More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2359 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 756 aa  1512    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 		 865 aa  495  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  41.08 
 
 		 865 aa  495  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 772 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 742 aa  395  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  34.91 
 
 		 734 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 741 aa  389  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 784 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 686 aa  382  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 740 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 777 aa  375  1e-102  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 679 aa  372  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  32.38 
 
 		 774 aa  368  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  31.99 
 
 		 770 aa  366  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  31.87 
 
 		 769 aa  365  2e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 777 aa  364  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  31.19 
 
 		 770 aa  364  3e-99  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 679 aa  364  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 		 781 aa  361  3e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  31.62 
 
 		 769 aa  360  6e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  31.62 
 
 		 769 aa  360  7e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 783 aa  360  8e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  32.26 
 
 		 764 aa  352  1e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 		 762 aa  350  7e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  31.76 
 
 		 798 aa  345  2e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  35.88 
 
 		 783 aa  343  5e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  36.05 
 
 		 785 aa  342  2e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  33.47 
 
 		 764 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  33.6 
 
 		 803 aa  330  5.0000000000000004e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0657  CheA signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 758 aa  327  5e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0137797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.96 
 
 		 764 aa  324  4e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  31.11 
 
 		 764 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  31.2 
 
 		 752 aa  318  3e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 801 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 760 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 753 aa  314  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 756 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  36.87 
 
 		 750 aa  313  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 804 aa  313  9e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 770 aa  311  2e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  30.35 
 
 		 768 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0505  chemotaxis sensor histidine kinase, putative  30.27 
 
 		 832 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.391708  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 706 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  31.19 
 
 		 763 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 777 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 808 aa  300  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 681 aa  299  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  35.9 
 
 		 839 aa  298  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  30.73 
 
 		 769 aa  298  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 769 aa  297  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 705 aa  297  6e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  36.99 
 
 		 878 aa  293  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 934 aa  292  2e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 660 aa  291  2e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 705 aa  290  7e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 2539 aa  289  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  30.21 
 
 		 2301 aa  288  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 2212 aa  288  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 766 aa  288  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3733  CheA signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 769 aa  286  7e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.577352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4572  CheA signal transduction histidine kinases  30.87 
 
 		 769 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3791  CheA signal transduction histidine kinases  30.87 
 
 		 769 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.267283 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2304  CheA signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 		 769 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.400657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 1065 aa  284  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  0.00000140381 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 695 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 1758 aa  283  9e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  35.73 
 
 		 769 aa  281  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 878 aa  280  5e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 762 aa  280  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  32.37 
 
 		 864 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  32.37 
 
 		 864 aa  278  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 896 aa  278  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 896 aa  277  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4602  CheA signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 974 aa  277  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 765 aa  277  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  32.37 
 
 		 864 aa  277  7e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  32.37 
 
 		 864 aa  277  7e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 598 aa  277  7e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  32.37 
 
 		 864 aa  277  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  32.37 
 
 		 864 aa  277  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  32.81 
 
 		 766 aa  276  8e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 		 755 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 1012 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 1907 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 		 767 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  37.18 
 
 		 1089 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0416  CheA signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 977 aa  275  3e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  28.36 
 
 		 2301 aa  273  6e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 607 aa  273  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  30.64 
 
 		 610 aa  273  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 649 aa  272  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  36.17 
 
 		 1834 aa  273  1e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  29.45 
 
 		 2048 aa  272  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4747  CheA signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 941 aa  272  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  28.68 
 
 		 1992 aa  271  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0859  CheA signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 952 aa  271  4e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.571784  normal  0.0418696 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0062  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.67 
 
 		 974 aa  271  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.172563  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3136  CheA signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 649 aa  270  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 796 aa  270  5.9999999999999995e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 		 701 aa  270  5.9999999999999995e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>