142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1011 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1011  alkaline phosphatase  100 
 
 		 483 aa  966    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1306  putative secreted alkaline phosphatase  72.96 
 
 		 573 aa  714    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4231  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  60.74 
 
 		 518 aa  567  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3867  alkaline phosphatase  62.08 
 
 		 519 aa  555  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.261965  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3488  alkaline phosphatase  60.91 
 
 		 520 aa  541  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223283  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0308  twin-arginine translocation pathway signal  58.96 
 
 		 520 aa  535  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2721  twin-arginine translocation pathway signal  56.99 
 
 		 516 aa  525  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.334702  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12170  alkaline phosphatase  55.76 
 
 		 519 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13330  hypothetical protein  55.79 
 
 		 520 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0826968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4171  twin-arginine translocation pathway signal  54.83 
 
 		 527 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0796  alkaline phosphatase  55.24 
 
 		 513 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03245  alkaline phosphatase  57.56 
 
 		 523 aa  514  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4480  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  54.75 
 
 		 527 aa  508  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1200  hypothetical protein  55.37 
 
 		 517 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2698  twin-arginine translocation pathway signal  51.24 
 
 		 532 aa  506  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.145958  normal  0.764483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0250  putative alkaline phosphatase (phoD)  53.94 
 
 		 524 aa  497  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1057  alkaline phosphatase  53.29 
 
 		 546 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4636  putative alkaline phosphatase  55.21 
 
 		 523 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0793302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5715  alkaline phosphatase  53.67 
 
 		 514 aa  483  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1503  putative alkaline phosphatase (PhoD); putative signal peptide  53.42 
 
 		 522 aa  483  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.337641  normal  0.661577 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2583  alkaline phosphatase  52.03 
 
 		 567 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4157  secreted alkaline phosphatase protein  52.78 
 
 		 526 aa  473  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0120038  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3035  alkaline phosphatase  49.52 
 
 		 559 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.852878 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17510  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  51.76 
 
 		 547 aa  467  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0778784  normal  0.245984 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2357  putative phosphatase or phosphodiesterase  50.92 
 
 		 528 aa  467  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2182  alkaline phosphatase  47.4 
 
 		 526 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000857232 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2978  alkaline phosphatase  49.49 
 
 		 539 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0869  Alkaline phosphatase  49.69 
 
 		 539 aa  457  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.717187  normal  0.577908 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0798  Alkaline phosphatase  49.49 
 
 		 539 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2977  alkaline phosphatase  51.65 
 
 		 520 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1561  Alkaline phosphatase D-related protein  48.88 
 
 		 541 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1051  Alkaline phosphatase D-related protein  30.28 
 
 		 727 aa  149  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20330  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  29.83 
 
 		 555 aa  128  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.616637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1784  Alkaline phosphatase  30.65 
 
 		 549 aa  126  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.38087  normal  0.37956 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03467  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  30.33 
 
 		 564 aa  121  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0221  hypothetical protein  44.22 
 
 		 191 aa  120  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1735  Alkaline phosphatase  29.95 
 
 		 538 aa  119  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2633  Alkaline phosphatase  27.93 
 
 		 531 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2184  Alkaline phosphatase  28.95 
 
 		 587 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1743  alkaline phosphatase  29.84 
 
 		 529 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.672786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3226  Alkaline phosphatase  30.68 
 
 		 516 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0893  alkaline phosphatase  30.29 
 
 		 554 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.20064  normal  0.526833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3547  Alkaline phosphatase  26.71 
 
 		 528 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.493509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2119  Alkaline phosphatase  28.68 
 
 		 538 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0765  alkaline phosphatase  28.47 
 
 		 541 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.387118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0707  alkaline phosphatase  28.95 
 
 		 541 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.537391  hitchhiker  0.00280283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2394  alkaline phosphatase  28.1 
 
 		 540 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3516  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.34 
 
 		 524 aa  110  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.195825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3986  Alkaline phosphatase  28.99 
 
 		 523 aa  109  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.475008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2896  Alkaline phosphatase  30.36 
 
 		 522 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177773  normal  0.0606624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1026  alkaline phosphatase  30 
 
