90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0918 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  360  9e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  64.5 
 
 
171 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  62.13 
 
 
171 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  57.74 
 
 
166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  51.16 
 
 
174 aa  177  8e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  38.55 
 
 
184 aa  111  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0613  hypothetical protein  30.92 
 
 
174 aa  77.4  0.00000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1308  hypothetical protein  41.41 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.296823  normal  0.0132705 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  33.57 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1030  Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.06 
 
 
169 aa  72.8  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2219  conserved hypothetical protein  35.38 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0123  hypothetical protein  37 
 
 
176 aa  67.4  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  40.43 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_534  hypothetical protein  33.85 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0569  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  35.38 
 
 
162 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00359855  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0853  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  36.59 
 
 
172 aa  62.4  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.313328  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0594  hypothetical protein  33.85 
 
 
159 aa  62.8  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.797474  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1369  hypothetical protein  35.88 
 
 
181 aa  61.6  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0814  hypothetical protein  34.65 
 
 
146 aa  61.2  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.47066 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0141  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  60.8  0.000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0775358 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12514  hypothetical protein  26.06 
 
 
207 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.95195e-34  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1975  hypothetical protein  32.28 
 
 
149 aa  59.7  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3727  hypothetical protein  31.47 
 
 
154 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2644  P450 cytochrome, putative  32.14 
 
 
163 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1549  P450 cytochrome, putative  35.56 
 
 
161 aa  59.3  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30378  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3460  MCP1; molybdenum cofactor carrier protein  32.14 
 
 
163 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0796  hypothetical protein  33.09 
 
 
155 aa  58.5  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4521  P450 cytochrome, putative  33.59 
 
 
165 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.136581 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_587  hypothetical protein  29.28 
 
 
196 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756332  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1307  hypothetical protein  34.75 
 
 
148 aa  57  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0153  hypothetical protein  43.21 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0307047 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3898  hypothetical protein  33.14 
 
 
261 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2411  hypothetical protein  29.17 
 
 
176 aa  55.1  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.19576 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4352  lysine decarboxylase family protein  33.06 
 
 
168 aa  54.7  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.383746  normal  0.682676 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1458  Rossmann fold nucleotide-binding protein  35.38 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0547  acyl-CoA synthetase  34.06 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1012  hypothetical protein  33.82 
 
 
157 aa  53.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.535443  normal  0.791776 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0619  hypothetical protein  27.84 
 
 
209 aa  52.8  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505502  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1584  hypothetical protein  35.85 
 
 
162 aa  52.8  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0315966  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1965  hypothetical protein  35.96 
 
 
148 aa  52  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31453  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  31.55 
 
 
269 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  30.86 
 
 
229 aa  50.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1191  hypothetical protein  41.89 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3064  hypothetical protein  24.43 
 
 
342 aa  48.9  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00713435  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0153  hypothetical protein  29.49 
 
 
176 aa  48.9  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0682  hypothetical protein  29.91 
 
 
138 aa  47.8  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.304862  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0648  hypothetical protein  29.91 
 
 
138 aa  47.8  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0149503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2931  hypothetical protein  32.59 
 
 
178 aa  47.8  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0411  hypothetical protein  35.58 
 
 
157 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.556194 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3710  hypothetical protein  24.29 
 
 
351 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000239361  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  27.47 
 
 
240 aa  47.4  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2033  hypothetical protein  30.69 
 
 
154 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  32.59 
 
 
266 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0356  hypothetical protein  29.84 
 
 
181 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.329787  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  28.87 
 
 
267 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1788  hypothetical protein  29.84 
 
 
170 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  27.39 
 
 
247 aa  45.8  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2145  Rossmann fold nucleotide-binding protein  33.68 
 
 
161 aa  45.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  29.05 
 
 
225 aa  45.1  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0512  hypothetical protein  39.13 
 
 
154 aa  45.1  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.602791  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1201  hypothetical protein  30.25 
 
 
243 aa  44.7  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0446  hypothetical protein  23.9 
 
 
235 aa  44.7  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1904  decarboxylase family protein  25 
 
 
342 aa  44.7  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0178748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1780  hypothetical protein  28.57 
 
 
218 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00264225  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3045  hypothetical protein  25.76 
 
 
342 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00166986  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1504  hypothetical protein  22.7 
 
 
352 aa  43.9  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0023514 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0899  hypothetical protein  27.4 
 
 
340 aa  44.3  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.114072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1267  hypothetical protein  24.26 
 
 
342 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.13698e-16  decreased coverage  0.00000000000243562 
 
 
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  30.94 
 
 
267 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  34.43 
 
 
332 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  29.19 
 
 
280 aa  43.9  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  26.71 
 
 
271 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2479  hypothetical protein  30.28 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  30 
 
 
289 aa  43.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0404  Rossmann fold nucleotide-binding protein  25.61 
 
 
221 aa  43.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.115936 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  29.41 
 
 
266 aa  43.5  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  32.62 
 
 
287 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  27.27 
 
 
272 aa  42.7  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1241  Rossmann fold nucleotide-binding protein  24.4 
 
 
198 aa  42.7  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  28.16 
 
 
294 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  31.41 
 
 
241 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  32.05 
 
 
248 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  28.37 
 
 
283 aa  42  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  24.46 
 
 
301 aa  42  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  29.5 
 
 
216 aa  41.6  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  28 
 
 
284 aa  41.6  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  30.13 
 
 
264 aa  41.6  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1602  hypothetical protein  27.62 
 
 
218 aa  41.2  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0971  hypothetical protein  28.57 
 
 
199 aa  40.8  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0184456  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  26.19 
 
 
299 aa  40.8  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>