More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3631 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3631  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  100 
 
 		 308 aa  634    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.331322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1099  branched-chain amino acid aminotransferase  83.71 
 
 		 307 aa  549  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3547  branched-chain amino acid aminotransferase  55.03 
 
 		 311 aa  345  4e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  53.09 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1863  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  50.85 
 
 		 305 aa  313  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2686  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 309 aa  307  1.0000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3552  branched-chain amino acid aminotransferase  48.14 
 
 		 307 aa  305  7e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3219  branched-chain amino acid aminotransferase  51.96 
 
 		 306 aa  305  8.000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000260212  normal  0.0812213 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0505  branched-chain amino acid aminotransferase  50 
 
 		 307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.527203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0360  branched-chain amino acid aminotransferase  50.34 
 
 		 310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.270933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0316  branched-chain amino acid aminotransferase  47.39 
 
 		 312 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0567  branched-chain amino acid aminotransferase  49.49 
 
 		 309 aa  301  7.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.83417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  48.83 
 
 		 306 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1109  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 		 312 aa  299  3e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  hitchhiker  0.00000000000646452  normal  0.0889333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  49.66 
 
 		 306 aa  299  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0065  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 307 aa  298  6e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0203  branched-chain amino acid aminotransferase  45.75 
 
 		 312 aa  298  8e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1550  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 		 309 aa  297  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0201  branched-chain amino acid aminotransferase  46.73 
 
 		 312 aa  297  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1962  branched-chain amino acid aminotransferase  49.67 
 
 		 308 aa  297  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.981543 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2143  branched-chain amino acid aminotransferase  49.15 
 
 		 306 aa  296  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1301  branched-chain amino acid aminotransferase  48.31 
 
 		 296 aa  295  5e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0767028 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0190  branched-chain amino acid aminotransferase  49.83 
 
 		 307 aa  295  6e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0264  branched-chain amino acid aminotransferase  45.81 
 
 		 312 aa  295  7e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  47.84 
 
 		 317 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0712  branched chain amino acid aminotransferase / branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  46.75 
 
 		 312 aa  295  9e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.157131  normal  0.557772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0182  branched-chain amino acid aminotransferase  46.08 
 
 		 312 aa  295  9e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0456  branched-chain amino acid aminotransferase  48.31 
 
 		 307 aa  294  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.940058  normal  0.29974 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2019  branched-chain amino acid aminotransferase  50.5 
 
 		 302 aa  294  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3280  branched-chain amino acid aminotransferase  47.97 
 
 		 307 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0686  branched-chain amino acid aminotransferase  47.97 
 
 		 307 aa  292  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.285453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0254  branched-chain amino acid aminotransferase  47 
 
 		 317 aa  291  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.925789  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0667  branched-chain amino acid aminotransferase  48.99 
 
 		 307 aa  291  9e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.541959 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2679  branched-chain amino acid aminotransferase  51.17 
 
 		 312 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5609  branched-chain amino acid aminotransferase  48.68 
 
 		 302 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.681734  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0947  branched-chain amino acid aminotransferase  46.49 
 
 		 309 aa  290  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.506532  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  48.65 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2268  branched-chain amino acid aminotransferase  49.5 
 
 		 307 aa  288  7e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0660  branched-chain amino acid aminotransferase  47.3 
 
 		 307 aa  288  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.256122  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2660  branched-chain amino acid aminotransferase  48.31 
 
 		 307 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2020  branched-chain amino acid aminotransferase  48.31 
 
 		 307 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2631  branched-chain amino acid aminotransferase  48.31 
 
 		 307 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.66412  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0034  branched-chain amino acid aminotransferase  46.96 
 
 		 307 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0834  branched-chain amino acid aminotransferase  46.96 
 
 		 307 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0293  branched-chain amino acid aminotransferase  46.96 
 
 		 307 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2421  branched-chain amino acid aminotransferase  46.96 
 
