More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1916 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1916  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 378 aa  774    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  32.19 
 
 		 770 aa  145  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 		 359 aa  99.4  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4017  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 384 aa  99.4  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.174092  normal  0.606388 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 		 386 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  36.87 
 
 		 445 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2738  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  28.62 
 
 		 382 aa  90.1  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  39.33 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 		 448 aa  85.9  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 		 770 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  36.42 
 
 		 398 aa  82.8  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3263  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  22.76 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2253  glycosyl transferase, group 1  30.74 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.790793 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3932  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  30.25 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  31.67 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0793  Glycosyltransferase-like protein  26.1 
 
 		 384 aa  79.3  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0358  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4100  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  30.13 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.564193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4039  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  30.13 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  35.39 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  27.04 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1191  glycosyl transferase, group 1  26.22 
 
 		 384 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3994  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  29.71 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  32.8 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  28.92 
 
 		 377 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  28.61 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3913  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  29.71 
 
 		 381 aa  76.3  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.0414199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  29.3 
 
 		 458 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0285  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1787  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  32.92 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  38.59 
 
 		 402 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  32.96 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  28.67 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3845  group 1 glycosyl transferase  26.49 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452091  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3707  glycosyl transferase group 1  29.14 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  25.77 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 		 439 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1803  glycosyl transferase, group 1  30.58 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 389 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 		 360 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 		 370 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3098  glycosyl transferase, group 1  25.93 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.034289  normal  0.933214 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2096  glycosyl transferase, group 1  25.21 
 
 		 410 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0879  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0254589  normal  0.0859714 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2537  putative lipopolysaccharide biosynthesis- related glycosyltransferase  31.56 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.252035 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.76 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  30.34 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  32.35 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  31.76 
 
 		 369 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  37.42 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3550  glycosyl transferase, group 1  28.41 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750733 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  29.52 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  29.35 
 
 		 482 aa  69.3  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1539  glycosyl transferase, group 1  24.11 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.18 
 
 		 369 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  36.77 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  36.16 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.72 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0112  UDP-sugar hydrolase  31.9 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  29.8 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.46 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2961  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0846  glycosyl transferase, group 1  31.03 
 
 		 405 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.87203  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 		 340 aa  67  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  29.25 
 
 		 382 aa  67  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>