50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6625 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6625  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0149  hypothetical protein  35.94 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.214633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0824  hypothetical protein  35.79 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4511  hypothetical protein  31.55 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0916947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5441  hypothetical protein  31.75 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4956  hypothetical protein  35.45 
 
 		 207 aa  77.8  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.56336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5150  hypothetical protein  32.43 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4205  hypothetical protein  34.78 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520104  normal  0.0181669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3764  hypothetical protein  38.6 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343176  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2526  hypothetical protein  31.63 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.19758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7213  hypothetical protein  34.95 
 
 		 180 aa  71.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2648  hypothetical protein  35.8 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0118253  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2112  hypothetical protein  32.94 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7305  hypothetical protein  33.7 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1843  hypothetical protein  31.64 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000379282  normal  0.068852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4018  hypothetical protein  30.51 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.483907  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11744  hypothetical protein  30.23 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.213346  normal  0.501181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1069  hypothetical protein  33.68 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1542  hypothetical protein  32.64 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.272764  hitchhiker  0.00246606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10752  hypothetical protein  32.6 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000019473  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1401  hypothetical protein  31.18 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3545  hypothetical protein  32.77 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.266411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4394  hypothetical protein  34.86 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.487067  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5062  hypothetical protein  32.3 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0059  hypothetical protein  31.21 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2519  hypothetical protein  31.3 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.291648 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 437 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13807  hypothetical protein  27.59 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.280753  normal  0.497634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1118  hypothetical protein  31.15 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.581554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4984  hypothetical protein  30.57 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5365  hypothetical protein  30.57 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.561933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5072  hypothetical protein  30.57 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2309  hypothetical protein  29.56 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0901282  normal  0.039758 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2932  hypothetical protein  28.29 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02890  conserved hypothetical protein TIGR03086  28.4 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0915  hypothetical protein  28.12 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.649673  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5694  hypothetical protein  28.73 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195445 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0874  hypothetical protein  32.33 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1384  hypothetical protein  30.48 
 
 		 184 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132892  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0200  hypothetical protein  27.37 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.29432  normal  0.0560607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3933  hypothetical protein  31.11 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0576755  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4594  hypothetical protein  29.35 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.232846  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04730  conserved hypothetical protein TIGR03086  27.01 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.217314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3542  hypothetical protein  25.14 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6375  hypothetical protein  25.74 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2137  hypothetical protein  31.06 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112657 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2196  hypothetical protein  27.89 
 
 		 206 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582945  normal  0.0278946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2150  hypothetical protein  27.89 
 
 		 206 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0476  hypothetical protein  24.14 
 
 		 263 aa  41.2  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2350  hypothetical protein  27.53 
 
 		 187 aa  41.2  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>