 		 511 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9474  normal  0.149537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1910  alkaline phosphatase  29.06 
 
 		 523 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.31807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2252  alkaline phosphatase  27.21 
 
 		 522 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00266455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3820  alkaline phosphatase  30.58 
 
 		 618 aa  106  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00587129  normal  0.244243 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1294  Alkaline phosphatase  26.8 
 
 		 521 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.455409  normal  0.583657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3741  twin-arginine translocation pathway signal  27.8 
 
 		 530 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803365  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1650  Alkaline phosphatase  29.16 
 
 		 520 aa  104  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0908494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2888  Alkaline phosphatase  27.08 
 
 		 540 aa  103  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0055599  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2122  Alkaline phosphatase  27.76 
 
 		 531 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.7149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3287  twin-arginine translocation pathway signal  27.25 
 
 		 585 aa  102  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01060  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  27.34 
 
 		 540 aa  101  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3609  alkaline phosphatase  29.23 
 
 		 582 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0107894 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1209  alkaline phosphatase  28.77 
 
 		 600 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3573  alkaline phosphatase  27.03 
 
 		 550 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3609  alkaline phosphatase  27.73 
 
 		 576 aa  98.6  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05495  hypothetical protein  26.42 
 
 		 674 aa  98.2  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.840238  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1673  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  26.79 
 
 		 524 aa  97.8  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3582  alkaline phosphatase  27.99 
 
 		 617 aa  97.8  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0775893 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1695  Alkaline phosphatase  27.14 
 
 		 534 aa  97.1  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19690  phosphodiesterase/alkaline phosphatase D  28.85 
 
 		 552 aa  97.1  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1493  Alkaline phosphatase  27.07 
 
 		 531 aa  97.1  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563109 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2905  Alkaline phosphatase  27.72 
 
 		 606 aa  96.3  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0138  Alkaline phosphatase  28.44 
 
 		 523 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.407746  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6120  Alkaline phosphatase  28.92 
 
 		 563 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51031  normal  0.307259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0820  alkaline phosphatase  27.17 
 
 		 589 aa  94.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4130  alkaline phosphatase  23.9 
 
 		 530 aa  94.4  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00507344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1326  alkaline phosphatase  26.44 
 
 		 538 aa  94  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.749734  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3654  alkaline phosphatase  27.25 
 
 		 588 aa  94  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0872  alkaline phosphatase  26.01 
 
 		 523 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.406207  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3312  twin-arginine translocation pathway signal  28.01 
 
 		 588 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3587  Alkaline phosphatase  27.25 
 
 		 588 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0641  twin-arginine translocation pathway signal  28.33 
 
 		 588 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0651  alkaline phosphatase  27.86 
 
 		 588 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03244  alkaline phosphatase D  28.02 
 
 		 558 aa  91.7  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4333  alkaline phosphatase  27.86 
 
 		 545 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0499289 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0227  Alkaline phosphatase  27.42 
 
 		 532 aa  90.9  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0713623 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3777  alkaline phosphatase  26.97 
 
 		 588 aa  90.9  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3482  alkaline phosphatase  28.06 
 
 		 588 aa  90.5  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1769  Alkaline phosphatase  28.61 
 
 		 555 aa  90.5  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00994552  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5006  Alkaline phosphatase  26.08 
 
 		 519 aa  90.1  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2635  Alkaline phosphatase  26.39 
 
 		 529 aa  89.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.289906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0946  alkaline phosphatase  26.4 
 
 		 525 aa  89  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0738  Alkaline phosphatase  24.14 
 
 		 450 aa  87.8  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0785781  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1010  alkaline phosphatase D  27.4 
 
 		 523 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3819  alkaline phosphatase  26.48 
 
 		 523 aa  87  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0806  alkaline phosphatase, putative  29.76 
 
 		 588 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0910  alkaline phosphatase  27.2 
 
 		 589 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101698 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4060  Phosphodiesterase/alkaline phosphatase D-like protein  26.02 
 
 		 573 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1386  Alkaline phosphatase  26.54 
 
 		 529 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1126  Alkaline phosphatase  26.15 
 
 		 529 aa  85.9  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>