More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1013 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1013  glycine hydroxymethyltransferase  100 
 
 		 418 aa  847    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.239526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3717  serine hydroxymethyltransferase  90.19 
 
 		 418 aa  753    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.982412  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1661  Glycine hydroxymethyltransferase  73.67 
 
 		 421 aa  622  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18300  serine hydroxymethyltransferase  64.45 
 
 		 425 aa  562  1.0000000000000001e-159  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0624646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1008  serine hydroxymethyltransferase  58.82 
 
 		 413 aa  513  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1060  serine hydroxymethyltransferase  58.48 
 
 		 415 aa  513  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.328734  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1881  serine hydroxymethyltransferase  59.46 
 
 		 415 aa  508  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.662029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1160  serine hydroxymethyltransferase  58.97 
 
 		 415 aa  504  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.215239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3102  serine hydroxymethyltransferase  58.72 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00573934  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2184  serine hydroxymethyltransferase  57.46 
 
 		 410 aa  502  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1607  serine hydroxymethyltransferase  58.48 
 
 		 415 aa  501  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2768  Glycine hydroxymethyltransferase  59.07 
 
 		 418 aa  499  1e-140  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1895  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 410 aa  499  1e-140  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1241  glycine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 414 aa  497  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1605  serine hydroxymethyltransferase  57.74 
 
 		 415 aa  495  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0938811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0282  serine hydroxymethyltransferase  59.08 
 
 		 427 aa  498  1e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1932  serine hydroxymethyltransferase  58.23 
 
 		 415 aa  496  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000167671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1058  serine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 		 412 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00108739  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3162  serine hydroxymethyltransferase  58.82 
 
 		 413 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.243328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1680  serine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 		 412 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0499  serine hydroxymethyltransferase  59.22 
 
 		 417 aa  493  9.999999999999999e-139  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.757005  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0756  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 		 425 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1748  serine hydroxymethyltransferase  58.05 
 
 		 413 aa  489  1e-137  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.207733  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0782  serine hydroxymethyltransferase  57.14 
 
 		 425 aa  490  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16130  Glycine hydroxymethyltransferase  57.78 
 
 		 412 aa  490  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1649  serine hydroxymethyltransferase  61.11 
 
 		 434 aa  488  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2858  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 412 aa  489  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193114 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2147  glycine hydroxymethyltransferase  58.77 
 
 		 415 aa  484  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4826  serine hydroxymethyltransferase  58.42 
 
 		 417 aa  487  1e-136  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000020982  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0031  Glycine hydroxymethyltransferase  57.95 
 
 		 420 aa  486  1e-136  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2392  glycine hydroxymethyltransferase  56.83 
 
 		 415 aa  483  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3313  serine hydroxymethyltransferase  58.05 
 
 		 411 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000728494  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0686  serine hydroxymethyltransferase  55.64 
 
 		 424 aa  479  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.138461  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4898  glycine hydroxymethyltransferase  54.99 
 
 		 427 aa  478  1e-134  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2312  serine hydroxymethyltransferase  57.49 
 
 		 412 aa  478  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.297378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4802  serine hydroxymethyltransferase  57.63 
 
 		 427 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0810  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 414 aa  480  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.210619  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3835  serine hydroxymethyltransferase  56.34 
 
 		 413 aa  474  1e-133  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00110618  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1025  serine hydroxymethyltransferase  55.47 
 
 		 422 aa  476  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1442  serine hydroxymethyltransferase  55.83 
 
 		 416 aa  478  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0253  serine hydroxymethyltransferase  56.86 
 
 		 431 aa  475  1e-133  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.604159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0071  Glycine hydroxymethyltransferase  59.01 
 
 		 417 aa  472  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.30135  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2187  serine hydroxymethyltransferase  55.94 
 
 		 412 aa  473  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5438  serine hydroxymethyltransferase  56.07 
 
 		 413 aa  474  1e-132  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2076  serine hydroxymethyltransferase  57.18 
 
 		 427 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.745833  hitchhiker  0.000706319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4177  serine hydroxymethyltransferase  55.77 
 
 		 413 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000212054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2149  serine hydroxymethyltransferase  55.94 
 
 		 412 aa  473  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3425  serine hydroxymethyltransferase  57.32 
 
