234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4229 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4229  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 408 aa  827    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3482  beta-lactamase domain-containing protein  44.91 
 
 		 414 aa  306  6e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.140065 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1870  beta-lactamase domain-containing protein  31.68 
 
 		 591 aa  170  3e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2355  beta-lactamase domain protein  25.06 
 
 		 444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0271  beta-lactamase domain protein  26.75 
 
 		 425 aa  122  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000349222  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1369  beta-lactamase domain-containing protein  25.78 
 
 		 595 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.923314  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1748  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 		 441 aa  106  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00707549  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0276  beta-lactamase domain-containing protein  26.15 
 
 		 441 aa  106  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1231  beta-lactamase domain-containing protein  21.53 
 
 		 670 aa  89.7  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2308  beta-lactamase domain protein  22.22 
 
 		 655 aa  89.7  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000745955  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1281  metallo-beta-lactamase family protien  28.78 
 
 		 635 aa  87.8  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.682489  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6835  beta-lactamase domain protein  25.92 
 
 		 607 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54700  putative beta-lactamase  26.45 
 
 		 658 aa  87  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.345329  hitchhiker  0.000000584765 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4780  putative beta-lactamase  26.24 
 
 		 658 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.563062  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1373  beta-lactamase domain-containing protein  24.17 
 
 		 417 aa  86.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4962  beta-lactamase domain protein  24.31 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6079  Beta-lactamase-like  25.38 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4267  beta-lactamase domain-containing protein  23.04 
 
 		 696 aa  84  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2280  Beta-lactamase-like  25.06 
 
 		 655 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3514  beta-lactamase domain protein  21.66 
 
 		 657 aa  82.8  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000285828  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2379  beta-lactamase domain protein  25.32 
 
 		 657 aa  82  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5160  alkyl sulfatase-like protein  23.61 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.759433  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1129  beta-lactamase domain protein  25.25 
 
 		 629 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3379  Beta-lactamase-like  22.53 
 
 		 653 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361025  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1246  beta-lactamase domain-containing protein  22.95 
 
 		 663 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.12615  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  24.31 
 
 		 677 aa  80.9  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0357  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.13 
 
 		 617 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2634  beta-lactamase domain-containing protein  24.35 
 
 		 659 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3706  Beta-lactamase-like  24.8 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0380  beta-lactamase domain-containing protein  23.1 
 
 		 631 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6441  beta-lactamase domain-containing protein  24.29 
 
 		 611 aa  77.4  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.468139 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5415  putative alkyl sulfatase  22.08 
 
 		 662 aa  77  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2904  beta-lactamase domain-containing protein  22.38 
 
 		 661 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0995252  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3016  beta-lactamase-like protein  23.89 
 
 		 653 aa  76.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.401526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3060  beta-lactamase domain-containing protein  22.17 
 
 		 651 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00600149  normal  0.01476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0912  beta-lactamase domain-containing protein  22.17 
 
 		 651 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.502221 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5402  putative alkyl sulfatase  22.11 
 
 		 660 aa  74.3  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1726  beta-lactamase domain-containing protein  22.75 
 
 		 683 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1114  beta-lactamase domain-containing protein  20.98 
 
 		 658 aa  73.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.063036  hitchhiker  0.000000308337 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3908  beta-lactamase domain protein  23.48 
 
 		 661 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3943  beta-lactamase domain-containing protein  23.48 
 
 		 661 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4549  metallo-beta-lactamase family protein  23.85 
 
 		 661 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.30993  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03955  predicted alkyl sulfatase  23.48 
 
 		 661 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1606  metallo-beta-lactamase superfamily protein  21.21 
 
 		 663 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0702  beta-lactamase-like protein  21.88 
 
 		 673 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0631521 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03915  hypothetical protein  23.48 
 
 		 661 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2981  beta-lactamase domain-containing protein  24.37 
 
 		 654 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1392  alkyl/aryl-sulfatase BDS1  21.58 
 
 		 655 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000420171 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1423  beta-lactamase domain-containing protein  21 
 
 		 662 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1292  beta-lactamase domain protein  21.66 
 
 		 656 aa  72  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000152038  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1429  beta-lactamase domain-containing protein  21 
 
 		 662 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2925  beta-lactamase domain protein  21 
 
 		 662 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1097  beta-lactamase domain protein  25.42 
 
 		 609 aa  70.9  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.761459 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1459  beta-lactamase domain-containing protein  20.75 
 
 		 662 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5593  metallo-beta-lactamase family protein  23.23 
 
 		 661 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1714  metallo-beta-lactamase family protein  21.71 
 
 		 658 aa  70.5  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0306095 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0663  beta-lactamase-like protein  20.88 
 
 		 667 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3112  beta-lactamase domain-containing protein  21 
 
 		 659 aa  70.1  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0118519  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1715  beta-lactamase domain-containing protein  25.62 
 
 		 654 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0756125  normal  0.0757403 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4641  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.55 
 
 		 661 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4329  metallo-beta-lactamase superfamily protein  23.55 
 
 		 661 aa  69.7  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4821  beta-lactamase domain protein  24.58 
 
 		 661 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415697  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13794  hydrolase  25.14 
 
 		 626 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.277283 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  30.65 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3181  hypothetical protein  24.85 
 
 		 700 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  27.24 
 
 		 308 aa  67  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4972  beta-lactamase-like protein  23.4 
 
 		 625 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5060  beta-lactamase domain-containing protein  23.4 
 
 		 625 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1666  metallo-beta-lactamase family protein  21.79 
 
 		 680 aa  67  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1084  beta-lactamase domain-containing protein  20.65 
 
 		 701 aa  67  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0107991  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4145  Beta-lactamase-like  24.89 
 
 		 663 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.951787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0818  beta-lactamase-like  29.57 
 
 		 645 aa  66.6  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.944834  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1202  beta-lactamase domain protein  23.58 
 
 		 648 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0128725  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5162  beta-lactamase domain protein  25.1 
 
 		 636 aa  66.2  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0511  alkyl sulfatase  23.33 
 
 		 653 aa  65.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.752012 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5353  beta-lactamase domain-containing protein  23.17 
 
 		 625 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  28.69 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  28.27 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2149  beta-lactamase-like protein  25 
 
 		 657 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  29.75 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  27.31 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0311  hypothetical protein  20.9 
 
 		 660 aa  65.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  27.54 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4256  beta-lactamase domain-containing protein  21.7 
 
 		 669 aa  64.7  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3184  metallo-beta-lactamase superfamily protein  20.54 
 
 		 666 aa  63.5  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.326866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3957  beta-lactamase-like  19.74 
 
 		 691 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426121  normal  0.435242 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3696  beta-lactamase domain-containing protein  23.29 
 
 		 653 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3302  beta-lactamase domain-containing protein  22.22 
 
 		 673 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.333172  hitchhiker  0.000000579682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1017  beta-lactamase-like  22.32 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.751913  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5606  beta-lactamase domain-containing protein  23.48 
 
 		 641 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0740019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  28.27 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1919  beta-lactamase domain protein  28.81 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000566164  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1270  beta-lactamase-like  20.96 
 
 		 654 aa  61.6  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0378122  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2780  hypothetical protein  21.87 
 
 		 621 aa  61.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.37616 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  25.17 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0744  beta-lactamase domain protein  26.61 
 
 		 628 aa  60.8  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  27.54 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5539  beta-lactamase domain-containing protein  21.43 
 
 		 657 aa  60.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.760303  hitchhiker  0.000561817 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0580  beta-lactamase domain-containing protein  24.14 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1201  beta-lactamase domain-containing protein  23.91 
 
 		 625 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.972683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>