More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_12211 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_12211  dehydrogenase  100 
 
 
294 aa  609  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.316821  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1495  putative dape protein  79.73 
 
 
291 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.395565  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0462  putative dape gene and orf2  66.07 
 
 
282 aa  408  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11771  Rossmann fold nucleotide-binding protein  66.07 
 
 
282 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0454643 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16211  dehydrogenase  69.92 
 
 
288 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1542  hypothetical protein  54.32 
 
 
304 aa  325  4.0000000000000003e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0225266  normal  0.747447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1298  hypothetical protein  44.78 
 
 
288 aa  265  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0464  hypothetical protein  48.29 
 
 
299 aa  260  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1265  hypothetical protein  43.8 
 
 
288 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0810477  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0454  decarboxylase family protein  42.54 
 
 
318 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2756  decarboxylase family protein  42.54 
 
 
292 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2614  decarboxylase family protein  42.54 
 
 
292 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.672113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1022  decarboxylase family protein  42.54 
 
 
315 aa  248  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1327  decarboxylase family protein  42.16 
 
 
319 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0158  decarboxylase family protein  42.16 
 
 
319 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0183  decarboxylase family protein  42.16 
 
 
319 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2487  hypothetical protein  45.66 
 
 
287 aa  245  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.100188 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1373  hypothetical protein  45.66 
 
 
287 aa  244  9e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1082  hypothetical protein  46.04 
 
 
301 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.868958  normal  0.280339 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2235  hypothetical protein  44.44 
 
 
287 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5908  hypothetical protein  41.28 
 
 
342 aa  242  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0391937  normal  0.412056 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0641  hypothetical protein  45.8 
 
 
297 aa  242  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.576648  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4735  hypothetical protein  44.53 
 
 
289 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.691032 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2099  hypothetical protein  44.72 
 
 
303 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0269  hypothetical protein  42.69 
 
 
270 aa  239  5e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6192  hypothetical protein  40.79 
 
 
342 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.194706  normal  0.269121 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0045  hypothetical protein  45.1 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1355  hypothetical protein  40.78 
 
 
279 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774682  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0968  hypothetical protein  40.78 
 
 
279 aa  233  3e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1027  hypothetical protein  40.78 
 
 
276 aa  232  5e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1132  hypothetical protein  43.92 
 
 
274 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1095  hypothetical protein  40.37 
 
 
275 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537193  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3301  hypothetical protein  42.05 
 
 
301 aa  229  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0516405  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3075  hypothetical protein  43.38 
 
 
287 aa  229  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.162736 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2793  hypothetical protein  43.92 
 
 
268 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1322  hypothetical protein  43.45 
 
 
272 aa  228  7e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2341  hypothetical protein  42.8 
 
 
284 aa  228  9e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.97784 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  42.14 
 
 
273 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0063  hypothetical protein  43.68 
 
 
288 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0080  hypothetical protein  43.3 
 
 
288 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.569789  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2515  hypothetical protein  43.4 
 
 
284 aa  226  3e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921995  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0004  hypothetical protein  42.21 
 
 
285 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2105  hypothetical protein  44.87 
 
 
305 aa  225  7e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0622096 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0471  hypothetical protein  41.13 
 
 
292 aa  225  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0540  hypothetical protein  40.98 
 
 
299 aa  224  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.612157  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1777  hypothetical protein  43.18 
 
 
297 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0477  hypothetical protein  43.07 
 
 
292 aa  223  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0386  hypothetical protein  44.91 
 
 
283 aa  219  5e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254572  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  43.94 
 
 
276 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1624  hypothetical protein  41.29 
 
 
287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.216103  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0872  hypothetical protein  42.18 
 
 
302 aa  215  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.128408  normal  0.238224 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0619  hypothetical protein  43.46 
 
 
291 aa  215  7e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.437288  normal  0.868848 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7791  hypothetical protein  40.23 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3012  hypothetical protein  42.65 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.290365 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0149  hypothetical protein  41.42 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1359  hypothetical protein  42.53 
 
 
285 aa  210  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.220346  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0070  hypothetical protein  44.11 
 
 
299 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.631232  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4407  hypothetical protein  41.63 
 
 
318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0347  hypothetical protein  42.26 
 
 
279 aa  198  9e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3325  hypothetical protein  41.47 
 
 
251 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2839  hypothetical protein  41.96 
 
 
271 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0590  hypothetical protein  51.81 
 
 
175 aa  189  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1009  hypothetical protein  49.62 
 
 
147 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0357  hypothetical protein  44 
 
 
245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.764349 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  48.19 
 
 
225 aa  143  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  43.5 
 
 
266 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  39.3 
 
 
229 aa  142  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  44.51 
 
 
273 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  50 
 
 
266 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  50 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  46.05 
 
 
245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  45.18 
 
 
263 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  49.31 
 
 
263 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  43.2 
 
 
258 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  43.17 
 
 
217 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  37.44 
 
 
280 aa  135  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  42.68 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  37.89 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  41.28 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  35.47 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  46.58 
 
 
245 aa  134  3e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  40.7 
 
 
317 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  36.44 
 
 
263 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  40.12 
 
 
317 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  44.67 
 
 
229 aa  132  6.999999999999999e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  38.21 
 
 
239 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2461  hypothetical protein  42.39 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000124566  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  42.35 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  41.46 
 
 
239 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  36.22 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  46.62 
 
 
241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  35.17 
 
 
269 aa  129  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  46.53 
 
 
259 aa  128  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  41.62 
 
 
235 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2047  hypothetical protein  45.21 
 
 
245 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0014212  normal  0.263203 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  38.42 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  37.86 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0299  hypothetical protein  50 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000150026  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  42.11 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11220  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  34.08 
 
 
266 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>