116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2723 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2723  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  297  4e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.979081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0536  hypothetical protein  71.65 
 
 		 279 aa  184  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.868525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1614  hypothetical protein  72.97 
 
 		 280 aa  171  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1840  hypothetical protein  66.39 
 
 		 290 aa  168  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.308832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4399  hypothetical protein  63.08 
 
 		 252 aa  167  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3635  hypothetical protein  71.56 
 
 		 133 aa  164  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0569  hypothetical protein  65.25 
 
 		 142 aa  161  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2259  hypothetical protein  75.96 
 
 		 288 aa  155  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328838  hitchhiker  0.00516656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7203  hypothetical protein  68.14 
 
 		 306 aa  149  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0266  hypothetical protein  58.62 
 
 		 279 aa  142  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0308  hypothetical protein  66.33 
 
 		 277 aa  142  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.793263  hitchhiker  0.00013029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3083  hypothetical protein  68.04 
 
 		 182 aa  141  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5110  protein of unknown function DUF574  60.55 
 
 		 279 aa  135  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.772993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6903  hypothetical protein  61.61 
 
 		 268 aa  134  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6750  hypothetical protein  61.17 
 
 		 268 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1954  protein of unknown function DUF574  59.29 
 
 		 273 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128265  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0336  protein of unknown function DUF574  55.96 
 
 		 266 aa  131  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4001  protein of unknown function DUF574  58.1 
 
 		 271 aa  130  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115855  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1644  hypothetical protein  57.69 
 
 		 333 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0287  protein of unknown function DUF574  55.56 
 
 		 275 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1585  protein of unknown function DUF574  56.07 
 
 		 262 aa  127  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.425889  normal  0.0154883 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4077  hypothetical protein  50.41 
 
 		 271 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1646  hypothetical protein  59.8 
 
 		 265 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.529409  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3732  hypothetical protein  59.62 
 
 		 302 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2517  protein of unknown function DUF574  54.21 
 
 		 270 aa  124  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00494367  hitchhiker  0.00135042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6213  protein of unknown function DUF574  53.4 
 
 		 268 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8766  hypothetical protein  58.65 
 
 		 267 aa  124  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3291  protein of unknown function DUF574  56.48 
 
 		 288 aa  124  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0378  hypothetical protein  60.19 
 
 		 271 aa  122  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1131  hypothetical protein  55.34 
 
 		 283 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4033  hypothetical protein  57.28 
 
 		 123 aa  121  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.638059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1531  hypothetical protein  50.39 
 
 		 147 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0233164 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1276  protein of unknown function DUF574  55.34 
 
 		 266 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1462  protein of unknown function DUF574  55.96 
 
 		 272 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3893  hypothetical protein  50.88 
 
 		 270 aa  121  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4196  hypothetical protein  48.31 
 
 		 293 aa  120  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.357043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2042  hypothetical protein  56.64 
 
 		 276 aa  120  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1598  hypothetical protein  59.79 
 
 		 234 aa  120  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1003  hypothetical protein  56.38 
 
 		 274 aa  118  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2708  protein of unknown function DUF574  51.4 
 
 		 262 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2740  protein of unknown function DUF574  59.41 
 
 		 283 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103828  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4637  hypothetical protein  46.28 
 
 		 267 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380155  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1836  hypothetical protein  58.51 
 
 		 267 aa  117  7.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0375  hypothetical protein  54.81 
 
 		 266 aa  116  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2845  hypothetical protein  57.45 
 
 		 269 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0377  hypothetical protein  56.31 
 
 		 266 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1169  protein of unknown function DUF574  51.49 
 
 		 269 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3391  protein of unknown function DUF574  53.92 
 
 		 286 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0960706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0376  hypothetical protein  57.69 
 
 		 266 aa  114  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.917138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1081  protein of unknown function DUF574  55.21 
 
 		 271 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.14412 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1387  hypothetical protein  55.56 
 
 		 264 aa  114  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0940237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5052  protein of unknown function DUF574  52.94 
 
