74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1964 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1964  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  362  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0593  hypothetical protein  69.5 
 
 		 183 aa  211  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1949  hypothetical protein  43.1 
 
 		 174 aa  98.2  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0465515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3877  hypothetical protein  37.11 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4151  protein of unknown function DUF1003  40.77 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0848  protein of unknown function DUF1003  41.91 
 
 		 188 aa  88.2  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0189  hypothetical protein  46.88 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0838572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5575  protein of unknown function DUF1003  46.39 
 
 		 184 aa  84.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.259204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1803  hypothetical protein  46.67 
 
 		 188 aa  84.7  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.827972  normal  0.502953 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2139  protein of unknown function DUF1003  48.51 
 
 		 188 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.232205  normal  0.210739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1548  hypothetical protein  49.45 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1875  hypothetical protein  49.45 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1755  protein of unknown function DUF1003  42.75 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2938  hypothetical protein  37.32 
 
 		 178 aa  72  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.237457  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0445  hypothetical protein  35.51 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.866807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4796  hypothetical protein  39.81 
 
 		 174 aa  71.2  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513375  normal  0.208453 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1203  hypothetical protein  32.23 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0438475  normal  0.0901975 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2219  protein of unknown function DUF1003  42.4 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2763  hypothetical protein  36.56 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4320  hypothetical protein  38.95 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1489  protein of unknown function DUF1003  32.11 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6262  hypothetical protein  36.96 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3227  hypothetical protein  45.24 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2004  protein of unknown function DUF1003  38.14 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0511  hypothetical protein  37.36 
 
 		 293 aa  62  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2506  hypothetical protein  36.46 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.56137  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3902  hypothetical protein  31.58 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4500  protein of unknown function DUF1003  34.04 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1649  hypothetical protein  32.69 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.555463 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0454  protein of unknown function DUF1003  31.91 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3206  protein of unknown function DUF1003  31 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0020  hypothetical protein  32.69 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4730  cyclic nucleotide-binding protein  29.33 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.813554  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2194  protein of unknown function DUF1003  33.67 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0196461  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3017  hypothetical protein  31 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2222  protein of unknown function DUF1003  36.73 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0189655  normal  0.365031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1446  hypothetical protein  32.56 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117838  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1664  hypothetical protein  32.69 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1225  protein of unknown function DUF1003  36.67 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000330099  normal  0.0160942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8409  membrane protein-like protein  30.08 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.381654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0489  hypothetical protein  30.28 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.705019  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1130  cyclic nucleotide-binding protein  30.51 
 
 		 276 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000651756  unclonable  0.00000750922 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0516  hypothetical protein  35.16 
 
 		 240 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.388722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0902  hypothetical protein  28.35 
 
 		 209 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100097 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0874  hypothetical protein  33.01 
 
 		 256 aa  52.4  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11280  predicted membrane protein  30.39 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0638303  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2047  hypothetical protein  36.67 
 
 		 235 aa  50.4  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1133  protein of unknown function DUF1003  31 
 
 		 173 aa  49.7  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138978  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0121  protein of unknown function DUF1003  27.2 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.446057 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3010  hypothetical protein  35.53 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.272715  normal  0.532145 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3811  protein of unknown function DUF1003  39.22 
 
 		 236 aa  49.3  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1621  hypothetical protein  30.89 
 
 		 232 aa  48.9  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0139692  normal  0.0181872 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3816  hypothetical protein  25 
 
 		 203 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.313725  normal  0.183885 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3961  membrane protein-like  33.33 
 
 		 190 aa  47.8  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.201378  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5958  hypothetical protein  33 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.217492  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2292  protein of unknown function DUF1003  27.73 
 
 		 163 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4489  hypothetical protein  26.47 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.204166  normal  0.0890855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1189  protein of unknown function DUF1003  26.73 
 
 		 177 aa  45.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0470959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7120  hypothetical protein  27.34 
 
 		 304 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.839106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11256  hypothetical protein  26.39 
 
 		 180 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000588704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2207  hypothetical protein  26.72 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.467926 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1680  protein of unknown function DUF1003  26 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000539657  normal  0.503205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1546  hypothetical protein  37.5 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0716  hypothetical protein  29.63 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.275961 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0801  protein of unknown function DUF1003  23.08 
 
 		 196 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.765445  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27840  predicted membrane protein  29.45 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.775526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4309  hypothetical protein  28.3 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3988  hypothetical protein  24.19 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4062  hypothetical protein  24.19 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.866951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0700  protein of unknown function DUF1003  25.24 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.496002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0663  hypothetical protein  29.63 
 
 		 201 aa  42  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.946103  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4002  hypothetical protein  24.19 
 
 		 171 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal  0.35729 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1194  protein of unknown function DUF1003  30.86 
 
 		 175 aa  42  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.753694  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5964  hypothetical protein  29.33 
 
 		 296 aa  41.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0609036  normal  0.177218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>