 		 412 aa  472  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5441  serine hydroxymethyltransferase  55.85 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000358223  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2082  serine hydroxymethyltransferase  56.48 
 
 		 419 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000584892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5015  serine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 		 414 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000468931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5494  serine hydroxymethyltransferase  55.83 
 
 		 413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000315106  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0851  glycine hydroxymethyltransferase  57.6 
 
 		 419 aa  468  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0407045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2836  serine hydroxymethyltransferase  57.21 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.359128  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2744  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5513  serine hydroxymethyltransferase  55.58 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000594889  unclonable  1.27286e-25 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2928  serine hydroxymethyltransferase  56.97 
 
 		 417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0469  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 474 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996315  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24721  serine hydroxymethyltransferase  57.35 
 
 		 424 aa  468  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2733  serine hydroxymethyltransferase  57.49 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5407  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 413 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.91777e-61 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0085  serine hydroxymethyltransferase  54.92 
 
 		 422 aa  468  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5165  serine hydroxymethyltransferase  55.75 
 
 		 414 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00104225  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4998  serine hydroxymethyltransferase  55.75 
 
 		 414 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  9.16492e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0207  serine hydroxymethyltransferase  55.88 
 
 		 427 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2091  serine hydroxymethyltransferase  55.88 
 
 		 429 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5558  serine hydroxymethyltransferase  55.61 
 
 		 413 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000129833  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0209  serine hydroxymethyltransferase  55.88 
 
 		 427 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1377  glycine hydroxymethyltransferase  57 
 
 		 411 aa  468  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5114  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 413 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000619413  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2327  Glycine hydroxymethyltransferase  55.15 
 
 		 413 aa  468  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000566706  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2660  serine hydroxymethyltransferase  54.15 
 
 		 425 aa  465  9.999999999999999e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3847  Glycine hydroxymethyltransferase  57.38 
 
 		 420 aa  461  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1719  serine hydroxymethyltransferase  54.17 
 
 		 412 aa  462  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2481  serine hydroxymethyltransferase  55.01 
 
 		 431 aa  461  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.938329  normal  0.172432 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02801  serine hydroxymethyltransferase  52.07 
 
 		 423 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.632622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1264  serine hydroxymethyltransferase  56.86 
 
 		 426 aa  464  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1389  Glycine hydroxymethyltransferase  57.99 
 
 		 427 aa  463  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000692081  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8588  serine hydroxymethyltransferase  55.4 
 
 		 420 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1678  serine hydroxymethyltransferase  57.38 
 
 		 426 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0169  serine hydroxymethyltransferase  54.11 
 
 		 422 aa  459  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0823  serine hydroxymethyltransferase  54.78 
 
 		 431 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0260  serine hydroxymethyltransferase  52.07 
 
 		 423 aa  458  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02841  serine hydroxymethyltransferase  53.19 
 
 		 416 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0354  serine hydroxymethyltransferase  55.88 
 
 		 431 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0389221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5930  glycine hydroxymethyltransferase  55.75 
 
 		 438 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.0770182 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03361  serine hydroxymethyltransferase  52.72 
 
 		 411 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.498926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0816  serine hydroxymethyltransferase  56.39 
 
 		 431 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.38724 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0920  serine hydroxymethyltransferase  55.05 
 
 		 427 aa  455  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455334  normal  0.413463 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1624  serine hydroxymethyltransferase  52.84 
 
 		 411 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21550  serine hydroxymethyltransferase  55.99 
 
 		 418 aa  456  1e-127  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.968894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0307  serine hydroxymethyltransferase  54.28 
 
 		 414 aa  456  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.209874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2432  serine hydroxymethyltransferase  57.07 
 
 		 412 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.139104  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2874  serine hydroxymethyltransferase  55.45 
 
 		 414 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3914  serine hydroxymethyltransferase  53.62 
 
 		 415 aa  455  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355744  normal  0.102127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0745  serine hydroxymethyltransferase  54.99 
 
 		 415 aa  457  1e-127  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2305  serine hydroxymethyltransferase  57.7 
 
 		 434 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02811  serine hydroxymethyltransferase  51.82 
 
 		 423 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1854  serine hydroxymethyltransferase  55.37 
 
 		 412 aa  455  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1463  glycine hydroxymethyltransferase  52.44 
 
 		 415 aa  456  1e-127  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>