More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1167 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1167  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 605 aa  1165    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5300  glycosyl transferase group 1  60.6 
 
 		 565 aa  526  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225407  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4957  glycosyl transferase group 1  49.64 
 
 		 518 aa  320  3.9999999999999996e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0837434  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3993  glycosyl transferase group 1  44.37 
 
 		 392 aa  282  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.083077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5675  glycosyl transferase group 1  41.79 
 
 		 388 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.333063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2468  putative glycosyltransferase  40.7 
 
 		 448 aa  260  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0804  group 1 glycosyl transferase  39.01 
 
 		 425 aa  257  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3707  glycosyl transferase group 1  41.51 
 
 		 468 aa  247  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1470  Glycosyltransferase-like protein  39.34 
 
 		 440 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0230  glycosyl transferase group 1  39.81 
 
 		 499 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0402  glycosyl transferase group 1  37 
 
 		 380 aa  201  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  35.7 
 
 		 455 aa  194  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0209  glycosyl transferase, group 1  35.75 
 
 		 386 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  36.19 
 
 		 386 aa  192  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0229  glycosyl transferase, group 1  35.75 
 
 		 386 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0426  glycosyl transferase, group 1  36.21 
 
 		 386 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  34.6 
 
 		 445 aa  177  6e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10227  hypothetical protein  35.73 
 
 		 384 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.990297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  34.18 
 
 		 398 aa  172  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  33.96 
 
 		 393 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3000  glycosyl transferase, group 1  36.79 
 
 		 384 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0763479  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0219  glycosyl transferase, group 1  34.56 
 
 		 360 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4469  glycosyl transferase group 1  33.88 
 
 		 387 aa  161  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0483  glycosyl transferase, group 1  30.21 
 
 		 370 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  28.74 
 
 		 361 aa  143  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1008  glycosyl transferase group 1  21.98 
 
 		 353 aa  102  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  28.64 
 
 		 414 aa  89.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1844  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 		 348 aa  88.6  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0112136  normal  0.849327 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  23.73 
 
 		 349 aa  87  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2431  glycosyl transferase, group 1  36.13 
 
 		 364 aa  82.4  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.704693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  21.36 
 
 		 536 aa  78.2  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0156  glycosyl transferase group 1  21.24 
 
 		 359 aa  77  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 		 392 aa  76.3  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  27.31 
 
 		 935 aa  74.7  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  32.02 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  40.22 
 
 		 381 aa  73.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 		 409 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.44 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  35.03 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  34.65 
 
 		 376 aa  72.8  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 		 415 aa  72  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 		 360 aa  72  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 		 390 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1660  glycosyl transferase group 1  27.21 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.208349  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  25.41 
 
 		 743 aa  70.5  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  32.88 
 
 		 428 aa  70.1  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5490  glycosyl transferase group 1  30.27 
 
 		 402 aa  70.1  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  27.13 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  26.37 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  33.5 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  33 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0972  glycosyl transferase, group 1  35.14 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.775545  normal  0.23686 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 		 476 aa  68.2  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  21.57 
 
 		 373 aa  67.8  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.73 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  24.25 
 
 		 426 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0456  glycosyl transferase, group 1  49.46 
 
 		 435 aa  67  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778621  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1540  glycosyl transferase, group 1  31.13 
 
 		 414 aa  67  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.22 
 
 		 386 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  36 
 
 		 382 aa  67  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0507  glycosyl transferase group 1  39.37 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  32.5 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 		 439 aa  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1068  glycosyl transferase group 1  35.12 
 
 		 658 aa  65.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114697  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  33.97 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 		 435 aa  66.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3146  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  32.83 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  37.24 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.24 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  33.95 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 		 377 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  34.9 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  33.5 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1916  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  32.44 
 
 		 431 aa  63.9  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.74 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  35 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.64 
 
 		 409 aa  63.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  23.33 
 
 		 389 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  25.57 
 
 		 387 aa  63.2  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2204  glycosyl transferase group 1  35.81 
 
 		 372 aa  63.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 		 415 aa  63.5  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  31.79 
 
 		 373 aa  63.5  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  33.66 
 
 		 438 aa  63.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  35.68 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0138  glycosyl transferase group 1  28.19 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0526  glycosyl transferase, group 1  29.53 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.548625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>