142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1044 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1044  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  556  1e-157  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.117258  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1521  hypothetical protein  43.62 
 
 
241 aa  196  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1462  hypothetical protein  42.8 
 
 
241 aa  195  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26157  predicted protein  37.02 
 
 
280 aa  189  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1015  hypothetical protein  39.74 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1292  hypothetical protein  36.91 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3212  hypothetical protein  36.91 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.212307  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_7084  predicted protein  41.2 
 
 
215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.201288 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2162  hypothetical protein  36.48 
 
 
280 aa  161  9e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00865051  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3006  CCC1-related iron/manganese transporter component  37.14 
 
 
236 aa  138  8.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0145  protein of unknown function DUF125 transmembrane  35.9 
 
 
235 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.937681  normal  0.466486 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0236  hypothetical protein  34.3 
 
 
343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3418  hypothetical protein  32.06 
 
 
231 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.258181  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1320  hypothetical protein  36.09 
 
 
237 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.230604  normal  0.0897781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2945  hypothetical protein  34.1 
 
 
239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731453  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  31.9 
 
 
374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  29.87 
 
 
376 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5570  hypothetical protein  33.01 
 
 
231 aa  115  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.492246 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1077  hypothetical protein  31.39 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.040986  normal  0.838313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1499  protein of unknown function DUF125 transmembrane  37.07 
 
 
237 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.181009  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2142  hypothetical protein  34.04 
 
 
231 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0585  hypothetical protein  28.39 
 
 
247 aa  108  9.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.423097 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5770  hypothetical protein  29.13 
 
 
357 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1566  protein of unknown function DUF125 transmembrane  33.99 
 
 
227 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0836  protein of unknown function DUF125 transmembrane  34.36 
 
 
233 aa  107  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.30782  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5704  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.53 
 
 
265 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0710  hypothetical protein  32.14 
 
 
372 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.441987  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2869  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.86 
 
 
235 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.016157  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0746  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.53 
 
 
372 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.734592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0747  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.14 
 
 
372 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0141065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0752  hypothetical protein  31.93 
 
 
371 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.575838  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2558  protein of unknown function DUF125 transmembrane  34.08 
 
 
181 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0981  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.97 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0865603  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2329  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.81 
 
 
241 aa  97.8  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.497478  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4471  hypothetical protein  31.76 
 
 
229 aa  97.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1363  hypothetical protein  31.07 
 
 
237 aa  96.3  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2551  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.13 
 
 
371 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1938  hypothetical protein  31.06 
 
 
239 aa  93.6  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0601853  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4657  hypothetical protein  34.1 
 
 
231 aa  93.2  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262976  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19590  uncharacterized membrane protein  32.8 
 
 
232 aa  92.8  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.927854  normal  0.04221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3035  hypothetical protein  28.9 
 
 
263 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.644185 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1636  hypothetical protein  32.29 
 
 
242 aa  92.8  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.790836  hitchhiker  0.00000056751 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5039  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.17 
 
 
376 aa  92  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.144378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5110  protein of unknown function DUF125 transmembrane  32.43 
 
 
238 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4534  hypothetical protein  27.64 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0182642 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1290  integral membrane protein  30.26 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.703645  normal  0.502093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4934  hypothetical protein  30.9 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0131166  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2210  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.29 
 
 
246 aa  89.7  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.303449  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4967  hypothetical protein  31.55 
 
 
231 aa  89.7  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794952  normal  0.952404 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0378  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.81 
 
 
352 aa  89.4  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0516728  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2727  hypothetical protein  30.26 
 
 
244 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.84111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0844  hypothetical protein  28.7 
 
 
387 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0273  hypothetical protein  29.82 
 
 
231 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0962  protein of unknown function DUF125 transmembrane  26.09 
 
 
396 aa  87  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2740  hypothetical protein  34.18 
 
 
233 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3717  hypothetical protein  31.43 
 
 
233 aa  85.9  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752058  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2712  hypothetical protein  34.12 
 
 
235 aa  85.9  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808274  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2446  hypothetical protein  31.31 
 
 
228 aa  85.5  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0274755  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3654  putative nodulin-related protein  31.32 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1963  hypothetical protein  28.88 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04429  conserved mebrane associated protein  29.73 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.729026  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3122  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.82 
 
 
231 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01320  uncharacterized membrane protein  27.75 
 
 
365 aa  84  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3979  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.63 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.370898  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1253  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1998  hypothetical protein  26.41 
 
 
242 aa  84  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0347825  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3014  hypothetical protein  33.53 
 
 
235 aa  82.8  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253344 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3399  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.49 
 
 
234 aa  82  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.233589 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2082  hypothetical protein  31.13 
 
 
233 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00637879  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3434  hypothetical protein  32.52 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.195788  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3497  hypothetical protein  32.52 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.382938 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3445  hypothetical protein  32.52 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.997991  normal  0.347741 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2089  hypothetical protein  35.33 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457798  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3927  hypothetical protein  32.4 
 
 
233 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4424  hypothetical protein  26.82 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1084  hypothetical protein  34.71 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0429154  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37632  predicted protein  23.75 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1040  hypothetical protein  33.53 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.390352  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0698  hypothetical protein  30.46 
 
 
233 aa  79  0.00000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0802  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.68 
 
 
236 aa  78.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67039  predicted protein  24.67 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.147925 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3365  hypothetical protein  35.98 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.625585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1833  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.87 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3441  protein of unknown function DUF125 transmembrane  28.02 
 
 
235 aa  75.1  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.720672  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0169  hypothetical protein  29.41 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2119  hypothetical protein  36.57 
 
 
229 aa  74.7  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00934524  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0163  protein of unknown function DUF125 transmembrane  31.74 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1741  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.88 
 
 
229 aa  73.9  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43313  predicted protein  26.2 
 
 
303 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4695  hypothetical protein  32.12 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635203  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5214  hypothetical protein  32.12 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.669452  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0798  hypothetical protein  31.9 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00535616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14200  hypothetical protein  26.19 
 
 
250 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0969777 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1569  hypothetical protein  27.88 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00144859  normal  0.688354 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2462  hypothetical protein  31.37 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04290  uncharacterized membrane protein  24.45 
 
 
376 aa  71.6  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1411  hypothetical protein  32.56 
 
 
243 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0652587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6021  hypothetical protein  33.54 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0925231  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36050  uncharacterized membrane protein  32.97 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.787149  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1509  hypothetical protein  27.48 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0134552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>