99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2564 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2564  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000782255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2727  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  42.73 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000895401  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3385  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  34.62 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2258  type I restriction-modification system, M subunit  29.25 
 
 		 891 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0505  type I restriction-modification system, M subunit  30.37 
 
 		 524 aa  57.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2421  type I restriction-modification system, M subunit  30.2 
 
 		 526 aa  55.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.636498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  26.92 
 
 		 522 aa  54.7  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1499  type I restriction-modification system, M subunit  29.84 
 
 		 521 aa  54.7  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.1762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  32.67 
 
 		 808 aa  52.8  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1412  type I restriction-modification system, M subunit  24.19 
 
 		 517 aa  52.4  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.446719  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2725  type I restriction-modification system, M subunit  28.78 
 
 		 525 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  32.08 
 
 		 527 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0079  type I restriction-modification system, M subunit  26.92 
 
 		 520 aa  52.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2274  type I restriction-modification system DNA methylase  28.86 
 
 		 527 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1992  N-6 DNA methylase  29.91 
 
 		 479 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0409108  normal  0.188366 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5209  hypothetical protein  27.86 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.767147  normal  0.342725 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1896  N-6 DNA methylase  28.68 
 
 		 511 aa  50.8  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.836046  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4055  hypothetical protein  28.47 
 
 		 188 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1850  type I restriction-modification system, M subunit  28.33 
 
 		 489 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1953  type I restriction-modification system, M subunit  25.2 
 
 		 523 aa  50.8  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.710513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3470  type I restriction-modification system, M subunit  25.2 
 
 		 523 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3056  type I restriction-modification system, M subunit  27.34 
 
 		 515 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2182  type I restriction-modification system, M subunit  28.57 
 
 		 527 aa  50.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  29.6 
 
 		 495 aa  50.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  32.97 
 
 		 499 aa  49.7  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  33.96 
 
 		 847 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1072  type I restriction-modification system, M subunit  25.27 
 
 		 815 aa  49.3  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3954  type I restriction-modification system, M subunit  27.2 
 
 		 525 aa  49.3  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1104  type I restriction-modification system, M subunit  27.59 
 
 		 519 aa  49.3  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0697  domain of unknown function DUF1738  31.25 
 
 		 653 aa  48.9  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  30.34 
 
 		 574 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  29.91 
 
 		 574 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  28.18 
 
 		 574 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  30.19 
 
 		 496 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  31.97 
 
 		 516 aa  48.5  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4014  N-6 DNA methylase  27.34 
 
 		 816 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2253  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 523 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  34.23 
 
 		 523 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  31.87 
 
 		 499 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  28.21 
 
 		 505 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  28.48 
 
 		 633 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  33.33 
 
 		 810 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0821  type I restriction-modification system, M subunit  23.68 
 
 		 515 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  30.3 
 
 		 522 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5009  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  28.23 
 
 		 860 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235997 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  28.7 
 
 		 799 aa  47.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2925  N-6 DNA methylase  30.33 
 
 		 680 aa  47  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4393  type I restriction-modification system, M subunit  24.59 
 
 		 515 aa  47  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  30 
 
 		 528 aa  46.6  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2616  N-6 DNA methylase  36.62 
 
 		 492 aa  46.6  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0464512 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0508  type I restriction-modification system, M subunit  24.18 
 
 		 814 aa  46.2  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0563  type I restriction-modification system, M subunit  29.9 
 
 		 908 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0170311  hitchhiker  0.0000000000000803096 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  28.12 
 
 		 587 aa  46.2  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  28.32 
 
 		 496 aa  46.2  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  29.1 
 
 		 504 aa  45.8  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  32.93 
 
 		 500 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  30.09 
 
 		 505 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  31.82 
 
 		 501 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  28.85 
 
 		 554 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4043  N-6 DNA methylase  29.21 
 
 		 824 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3108  N-6 DNA methylase  28.15 
 
 		 610 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1097  N-6 DNA methylase  31.25 
 
 		 513 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1888  type I restriction-modification system, M subunit  30.33 
 
 		 526 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  24.72 
 
 		 505 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1215  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  27.12 
 
 		 462 aa  45.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1565  N-6 DNA methylase  28.47 
 
 		 519 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.236926  unclonable  0.0000184799 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3910  N-6 DNA methylase  27.45 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  32.38 
 
 		 814 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  31.82 
 
 		 500 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  32.14 
 
 		 490 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0103  N-6 DNA methylase  32.18 
 
 		 493 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03120  type I restriction system adenine methylase HsdM  27.78 
 
 		 856 aa  43.9  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0118515  hitchhiker  7.147270000000001e-18 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0925  type I restriction-modification system, M subunit  29.69 
 
 		 535 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000528021  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1310  N-6 DNA methylase  35.71 
 
 		 489 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0753  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.05 
 
 		 534 aa  43.9  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  34.15 
 
 		 809 aa  43.9  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1959  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.19 
 
 		 855 aa  43.5  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  38.46 
 
 		 506 aa  43.5  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1177  XRE family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 519 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.602323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  25.24 
 
 		 501 aa  43.5  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0084  N-6 DNA methylase  38.46 
 
 		 495 aa  43.9  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  26.13 
 
 		 585 aa  43.5  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  29.07 
 
 		 510 aa  43.5  0.005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  34.57 
 
 		 810 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  30.59 
 
 		 493 aa  43.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  30.1 
 
 		 549 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  27.64 
 
 		 500 aa  43.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  31.25 
 
 		 814 aa  43.1  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1595  hypothetical protein  29.13 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  29.75 
 
 		 498 aa  42.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  30.63 
 
 		 351 aa  42.7  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  30.39 
 
 		 505 aa  42.7  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5237  hypothetical protein  29.13 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.924497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  30.36 
 
 		 350 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  27.64 
 
 		 498 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  35.38 
 
 		 489 aa  42.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  32.31 
 
 		 477 aa  42.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  33.33 
 
 		 481 aa  42.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3269  type I restriction-modification system specificity subunit  29 
 
 		 498 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.266741  normal  0.0966647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>