More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0951 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0951  putative membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
495 aa  984    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000274042  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0260  peptidase M50  49.7 
 
 
496 aa  473  1e-132  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.650665  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0037  peptidase M50  43.06 
 
 
501 aa  375  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100693  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0037  peptidase M50  43.06 
 
 
501 aa  375  1e-103  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1940  membrane-associated zinc metalloprotease  39.41 
 
 
507 aa  330  3e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000740913  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  26.22 
 
 
469 aa  156  9e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.46 
 
 
446 aa  156  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  26.38 
 
 
428 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3722  membrane-associated zinc metalloprotease  24.78 
 
 
561 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632001  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3582  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  24.96 
 
 
561 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.864637  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28 
 
 
456 aa  154  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3648  membrane-associated zinc metalloprotease  24.78 
 
 
561 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.44 
 
 
456 aa  151  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.17 
 
 
455 aa  150  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  40 
 
 
439 aa  149  9e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1638  membrane-associated zinc metalloprotease  29.3 
 
 
454 aa  149  9e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0981  peptidase RseP  28.38 
 
 
443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.238067  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  26.95 
 
 
461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  26.89 
 
 
456 aa  148  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  26.98 
 
 
452 aa  146  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  26.2 
 
 
456 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.63 
 
 
456 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.65 
 
 
456 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2341  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.18 
 
 
450 aa  144  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00281256  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1797  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.27 
 
 
479 aa  144  3e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.88903  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.3 
 
 
455 aa  144  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  26.2 
 
 
456 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1844  hypothetical protein  26.75 
 
 
452 aa  144  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000001193  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  26.45 
 
 
456 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  27.55 
 
 
454 aa  142  9e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  25.38 
 
 
454 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  24.55 
 
 
457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  27.67 
 
 
452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  25.25 
 
 
456 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1560  membrane-associated zinc metalloprotease EcfE  25.9 
 
 
452 aa  140  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.294155  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.45 
 
 
456 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  25.3 
 
 
450 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4633  membrane-associated zinc metalloprotease  27.01 
 
 
488 aa  139  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.45 
 
 
456 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  24.67 
 
 
494 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.75 
 
 
452 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  23.76 
 
 
457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  27.75 
 
 
452 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  24.85 
 
 
462 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.85 
 
 
462 aa  137  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.58 
 
 
458 aa  137  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  24.85 
 
 
454 aa  136  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6065  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  24.21 
 
 
457 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2012  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.21 
 
 
457 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2032  membrane-associated zinc metalloprotease  24.41 
 
 
457 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0796  membrane-associated zinc metalloprotease  37.62 
 
 
348 aa  136  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.270174  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  24.17 
 
 
463 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0596  membrane-associated zinc metalloprotease  37.24 
 
 
337 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27 
 
 
450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.84 
 
 
452 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.95 
 
 
450 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  25.5 
 
 
450 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  26.08 
 
 
446 aa  133  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  24.36 
 
 
461 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.84 
 
 
450 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  24.75 
 
 
456 aa  133  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.05 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0998  peptidase RseP  27.55 
 
 
424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000230134  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  26.48 
 
 
451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  25.65 
 
 
438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.35 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.83 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  24.61 
 
 
456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  26.04 
 
 
451 aa  131  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.75 
 
 
450 aa  130  5.0000000000000004e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  25 
 
 
450 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1411  hypothetical protein  24.21 
 
 
462 aa  130  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.73492 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0568  hypothetical protein  27.16 
 
 
450 aa  130  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  24.01 
 
 
451 aa  130  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.6 
 
 
455 aa  129  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.01 
 
 
455 aa  129  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0118  RIP metalloprotease RseP  24.68 
 
 
433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  40.22 
 
 
370 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0587  membrane-associated zinc metalloprotease  37.63 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1061  membrane-associated zinc metalloprotease  38.46 
 
 
352 aa  128  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1367  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.51 
 
 
444 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0141782 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0481  putative membrane-associated zinc metalloprotease  38.12 
 
 
355 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1948  membrane-associated zinc metalloprotease  38.19 
 
 
356 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0655  putative membrane-associated zinc metalloprotease  39.29 
 
 
368 aa  127  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  24.22 
 
 
453 aa  127  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.64 
 
 
461 aa  127  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2710  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.31 
 
 
444 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0608503  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0544  hypothetical protein  27.07 
 
 
475 aa  126  9e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1809  membrane-associated zinc metalloprotease  37.04 
 
 
349 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.489906  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0263  zinc metallopeptidase RseP  25.78 
 
 
450 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0154737  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0245  zinc metallopeptidase RseP  25.78 
 
 
450 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0248  zinc metallopeptidase RseP  25.78 
 
 
450 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0261  zinc metallopeptidase RseP  25.78 
 
 
450 aa  126  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.522145 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  25.3 
 
 
454 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0245  zinc metallopeptidase RseP  25.78 
 
 
450 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00582579  normal  0.54526 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1086  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  39.29 
 
 
368 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1665  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  36.84 
 
 
335 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0180  zinc metallopeptidase RseP  25.88 
 
 
450 aa  123  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000271457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0178  zinc metallopeptidase RseP  25.88 
 
 
450 aa  123  9e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111428  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1211  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  38.78 
 
 
368 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>