54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1960 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1960  site-specific integrase-resolvase-like  100 
 
 		 147 aa  290  6e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.4652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2683  resolvase-like protein  67.78 
 
 		 190 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3431  resolvase-like protein  65.88 
 
 		 197 aa  97.8  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5676  resolvase domain-containing protein  63.53 
 
 		 190 aa  94.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0684  resolvase domain-containing protein  63.53 
 
 		 190 aa  94.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.245344 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12994  resolvase  56.25 
 
 		 194 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1614  resolvase domain-containing protein  63.53 
 
 		 182 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00182311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12805  resolvase  59.34 
 
 		 193 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00189559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5986  resolvase domain-containing protein  69.86 
 
 		 162 aa  92  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00224994  normal  0.0280728 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2513  Resolvase domain protein  51 
 
 		 195 aa  88.6  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10616  resolvase  61.25 
 
 		 202 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000496522  normal  0.221326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2776  putative resolvase  67.57 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13862  resolvase  55.21 
 
 		 203 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10939  resolvase  51.22 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1105  transposon resolvase  50 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1224  putative site-specific integrase-resolvase  46.15 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.997311  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1426  site-specific integrase-resolvase-like protein  45.45 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.765769  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1033  transposon resolvase  33.65 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.412274  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0851  regulatory protein MerR  29.21 
 
 		 222 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2781  Resolvase domain protein  29.21 
 
 		 222 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.912906 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4506  hypothetical protein  58.62 
 
 		 132 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0941  resolvase domain-containing protein  25.53 
 
 		 208 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143335  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0751  Resolvase domain protein  27.96 
 
 		 209 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1241  Resolvase domain protein  28.09 
 
 		 222 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0456632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12900  resolvase  56.76 
 
 		 295 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0601752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0785  Resolvase domain protein  33.75 
 
 		 202 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00525149  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1911  DNA binding domain-containing protein  29.9 
 
 		 216 aa  48.5  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1118  Resolvase domain protein  37.5 
 
 		 229 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1174  DNA binding domain protein, excisionase family  33.01 
 
 		 219 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.122691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1808  DNA binding domain protein, excisionase family  33.67 
 
 		 219 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1070  resolvase domain-containing protein  32.1 
 
 		 197 aa  47.8  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.709621  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1000  Resolvase domain protein  25 
 
 		 206 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0589477 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2935  Resolvase domain protein  25 
 
 		 206 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0272  Resolvase domain protein  35.42 
 
 		 229 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000593088  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  30.68 
 
 		 213 aa  47  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  30.68 
 
 		 213 aa  47  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0522  DNA binding domain protein, excisionase family  31.11 
 
 		 244 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0170413  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0744  Resolvase domain protein  36.46 
 
 		 229 aa  45.4  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000124642  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0948  site-specific integrase/resolvase  34.88 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.531266  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  34.33 
 
 		 215 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1564  hypothetical protein  32.56 
 
 		 215 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.20655  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0658  hypothetical protein  32.56 
 
 		 215 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0390  DNA binding domain protein, excisionase family  31.11 
 
 		 216 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0112175  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1710  resolvase domain-containing protein  31.53 
 
 		 222 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2443  DNA binding domain protein, excisionase family  28.24 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.453884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1449  Resolvase domain protein  34 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0392946  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0484  DNA binding domain protein, excisionase family  30 
 
 		 216 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.114276  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2645  DNA binding domain protein, excisionase family  31.4 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0895  DNA binding domain protein, excisionase family  30.59 
 
 		 192 aa  42  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0818  DNA binding domain protein, excisionase family  31.11 
 
 		 216 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2150  DNA binding domain protein, excisionase family  30.59 
 
 		 195 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3670  DNA binding domain-containing protein  26.67 
 
 		 201 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0947  Resolvase domain protein  33.33 
 
 		 195 aa  40.4  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151254  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2048  Resolvase domain protein  28.24 
 
 		 193 aa  40  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0322526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>