More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5582 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5582  ABC transporter related  100 
 
 		 803 aa  1558    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0235423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1666  ABC transporter related  40.26 
 
 		 665 aa  431  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1595  ABC transporter related  40.41 
 
 		 670 aa  416  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.12327  normal  0.499354 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  30.21 
 
 		 628 aa  266  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  32.46 
 
 		 638 aa  266  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  31.73 
 
 		 663 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  31.18 
 
 		 585 aa  239  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  30.81 
 
 		 610 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3324  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  28.25 
 
 		 680 aa  229  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.51627  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  32.16 
 
 		 635 aa  226  1e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1233  ABC transporter, transmembrane region  51.79 
 
 		 652 aa  221  5e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  28.84 
 
 		 635 aa  221  6e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1994  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.1 
 
 		 965 aa  219  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.310969  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1392  ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  51.1 
 
 		 988 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.659485  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3174  heavy metal ABC transporter permease protein/ATP-binding protein/response regulator  51.1 
 
 		 988 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3046  heavy metal ABC transporter permease protein/ATP-binding protein/response regulator  51.1 
 
 		 988 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1016  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.1 
 
 		 988 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1304  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.1 
 
 		 988 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0659  ABC transporter, ATP-binding protein  48.68 
 
 		 594 aa  218  4e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000175742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2280  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 		 988 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  46.8 
 
 		 612 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0210  ABC transporter related protein  50.45 
 
 		 785 aa  215  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.926973  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  48.94 
 
 		 648 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0482  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  48.2 
 
 		 627 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  51.79 
 
 		 603 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.32 
 
 		 589 aa  215  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  50.45 
 
 		 606 aa  214  3.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6032  response regulator receiver protein  49.12 
 
 		 933 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.340327  normal  0.371985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  46 
 
 		 612 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1388  response regulator receiver protein  48.67 
 
 		 921 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251284  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6441  response regulator receiver protein  48.67 
 
 		 933 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0603753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0140  ABC transporter related  50.24 
 
 		 672 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1492  ABC transporter related  50.67 
 
 		 652 aa  214  7e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.723174  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  45.61 
 
 		 598 aa  213  7.999999999999999e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  49.37 
 
 		 594 aa  213  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  50.66 
 
 		 634 aa  213  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5208  ABC transporter related  50.91 
 
 		 663 aa  212  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670373  normal  0.309398 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  46.86 
 
 		 631 aa  212  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0839  ABC transporter related  50.67 
 
 		 590 aa  212  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000691959  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2194  ABC transporter related  49.34 
 
 		 624 aa  212  2e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.290194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  48.89 
 
 		 626 aa  212  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4741  ABC transporter related  50.91 
 
 		 662 aa  212  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.616952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5655  response regulator receiver protein  48.67 
 
 		 935 aa  211  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  46.4 
 
 		 592 aa  211  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0588  ABC transporter related  47.12 
 
 		 579 aa  210  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  49.11 
 
 		 651 aa  210  7e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0009  ABC transporter related  49.78 
 
 		 597 aa  210  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  45.78 
 
 		 468 aa  209  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2741  ABC transporter related  49.34 
 
 		 623 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  48.44 
 
 		 606 aa  210  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3368  ABC transporter related  48.66 
 
 		 655 aa  210  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00530466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  48.48 
 
 		 598 aa  210  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2102  ABC transporter related  49.34 
 
 		 623 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314001  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2714  ABC transporter related  49.34 
 
 		 623 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6403  response regulator receiver protein  48.23 
 
 		 936 aa  210  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.452757  normal  0.164839 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0151  ABC transporter related  50.45 
 
 		 595 aa  209  1e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.512349  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05528  ABC transporter (Eurofung)  48.2 
 
 		 721 aa  209  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649835  normal  0.920621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1927  ABC transporter related  50.45 
 
 		 640 aa  209  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161772  normal  0.0559282 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  43.24 
 
 		 597 aa  209  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  28.91 
 
 		 602 aa  209  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  47.62 
 
 		 642 aa  209  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5437  response regulator receiver protein  48.23 
 
 		 914 aa  209  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.04493 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  50.88 
 
 		 626 aa  209  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3356  ABC transporter related  49.09 
 
 		 594 aa  209  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0405132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2766  ABC transporter related  49.35 
 
 		 623 aa  209  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1175  ABC transporter related  47.03 
 
 		 625 aa  208  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02200  ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 		 577 aa  208  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5251  response regulator receiver protein  48.46 
 
 		 893 aa  208  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0456799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  45.82 
 
 		 582 aa  208  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1113  ABC transporter related  48.9 
 
 		 646 aa  208  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  44.89 
 
 		 582 aa  208  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  48.9 
 
 		 607 aa  207  4e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0682  ABC transporter related  43.22 
 
 		 606 aa  208  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  48.44 
 
 		 612 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0630  ABC transporter related  49.33 
 
 		 597 aa  208  4e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  48.44 
 
 		 612 aa  207  6e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2632  ABC transporter related  48.92 
 
 		 623 aa  207  6e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  47.95 
 
 		 636 aa  207  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0597  ABC transporter related  47.77 
 
 		 596 aa  207  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3526  ABC transporter related  48.64 
 
 		 598 aa  207  7e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00262032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  49.78 
 
 		 579 aa  207  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  45.96 
 
 		 630 aa  207  9e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0452  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  48.02 
 
 		 629 aa  206  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2094  ABC transporter related  48.18 
 
 		 661 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181859  normal  0.935873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  46.43 
 
 		 550 aa  206  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  50.67 
 
 		 642 aa  205  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1472  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.37 
 
 		 628 aa  205  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.868614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  44.19 
 
 		 572 aa  206  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  50.67 
 
 		 606 aa  206  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  48.03 
 
 		 597 aa  206  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  48.87 
 
 		 622 aa  205  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  48.89 
 
 		 598 aa  205  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6767  ABC transporter related  47.01 
 
 		 589 aa  205  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.406129  normal  0.504103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1023  ABC transporter related  46.93 
 
 		 625 aa  205  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.037611  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1765  putative multidrug export ATP-binding/permease protein  50.45 
 
 		 611 aa  204  4e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.193785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4394  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 906 aa  204  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0230097  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  48.09 
 
 		 607 aa  204  4e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6041  ABC transporter, fused ATPase and innermembrane subunits  48.91 
 
 		 623 aa  204  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  46.61 
 
 		 584 aa  204  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2270  ABC transporter related  36.94 
 
 		 619 aa  204  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.903332  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>