 		 274 aa  114  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1965  protein of unknown function DUF574  52.58 
 
 		 272 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00118858  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3369  hypothetical protein  47.06 
 
 		 265 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586221  normal  0.464065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0099  protein of unknown function DUF574  52.43 
 
 		 284 aa  114  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5769  hypothetical protein  53.4 
 
 		 273 aa  114  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4639  protein of unknown function DUF574  50.44 
 
 		 284 aa  114  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5750  protein of unknown function DUF574  60.2 
 
 		 279 aa  113  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.294464  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3765  protein of unknown function DUF574  57.84 
 
 		 276 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1645  hypothetical protein  53.4 
 
 		 277 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0374  hypothetical protein  55.34 
 
 		 266 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2212  protein of unknown function DUF574  46.72 
 
 		 281 aa  113  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.137894  normal  0.500948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0345  protein of unknown function DUF574  51.96 
 
 		 328 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4561  protein of unknown function DUF574  52.94 
 
 		 268 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4754  protein of unknown function DUF574  57.94 
 
 		 280 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6443  hypothetical protein  53.33 
 
 		 253 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233397  normal  0.0362889 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2867  hypothetical protein  48.09 
 
 		 273 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3800  protein of unknown function DUF574  49.52 
 
 		 268 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.350684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5361  protein of unknown function DUF574  51.85 
 
 		 283 aa  108  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0101  protein of unknown function DUF574  50 
 
 		 285 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3624  hypothetical protein  51 
 
 		 263 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5631  hypothetical protein  52.94 
 
 		 272 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.14028 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3280  hypothetical protein  57.45 
 
 		 269 aa  107  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.900267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1459  hypothetical protein  53.15 
 
 		 277 aa  107  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3512  hypothetical protein  55.32 
 
 		 270 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2373  protein of unknown function DUF574  47.12 
 
 		 267 aa  107  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6285  protein of unknown function DUF574  52.29 
 
 		 263 aa  106  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1138  protein of unknown function DUF574  51.35 
 
 		 268 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11550  Protein of unknown function (DUF574)  52.48 
 
 		 276 aa  105  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.356734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4750  protein of unknown function DUF574  52.68 
 
 		 277 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4045  protein of unknown function DUF574  52 
 
 		 271 aa  103  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0638965  normal  0.563036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0565  protein of unknown function DUF574  52.13 
 
 		 277 aa  103  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1980  protein of unknown function DUF574  49.07 
 
 		 274 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.119584  normal  0.918627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5874  protein of unknown function DUF574  51.04 
 
 		 266 aa  100  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.85612  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3751  protein of unknown function DUF574  52.13 
 
 		 268 aa  100  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3201  protein of unknown function DUF574  50.54 
 
 		 275 aa  100  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218892  normal  0.0115553 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2281  protein of unknown function DUF574  48.04 
 
 		 278 aa  100  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.371448  normal  0.177063 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0849  protein of unknown function DUF574  47.87 
 
 		 269 aa  99.8  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5037  hypothetical protein  50.52 
 
 		 284 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38460  Protein of unknown function (DUF574)  51.06 
 
 		 282 aa  98.6  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6747  protein of unknown function DUF574  48.04 
 
 		 277 aa  95.5  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5630  hypothetical protein  54.37 
 
 		 271 aa  95.9  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5738  hypothetical protein  46.6 
 
 		 280 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0565  protein of unknown function DUF574  46 
 
 		 283 aa  95.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.679528  normal  0.162534 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1317  hypothetical protein  49 
 
 		 272 aa  94.4  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.323607  normal  0.0761527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20220  polyketide biosynthesis O-methyltransferase  50 
 
 		 277 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00509085  normal  0.22266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1360  hypothetical protein  48 
 
 		 323 aa  92  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3888  hypothetical protein  46.39 
 
 		 267 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0248897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1795  hypothetical protein  65.08 
 
 		 215 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.127827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2480  protein of unknown function DUF574  47.92 
 
 		 278 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>