More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3371 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01581  fumarate hydratase (fumarase A), aerobic Class I  71.67 
 
 		 548 aa  819    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.733068  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03993  anaerobic class I fumarate hydratase (fumarase B)  72.22 
 
 		 548 aa  828    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2031  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  71.67 
 
 		 548 aa  819    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0136036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3870  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  72.41 
 
 		 548 aa  832    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1831  fumarase  70.37 
 
 		 548 aa  810    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.640602  hitchhiker  0.002407 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2322  fumarate hydratase  71.48 
 
 		 548 aa  817    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0994  fumarate hydratase, class I  79.67 
 
 		 541 aa  918    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2615  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  78.41 
 
 		 542 aa  892    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000086832  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1417  fumarate hydratase class I, anaerobic  73.89 
 
 		 548 aa  846    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.70407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01571  hypothetical protein  71.67 
 
 		 548 aa  819    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.900743  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1809  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  78.41 
 
 		 540 aa  904    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.327698  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2239  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  62.1 
 
 		 535 aa  694    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.747448 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2560  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  70.19 
 
 		 549 aa  810    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0557449  normal  0.126998 
 
 
-
 
NC_004310  BR0961  fumarate hydratase, class I  61.73 
 
 		 539 aa  692    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.426877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4646  fumarate hydratase class I, anaerobic  71.67 
 
 		 548 aa  810    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1567  fumarate hydratase class I, anaerobic  71.67 
 
 		 548 aa  810    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3371  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  100 
 
 		 541 aa  1119    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03954  hypothetical protein  72.22 
 
 		 548 aa  828    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5636  fumarate hydratase  72.04 
 
 		 548 aa  828    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4564  fumarate hydratase  71.48 
 
 		 548 aa  807    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3404  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  72.04 
 
 		 547 aa  825    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5566  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  62.69 
 
 		 548 aa  706    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1706  fumarate hydratase class I, anaerobic  71.48 
 
 		 548 aa  819    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.142614  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0825  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate family  62.41 
 
 		 550 aa  716    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1888  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  78.6 
 
 		 540 aa  905    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3258  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  71.19 
 
 		 547 aa  816    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000853495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3905  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  72.22 
 
 		 548 aa  830    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3271  fumarate hydratase, class I  72.04 
 
 		 547 aa  826    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2570  fumarase  82.62 
 
 		 541 aa  951    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.013592  normal  0.472366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8500  fumarate hydratase, class I  61.18 
 
 		 550 aa  681    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0693  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  58.58 
 
 		 538 aa  669    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.635421  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0951  fumarate hydratase, class I  61.73 
 
 		 581 aa  692    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0881  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  63.99 
 
 		 534 aa  722    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44568  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4363  fumarate hydratase  72.41 
 
 		 548 aa  832    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2206  fumarase  63.41 
 
 		 548 aa  714    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177181  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1687  fumarate hydratase  71.67 
 
 		 548 aa  818    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.713112  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1577  fumarate hydratase class I, anaerobic  71.85 
 
 		 548 aa  811    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.551964 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2068  fumarase  78.6 
 
 		 540 aa  906    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3762  fumarate hydratase, class I  59.3 
 
 		 555 aa  667    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4675  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  59.63 
 
 		 555 aa  646    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.63947  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1533  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  59.93 
 
 		 551 aa  676    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1023  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  71.75 
 
 		 547 aa  823    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4555  fumarate hydratase class I, anaerobic  71.48 
 
 		 548 aa  807    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4397  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  60.11 
 
 		 551 aa  671    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.617771  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1708  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  58.81 
 
 		 551 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1587  fumarate hydratase  71.67 
 
 		 548 aa  819    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.596697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4695  fumarate hydratase class I, anaerobic  71.48 
 
 		 548 aa  807    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2225  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  61.35 
 
 		 539 aa  686    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4245  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  59.7 
 
 		 568 aa  646    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.201953  normal  0.0592114 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1875  fumarate hydratase class I, anaerobic  71.85 
 
