  28.12 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  21.65 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  21.78 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  21.15 
 
 		 124 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  20.2 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2906  anti-sigma-factor antagonist  24.51 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0194  anti-sigma F factor antagonist  23.86 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4777  anti-sigma-factor antagonist  29.82 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00603517  hitchhiker  0.00801685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  22.68 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1231  anti-sigma-factor antagonist  32.81 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1978  anti-sigma-factor antagonist  29.55 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0066  anti-sigma-factor antagonist  26.83 
 
 		 114 aa  44.3  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.517234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0976  anti-sigma-factor antagonist  25.3 
 
 		 237 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  22.47 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  19.77 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  18.63 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  17.65 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1334  anti-sigma-factor antagonist  24.72 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0232359  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0398  anti-sigma-factor antagonist  21.18 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.113145  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  22.22 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4774  anti-sigma-factor antagonist  27.47 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.558891  hitchhiker  0.00959736 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  26.74 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  25 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  20.62 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7044  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7543  hypothetical protein  21.74 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.868158 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1167  anti-sigma-factor antagonist  25.61 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000216807 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0199  anti-sigma-factor antagonist  20.88 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1995  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.63 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.400716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  26.74 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  24.39 
 
 		 110 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  21.35 
 
 		 142 aa  41.6  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0024  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  23.3 
 
 		 105 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  18.95 
 
 		 113 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2140  anti-anti-sigma factor  25.35 
 
 		 108 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2103  anti-sigma-factor antagonist  25.35 
 
 		 108 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1836  anti-sigma-factor antagonist  22.34 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1765  anti-sigma-factor antagonist  20.45 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  20.83 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0146  anti-anti-sigma factor  26.37 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0642638  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  16.84 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  20.45 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  20.93 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  18.95 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1700  anti-sigma-factor antagonist  17 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.293305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  20.24 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0792  anti-sigma-factor antagonist  26.53 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  24.69 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  23.16 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2150  anti-sigma-factor antagonist  21.33 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.302168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1366  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  28.81 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.528676  normal  0.641817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  20 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  21.78 
 
 		 115 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>