More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2268 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_2022  cysteinyl-tRNA synthetase  66.32 
 
 
492 aa  700    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.837367  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00790  cysteinyl-tRNA synthetase  69.29 
 
 
495 aa  719    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2268  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
492 aa  1028    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.481434  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0485  cysteinyl-tRNA synthetase  59.42 
 
 
486 aa  621  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1878  cysteinyl-tRNA synthetase  57.08 
 
 
490 aa  605  9.999999999999999e-173  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3906  cysteinyl-tRNA synthetase  55.13 
 
 
500 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0469019  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5552  cysteinyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 
499 aa  561  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0857  cysteinyl-tRNA synthetase  54.03 
 
 
499 aa  553  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3418  cysteinyl-tRNA synthetase  51.59 
 
 
497 aa  541  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0619  hypothetical protein  49.9 
 
 
495 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2198  cysteinyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 
484 aa  475  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2264  cysteinyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
484 aa  473  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0988589 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1818  cysteinyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 
480 aa  474  1e-132  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2033  cysteinyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 
481 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.570064  normal  0.0642748 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0320  cysteinyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 
484 aa  462  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0211  cysteinyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 
483 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2392  cysteinyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
484 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1698  cysteinyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
481 aa  440  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.261335  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1714  cysteinyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
497 aa  409  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.594811  normal  0.364726 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1805  cysteinyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
481 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000188358  normal  0.435527 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
485 aa  373  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
500 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2110  cysteinyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
460 aa  366  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000230638 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
461 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000668205  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0398  cysteinyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
477 aa  361  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000244083  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
460 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
487 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 
459 aa  353  4e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 
484 aa  353  5e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0530  cysteinyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
460 aa  353  5e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.474927  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1538  cysteinyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
459 aa  352  7e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.205032  hitchhiker  0.0027552 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1666  cysteinyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
458 aa  352  7e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.226197  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0313  cysteinyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 
476 aa  352  1e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.625731 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
493 aa  350  2e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1271  cysteinyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
456 aa  350  4e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
481 aa  350  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
459 aa  350  4e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1599  cysteinyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
476 aa  349  6e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000906806  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
460 aa  348  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
456 aa  348  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1270  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
456 aa  347  2e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
494 aa  347  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1221  cysteinyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
459 aa  348  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000543718  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2684  cysteinyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
459 aa  347  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000025745  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
480 aa  347  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3324  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
470 aa  347  4e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0251973  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
486 aa  346  4e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2511  cysteinyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
459 aa  346  6e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000706228  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2599  cysteinyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
460 aa  344  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00582653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 
459 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
481 aa  343  4e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
460 aa  342  9e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0534  cysteinyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
476 aa  342  1e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0472255  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
485 aa  342  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3014  cysteinyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
461 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000439481  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1278  cysteinyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
461 aa  341  1e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3653  cysteinyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
465 aa  342  1e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0242  cysteinyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
459 aa  341  2e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3152  cysteinyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
461 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287269  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2664  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
461 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000406523  normal  0.136129 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
462 aa  340  4e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
480 aa  340  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
490 aa  339  5e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1590  cysteinyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
459 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000784367  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1624  cysteinyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
459 aa  339  5.9999999999999996e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000105095  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
461 aa  339  7e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1791  cysteinyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
459 aa  339  8e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
479 aa  339  8e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
493 aa  338  9e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1589  cysteinyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
487 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.354492  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2566  cysteinyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
461 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000164638  normal  0.0688617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1487  cysteinyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
461 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000012906  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
488 aa  338  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2753  cysteinyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
459 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000279239  normal  0.0782158 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2498  cysteinyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
461 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000973737  normal  0.0233858 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2933  cysteinyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
461 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.395948  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
461 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0590  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
461 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00144184  normal  0.0627987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0645  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
461 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.108038  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0585  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
461 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0307581  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0582  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
461 aa  337  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.193345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0571  cysteinyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
461 aa  336  5e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000388833  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2484  cysteinyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
476 aa  335  9e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000672423  normal  0.0231509 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00476  cysteinyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
461 aa  335  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0063567  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3087  cysteinyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
461 aa  335  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0601  cysteinyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
461 aa  335  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000694006  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3096  cysteinyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
461 aa  335  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0232678  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
466 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1601  cysteinyl-tRNA synthetase  40.65 
 
 
459 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000105927  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 
488 aa  335  1e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00481  hypothetical protein  41.06 
 
 
461 aa  335  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114278  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0566  cysteinyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
461 aa  335  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1439  cysteinyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
459 aa  334  2e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326973  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1248  cysteinyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 
461 aa  334  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000407868  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
465 aa  334  2e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0583  cysteinyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
461 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000237473  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2660  cysteinyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
461 aa  334  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0958679  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2592  cysteinyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 
785 aa  334  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1345  cysteinyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
461 aa  333  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.164999  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0627  cysteinyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
461 aa  333  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.589324 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>