243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1628 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 334 aa  651    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  83.93 
 
 		 373 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  56.6 
 
 		 360 aa  359  3e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  53.98 
 
 		 339 aa  335  5e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  53.5 
 
 		 325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  52.87 
 
 		 334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  56.07 
 
 		 313 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  55.45 
 
 		 344 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  49.69 
 
 		 328 aa  299  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 322 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 342 aa  297  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 322 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 322 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  49.22 
 
 		 322 aa  296  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  52.5 
 
 		 344 aa  295  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  48.19 
 
 		 335 aa  291  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  47.76 
 
 		 334 aa  290  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  49.36 
 
 		 329 aa  288  9e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  45.07 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  47.16 
 
 		 306 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  42.62 
 
 		 321 aa  276  4e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  49.68 
 
 		 312 aa  276  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  50.17 
 
 		 321 aa  276  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  45.93 
 
 		 322 aa  274  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  42.9 
 
 		 321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  42.77 
 
 		 308 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  46 
 
 		 307 aa  267  2e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  45.7 
 
 		 310 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  47.04 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  44.52 
 
 		 311 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  45 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  46.48 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  45.89 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  46.08 
 
 		 313 aa  256  3e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  49.33 
 
 		 318 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  43.9 
 
 		 330 aa  255  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  48.11 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  43.41 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  47.49 
 
 		 308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  49.64 
 
 		 348 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  47.78 
 
 		 314 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  43.26 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  46.58 
 
 		 328 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  46.58 
 
 		 328 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  48.33 
 
 		 322 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  45.31 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  45.54 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  44.09 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  42.54 
 
 		 399 aa  246  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  48 
 
 		 322 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  48 
 
 		 322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  48 
 
 		 322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  48 
 
 		 337 aa  245  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  51.09 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  46.58 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  43.91 
 
 		 317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  42.01 
 
 		 354 aa  242  6e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  47.06 
 
 		 352 aa  241  9e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  43.41 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  44.95 
 
 		 305 aa  240  2.9999999999999997e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  45.65 
 
 		 338 aa  239  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  43.29 
 
 		 333 aa  239  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  42.53 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  43.85 
 
 		 312 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  44.12 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  43.27 
 
 		 387 aa  237  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  44.62 
 
 		 333 aa  237  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  43.08 
 
 		 359 aa  237  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  41.78 
 
 		 350 aa  235  6e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  45.67 
 
 		 321 aa  236  6e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  45.67 
 
 		 321 aa  235  9e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  45.67 
 
 		 321 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  45.67 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  45.67 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  45.67 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  45.67 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  44.04 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  42.17 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  45.67 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  41.07 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  40.3 
 
 		 343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  44.37 
 
 		 332 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  45.33 
 
 		 321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  46.55 
 
 		 320 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  45.74 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  46.1 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  44.76 
 
 		 325 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  41.21 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  39.4 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  41.93 
 
 		 330 aa  230  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  42.62 
 
 		 332 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  44.94 
 
 		 328 aa  230  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  44.41 
 
 		 352 aa  229  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  40.06 
 
 		 325 aa  228  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  44.55 
 
 		 334 aa  228  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  43.32 
 
 		 319 aa  228  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  43.55 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  41.99 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  41.27 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  41.5 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>