More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0562 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0562  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
368 aa  737    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2521  putative glycosyl transferase, group 1  28.39 
 
 
385 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329961  normal  0.025801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0840  glycosyl transferase group 1  31.38 
 
 
398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.755568 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1148  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000501847  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3572  glycosyl transferase, group 1  28.88 
 
 
389 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.483254  normal  0.0128829 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1066  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.552097 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3112  group 1 glycosyl transferase  27.34 
 
 
390 aa  108  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0909  HepB protein  26.09 
 
 
388 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2237  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
388 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2614  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.09 
 
 
388 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.419161  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2476  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.09 
 
 
388 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1964  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
388 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2267  glycosyl transferase, group 1  25.48 
 
 
388 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370121  normal  0.159353 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4910  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
388 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.314758  hitchhiker  0.000347122 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3732  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 
388 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0552  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  24.91 
 
 
388 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.284297  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4534  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 
388 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429646  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5555  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 
388 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.225972  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3829  glycosyl transferase, group 1  25.1 
 
 
388 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00562518  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3695  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 
388 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166947  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 
386 aa  96.7  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.32 
 
 
382 aa  94.7  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0377  glycosyl transferase group 1  22.61 
 
 
404 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000391271  normal  0.137742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
381 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
374 aa  87  5e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  27.31 
 
 
769 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  29 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 
408 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
405 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0847  glycosyl transferase, group 1  32.87 
 
 
470 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00700001 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2645  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.490098  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12216  hypothetical protein  28.97 
 
 
385 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4328  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  32.26 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00438832  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 
427 aa  79.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  33.02 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  29.41 
 
 
360 aa  77  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4996  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  30.48 
 
 
380 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0180671  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1353  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  23.7 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.652721  normal  0.416501 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  25.53 
 
 
743 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.15 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2586  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 
384 aa  74.3  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  31.05 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  27.05 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 
425 aa  73.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
380 aa  73.2  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  29.17 
 
 
358 aa  72.8  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3857  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 
423 aa  72.8  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 
378 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.1 
 
 
396 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.11 
 
 
446 aa  72.8  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  24.46 
 
 
376 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
424 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12629  alpha-mannosyltransferase pimA  29.71 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  29.17 
 
 
388 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 
422 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
400 aa  72  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  30.05 
 
 
364 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1579  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 
358 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.12364  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  23.21 
 
 
346 aa  71.2  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  28.89 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
426 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0579  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 
398 aa  71.2  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  26.83 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2935  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.577866  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 
395 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  23.08 
 
 
398 aa  70.5  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02595  glycosyltransferase  24.02 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157205  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3047  glycosyl transferase group 1  29.89 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.284334  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3296  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  33.94 
 
 
770 aa  70.5  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
341 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  32.7 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 
381 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3398  glycosyl transferase group 1  29.25 
 
 
382 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3285  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2695  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3347  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0957138  normal  0.0861917 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1821  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.500985 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  23.8 
 
 
378 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3596  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
393 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0580  glycosyl transferase group 1  25.44 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0295  phosphatidylinositol glycan-class A  28.88 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14970  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.47 
 
 
381 aa  69.3  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  24.9 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  25.3 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1997  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.336344 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0197  glycosyl transferase group 1  30.6 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  34.33 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  23.38 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>