 		 307 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0992  branched-chain amino acid aminotransferase  46.96 
 
 		 307 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0830  branched-chain amino acid aminotransferase  46.96 
 
 		 307 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  45.48 
 
 		 307 aa  287  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2934  branched-chain amino acid aminotransferase  47.65 
 
 		 339 aa  286  2e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0588  branched-chain amino acid aminotransferase  46.96 
 
 		 307 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  48.5 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4443  branched-chain amino acid aminotransferase  49.19 
 
 		 307 aa  286  4e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5748  branched-chain amino acid aminotransferase  45.48 
 
 		 307 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  45.15 
 
 		 307 aa  286  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0353  branched-chain amino acid aminotransferase  45.15 
 
 		 304 aa  285  5e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.733524  normal  0.170926 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  48.5 
 
 		 304 aa  285  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  48.17 
 
 		 304 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66260  branched-chain amino acid aminotransferase  45.15 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2475  branched-chain amino acid aminotransferase  45.28 
 
 		 313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2344  branched-chain amino acid aminotransferase  48.14 
 
 		 306 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  48.31 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  48.31 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  47.02 
 
 		 307 aa  283  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0140  branched-chain amino acid aminotransferase  48.14 
 
 		 308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0506  branched-chain amino acid aminotransferase  45.48 
 
 		 316 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309351  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  46.84 
 
 		 307 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002039  branched-chain amino acid aminotransferase  48.83 
 
 		 312 aa  281  7.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1209  branched-chain amino acid aminotransferase  46.94 
 
 		 306 aa  281  9e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00412  branched-chain amino acid aminotransferase  48.49 
 
 		 312 aa  281  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3774  branched-chain amino acid aminotransferase  47.12 
 
 		 308 aa  281  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.694412  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0607  branched-chain amino acid aminotransferase  48.58 
 
 		 303 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000582891  decreased coverage  0.00306589 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  46.26 
 
 		 308 aa  280  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0578  branched-chain amino acid aminotransferase  45.82 
 
 		 307 aa  280  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0382856 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  47.49 
 
 		 319 aa  279  4e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  46.94 
 
 		 307 aa  279  4e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1869  branched-chain amino acid aminotransferase  44.74 
 
 		 303 aa  279  5e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000706765  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4206  branched-chain amino acid aminotransferase  46.6 
 
 		 309 aa  277  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.884547  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4232  branched-chain amino acid aminotransferase  46.6 
 
 		 309 aa  277  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.583001  normal  0.603299 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4150  branched-chain amino acid aminotransferase  46.6 
 
 		 309 aa  277  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4136  branched-chain amino acid aminotransferase  46.6 
 
 		 309 aa  277  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5204  branched-chain amino acid aminotransferase  46.6 
 
 		 309 aa  277  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3987  branched-chain amino acid aminotransferase  46.6 
 
 		 309 aa  277  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4281  branched-chain amino acid aminotransferase  46.6 
 
 		 309 aa  277  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  44.41 
 
 		 303 aa  278  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  44.63 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0549  branched-chain amino acid aminotransferase  45.39 
 
 		 303 aa  277  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000680418  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0716  branched-chain amino acid aminotransferase  45.72 
 
 		 303 aa  277  2e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.470563  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  45.64 
 
 		 306 aa  277  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03648  branched-chain amino acid aminotransferase  46.28 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00137757  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03597  hypothetical protein  46.28 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4293  branched-chain amino acid aminotransferase  46.86 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4234  branched-chain amino acid aminotransferase  46.86 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  46.49 
 
 		 304 aa  276  4e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1601  branched-chain amino acid aminotransferase  44.41 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.720294 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4128  branched-chain amino acid aminotransferase  46.86 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4185  branched-chain amino acid aminotransferase  46.86 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  47.16 
 
 		 307 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  46.6 
 
 		 307 aa  275  6e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2349  branched-chain amino acid aminotransferase  46.31 
 
 		 306 aa  275  6e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.888959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>