More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1740 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1740  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  100 
 
 
291 aa  576  1.0000000000000001e-163  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367241  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1218  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  69.44 
 
 
293 aa  424  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1605  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  64.41 
 
 
293 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0889  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  53.17 
 
 
300 aa  315  5e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.497828  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0378  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  45.03 
 
 
321 aa  229  4e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000246514  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2209  membrane bound protein complex subunit mbxM  30.51 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.152472 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4505  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  28.72 
 
 
319 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.166702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1421  membrane bound hydrogenase subunit mbhM  29.8 
 
 
323 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245548  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1881  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  29.29 
 
 
323 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3193  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  27.12 
 
 
332 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.539887 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0968  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  29.79 
 
 
321 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0676  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  28.62 
 
 
338 aa  100  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3523  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  28.62 
 
 
313 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0960  membrane bound hydrogenase subunit mbhM  27.61 
 
 
333 aa  101  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.298865  normal  0.545007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0317  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  26.67 
 
 
300 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460489  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1129  NADH dehydrogenase (quinone)  29.2 
 
 
322 aa  94.7  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2226  NADH dehydrogenase (quinone)  27.42 
 
 
328 aa  93.2  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2591  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  27.71 
 
 
343 aa  89.7  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1293  F420H2 dehydrogenase subunit H  29.07 
 
 
344 aa  89.7  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000183992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2785  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  25.56 
 
 
303 aa  89.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2793  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  25.56 
 
 
303 aa  89.4  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  25.08 
 
 
447 aa  86.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3408  F420H2 dehydrogenase subunit H  28.52 
 
 
346 aa  86.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00645372  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0131  hydrogenase-4 component C  24.72 
 
 
306 aa  85.9  8e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.103807  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  26.75 
 
 
349 aa  85.5  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  28.32 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  26.46 
 
 
330 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1920  NADH dehydrogenase (quinone)  25.72 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.179258  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4985  NADH dehydrogenase (quinone)  26.37 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.101143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  25.61 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  25.61 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  25.61 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  25.61 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  25.61 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  25.61 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  26.37 
 
 
333 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  25.61 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  25.26 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  25.61 
 
 
333 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4397  NADH dehydrogenase subunit H  28.96 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0666  NADH dehydrogenase (quinone)  25.97 
 
 
317 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.471376  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  24.91 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0318  NADH dehydrogenase  26.32 
 
 
317 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.38198 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0151  ech hydrogenase subunit B  25.26 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3747  NADH dehydrogenase (quinone)  25.65 
 
 
351 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000186465  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0187  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  27.23 
 
 
312 aa  76.3  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0325  NADH dehydrogenase (quinone)  26.32 
 
 
329 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5972  NADH dehydrogenase (quinone)  27.15 
 
 
320 aa  75.5  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723565  normal  0.842062 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  24.58 
 
 
348 aa  75.5  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0596  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  27.4 
 
 
313 aa  75.5  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  25.91 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1078  NADH dehydrogenase subunit H  27.56 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.425523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1207  NADH dehydrogenase subunit H  27.56 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  27.43 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0758  NADH dehydrogenase (quinone)  27.27 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000013576  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1913  hypothetical protein  24.07 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1790  hydrogenase-4 component C  22.64 
 
 
306 aa  73.9  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00154252  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1012  NADH dehydrogenase subunit H  27.24 
 
 
340 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3302  NADH dehydrogenase subunit H  26.3 
 
 
325 aa  73.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2826  NADH dehydrogenase subunit H  26.62 
 
 
325 aa  73.2  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.391719  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3864  NADH dehydrogenase (quinone)  23.72 
 
 
390 aa  72.8  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  23.89 
 
 
384 aa  72.8  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5105  NADH dehydrogenase (quinone)  25.82 
 
 
384 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1073  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  28.17 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.781085  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  22.37 
 
 
372 aa  72.4  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1731  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  24.62 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0032732  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1114  NADH dehydrogenase (quinone)  25.1 
 
 
364 aa  72.4  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2925  NADH dehydrogenase subunit H  27.11 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0568  hypothetical protein  30.15 
 
 
285 aa  71.6  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.949446  hitchhiker  0.00210733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3436  NADH dehydrogenase I, H subunit  25.35 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1039  NADH dehydrogenase subunit H  23.65 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000216191 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  23.25 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  23.25 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1010  NADH dehydrogenase subunit H  23.65 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2630  hydrogenase-4 component C  28.57 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0897  NADH dehydrogenase subunit H  28.48 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  23.25 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  23.25 
 
 
372 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  23.05 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02207  NADH dehydrogenase subunit H  25.17 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7012  NADH dehydrogenase (quinone)  23.1 
 
 
345 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  25.17 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2575  NADH dehydrogenase subunit H  25.17 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1370  NADH dehydrogenase subunit H  25.17 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.638509  normal  0.284732 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2436  NADH dehydrogenase subunit H  25.17 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2658  NADH dehydrogenase subunit H  25.17 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1460  NADH dehydrogenase subunit H  25.93 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2431  NADH dehydrogenase subunit H  25.17 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1810  NADH dehydrogenase subunit H  25.93 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.639781 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3421  NADH dehydrogenase subunit H  25.17 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.950674  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1566  NADH dehydrogenase subunit H  25.93 
 
 
325 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  26.09 
 
 
353 aa  70.1  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  23.12 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  23.12 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4065  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  25.44 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0444558  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2529  NADH dehydrogenase subunit H  22.97 
 
 
372 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2052  NADH dehydrogenase subunit H  26.6 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1268  NADH dehydrogenase subunit H  27.33 
 
 
347 aa  69.7  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.279404  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1721  NADH dehydrogenase subunit H  26.91 
 
 
347 aa  69.3  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0375  NADH-quinone oxidoreductase, chain H  24.47 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>