11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0648 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0648  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0149503  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0682  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.304862  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_587  hypothetical protein  93.48 
 
 		 196 aa  263  5.999999999999999e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756332  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0619  hypothetical protein  92.75 
 
 		 209 aa  261  2e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505502  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  29.91 
 
 		 181 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1369  hypothetical protein  37.5 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0613  hypothetical protein  34.15 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0123  hypothetical protein  32.53 
 
 		 176 aa  42  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0141  hypothetical protein  32.14 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0775358 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  28.57 
 
 		 171 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0853  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  31.71 
 
 		 172 aa  40  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>