 		 548 aa  812    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.27379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3184  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  71.56 
 
 		 549 aa  819    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.493682  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1798  fumarate hydratase  71.67 
 
 		 548 aa  818    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.773214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1651  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  80.41 
 
 		 541 aa  931    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000020704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1820  fumarate hydratase  71.67 
 
 		 548 aa  819    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4646  fumarate hydratase class I, anaerobic  71.48 
 
 		 548 aa  807    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3285  fumarase  67.23 
 
 		 534 aa  752    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0786  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  71.93 
 
 		 547 aa  823    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0631  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  71.14 
 
 		 547 aa  796    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1080  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  62.24 
 
 		 546 aa  699    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24490  fumarase  58.3 
 
 		 567 aa  670    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208028  normal  0.69636 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4588  fumarate hydratase class I, anaerobic  72.04 
 
 		 548 aa  829    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1492  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  59.78 
 
 		 554 aa  672    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2916  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  58.1 
 
 		 538 aa  644    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.36455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2336  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  76.31 
 
 		 538 aa  878    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.801629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3238  fumarase  61.24 
 
 		 535 aa  691    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0749  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  82.07 
 
 		 541 aa  950    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000017058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5483  fumarase  59.37 
 
 		 551 aa  674    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3082  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily subunit beta  60.85 
 
 		 551 aa  681    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1061  fumarase  59.74 
 
 		 571 aa  669    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0745  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  62.41 
 
 		 550 aa  715    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.517956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3124  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  61.74 
 
 		 564 aa  689    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00427914  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0933  fumarate hydratase, class I  72.22 
 
 		 547 aa  827    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.140694  normal  0.173179 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1337  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  62.43 
 
 		 548 aa  708    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2076  fumarate hydratase protein class I  61.54 
 
 		 534 aa  686    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6383  hydro-lyase Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, subunit beta  60.07 
 
 		 547 aa  673    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0713  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  60.89 
 
 		 550 aa  674    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0340597  normal  0.16476 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1149  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  59.15 
 
 		 554 aa  659    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.691464  normal  0.943485 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2018  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  71.67 
 
 		 548 aa  818    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2018  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  61.91 
 
 		 535 aa  694    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4022  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  70.93 
 
 		 548 aa  813    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00935684  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2144  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  71.06 
 
 		 548 aa  791    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.207467  normal  0.384871 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3051  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  76.71 
 
 		 540 aa  884    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0708755  normal  0.340068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0162  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  59.37 
 
 		 538 aa  655    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1636  fumarate hydratase class I, anaerobic  71.67 
 
 		 548 aa  810    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.901964 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4676  fumarate hydratase  72.41 
 
 		 548 aa  832    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0889  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  99.26 
 
 		 541 aa  1113    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000151157  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86934  predicted protein  61.58 
 
 		 560 aa  663    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120062  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19708  precursor of fumarase fumarase  59.69 
 
 		 567 aa  627  1e-178  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473143  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1977  fumarate hydratase  33.99 
 
 		 512 aa  226  6e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.146696  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3613  putative fumarate hydratase, class I  33.41 
 
 		 507 aa  218  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.985356  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2583  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha protein  33.33 
 
 		 516 aa  217  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.604027  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003161  fumarate hydratase class I aerobic  33.12 
 
 		 505 aa  216  9e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2653  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  33.19 
 
 		 510 aa  216  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2035  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  34.33 
 
 		 504 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1912  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  33.41 
 
 		 520 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00626493  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01949  fumarate hydratase, class I  32 
 
 		 509 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0117439  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2654  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  34.13 
 
 		 517 aa  213  5.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0657589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0922  putative fumarate hydratase, class I  33.12 
 
 		 505 aa  213  7.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.673761  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2046  fumarase  31.98 
 
 		 544 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.519105  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3214  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  32.7 
 
 		 516 aa  212  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.942506  normal  0.799174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>