185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4778 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4778  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 		 335 aa  667    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7143  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  27.33 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0956909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5730  luciferase family protein  32.83 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.859618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2577  Luciferase-like monooxygenase  32.89 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1120  luciferase family protein  29.94 
 
 		 333 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4043  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.85 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0263182  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.56 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4257  Luciferase-like monooxygenase  29.02 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24190  methylenetetrahydromethanopterin reductase  31.14 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.88 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5169  Luciferase-like, subgroup  29.44 
 
 		 336 aa  69.7  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.840364  normal  0.74376 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4268  luciferase family protein  29.8 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.673509  normal  0.529068 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  31.9 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0223  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.41 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.71 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1433  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.34 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.32144  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2862  Luciferase-like monooxygenase  37.72 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.628513 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.45 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4162  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.19 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.945898  normal  0.398456 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5752  luciferase family protein  30.51 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1871  luciferase family protein  32.17 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  31.67 
 
 		 343 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4864  luciferase family protein  32.17 
 
 		 282 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0725656  normal  0.117116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0086  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.33 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  32.75 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2098  Luciferase-like monooxygenase  29.94 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0305503  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  29.17 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  32.42 
 
 		 346 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3627  dehydrogenase  26.32 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10971  oxidoreductase  32.17 
 
 		 290 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0930752  normal  0.92148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2560  luciferase family protein  28.16 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000351517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  33.12 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3874  putative F420-dependent oxidoreductase  33.78 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  31.65 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0149885  normal  0.0262364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0967  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  30 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3294  luciferase family protein  31.61 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0737378  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0358  luciferase family protein  31.61 
 
 		 348 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4412  luciferase-like  30.59 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4324  luciferase-like protein  30.77 
 
 		 282 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0369  luciferase-like protein  35.11 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0907338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4410  luciferase family protein  30.77 
 
 		 282 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4704  luciferase family protein  30.77 
 
 		 282 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.405552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  29.67 
 
 		 327 aa  53.5  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0339  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.77 
 
 		 314 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1582  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.61 
 
 		 349 aa  53.1  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2780  luciferase family protein  27.01 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000437181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.16 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  25.85 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3725  luciferase family protein  33.58 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.290268  normal  0.0173075 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.96 
 
 		 333 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1199  luciferase family protein  30.77 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.12 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  36.84 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3318  luciferase family protein  36.15 
 
 		 346 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3573  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.88 
 
 		 337 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0487  luciferase family protein  29.05 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.372075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4462  luciferase-like  38.2 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.119072  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3904  luciferase family protein  38.2 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  29.89 
 
 		 352 aa  50.1  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4328  luciferase family protein  28.34 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3623  luciferase family protein  38.2 
 
 		 319 aa  50.4  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.378915 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2188  flavin-dependent oxidoreductase  38.2 
 
 		 319 aa  49.7  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0396  Luciferase-like monooxygenase  26.32 
 
 		 288 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.98 
 
 		 339 aa  49.7  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.82 
 
 		 333 aa  49.7  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2439  Luciferase-like monooxygenase  28.65 
 
 		 322 aa  49.3  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000186799  normal  0.0206067 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.89 
 
 		 332 aa  49.3  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4163  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.56 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.6036  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3462  Luciferase-like, subgroup  32.12 
 
 		 281 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.22909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3836  luciferase-like protein  30.82 
 
 		 364 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3279  luciferase family protein  41.11 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1677  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.57 
 
 		 325 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.925316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2701  Luciferase-like monooxygenase  29.9 
 
 		 328 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00906967  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  33.74 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2322  luciferase family protein  35.11 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6808  luciferase family protein  29.01 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3798  luciferase-like monooxygenase  41.11 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  0.318951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4851  Luciferase-like monooxygenase  28.75 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0116346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1541  luciferase-like  30.57 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1828  Luciferase-like monooxygenase  28.28 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0959568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  32.77 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1687  Luciferase-like monooxygenase  31.84 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10133  F420-dependent glucose-6-phosphate dehydrogenase fgd2  29.82 
 
 		 360 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4193  hypothetical protein  36.14 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.598863  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2473  luciferase family protein  31.11 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  32.26 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  29.78 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49090  hypothetical protein  36.14 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4078  luciferase family protein  34.38 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.317149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4525  luciferase-like protein  26.29 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.3 
 
 		 320 aa  47.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4755  luciferase family protein  28.67 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  30.3 
 
 		 357 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  23.91 
 
 		 341 aa  47.4  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  26.81 
 
 		 345 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3354  luciferase family protein  27.15 
 
 		 383 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.698383  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.95 
 
 		 320 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.95 
 
 		 320 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4198  Luciferase-like, subgroup  30.17 
 
 		 302 aa  47  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5311  luciferase-like protein  33.33 
 
 		 283 aa  47  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>