More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3359 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  40.93 
 
 		 1806 aa  852    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  36.49 
 
 		 3101 aa  673    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  40.53 
 
 		 3158 aa  637    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  44.57 
 
 		 2111 aa  665    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  34.06 
 
 		 1939 aa  708    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  41.27 
 
 		 1876 aa  662    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3611  Beta-ketoacyl synthase  42.91 
 
 		 1832 aa  646    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.461901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11205  polyketide beta-ketoacyl synthase pks4  42.89 
 
 		 2101 aa  1398    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  33.78 
 
 		 3930 aa  811    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  36.8 
 
 		 2333 aa  712    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  35.31 
 
 		 2719 aa  929    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  38.65 
 
 		 2890 aa  738    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  36.78 
 
 		 3176 aa  1024    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  36.44 
 
 		 4607 aa  889    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  39.05 
 
 		 7279 aa  678    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  36.31 
 
 		 2604 aa  944    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  41.46 
 
 		 1827 aa  875    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  38.35 
 
 		 2232 aa  1249    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.5 
 
 		 1874 aa  681    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  40.97 
 
 		 1656 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  39.26 
 
 		 1144 aa  639    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 		 7110 aa  657    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  34.36 
 
 		 2367 aa  805    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  47.82 
 
 		 1822 aa  703    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2029  Beta-ketoacyl synthase  44.63 
 
 		 1263 aa  683    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0480562  normal  0.193313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4853  Acyl transferase  46.65 
 
 		 1819 aa  643    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  44.4 
 
 		 1823 aa  643    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0991  acyl transferase region  49.1 
 
 		 1076 aa  784    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  39.12 
 
 		 7210 aa  647    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  31.76 
 
 		 3111 aa  662    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  37.93 
 
 		 2108 aa  658    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  37.68 
 
 		 2162 aa  694    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  39.03 
 
 		 2136 aa  663    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  34.33 
 
 		 3693 aa  933    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12947  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsC  40.48 
 
 		 2188 aa  1256    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  44.78 
 
 		 1520 aa  689    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2834  beta-ketoacyl synthase  47.05 
 
 		 1190 aa  679    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  46.18 
 
 		 1580 aa  662    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  43.7 
 
 		 2085 aa  1468    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  38.23 
 
 		 1704 aa  663    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12954  multi-functional membrane-associated mycocerosic acid synthase mas  43.27 
 
 		 2111 aa  1443    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  35.77 
 
 		 3449 aa  650    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 		 3080 aa  880    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  38 
 
 		 2230 aa  1171    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  37.92 
 
 		 1832 aa  724    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  35.14 
 
 		 1966 aa  696    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13859  polyketide synthase pks2  42.87 
 
 		 2126 aa  1443    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  37.11 
 
 		 2225 aa  1115    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  34.33 
 
 		 3693 aa  933    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  44.78 
 
 		 1520 aa  689    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2878  beta-ketoacyl synthase  47.05 
 
 		 1190 aa  679    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.696765  normal  0.141108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  46.18 
 
 		 1580 aa  662    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  43.7 
 
 		 2085 aa  1468    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  38.23 
 
 		 1704 aa  663    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  34.74 
 
 		 3676 aa  924    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  38.78 
 
 		 1867 aa  639    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  36.48 
 
 		 3696 aa  947    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.31 
 
 		 1822 aa  660    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  41.46 
 
 		 1805 aa  867    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  45.75 
 
 		 1812 aa  684    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  44.76 
 
 		 1581 aa  648    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  39.33 
 
 		 1828 aa  682    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  100 
 
 		 2220 aa  4328    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11560  polyketide synthase pks5  43.13 
 
 		 2108 aa  1406    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  34.33 
 
 		 3702 aa  932    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  46.02 
 
 		 1537 aa  706    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2865  beta-ketoacyl synthase  47.05 
 
 		 1190 aa  677    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  46.07 
 
 		 1580 aa  654    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  43.74 
 
 		 2085 aa  1467    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  38.02 
 
 		 1704 aa  659    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  40.49 
 
 		 2966 aa  648    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.7 
 
 		 1804 aa  699    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  37.18 
 
 		 3508 aa  692    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  34.45 
 
 		 3679 aa  895    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  39.16 
 
 		 1587 aa  635  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  36.21 
 
 		 2277 aa  634  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3393  beta-ketoacyl synthase  44.37 
 
 		 1577 aa  632  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0165666  normal  0.219478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  38.76 
 
 		 3408 aa  629  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  35.21 
 
 		 1835 aa  624  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  37.98 
 
 		 1789 aa  625  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  37.84 
 
 		 2126 aa  624  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  34.67 
 
 		 3645 aa  622  1e-176  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  31.9 
 
 		 2462 aa  623  1e-176  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  37.64 
 
 		 4151 aa  622  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3852  beta-ketoacyl synthase  36.11 
 
 		 1744 aa  620  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.534518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  37.03 
 
 		 3494 aa  621  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  39.66 
 
 		 2020 aa  618  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  38.74 
 
 		 6768 aa  620  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  39.76 
 
 		 5255 aa  615  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  36.89 
 
 		 1820 aa  612  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  41.07 
 
 		 3355 aa  605  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  39.3 
 
 		 3493 aa  602  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  30.31 
 
 		 2551 aa  600  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  43.07 
 
 		 1584 aa  603  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  38.75 
 
 		 2846 aa  600  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.38 
 
 		 3874 aa  601  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.8 
 
 		 2551 aa  599  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  35.16 
 
 		 1559 aa  598  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3098  6-deoxyerythronolide-B synthase  31.21 
 
 		 1349 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.92514 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.87 
 
 		 1559 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>