136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1060 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1060  nucleoside:H+ symporter  100 
 
 
412 aa  825    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1196  nucleoside:H symporter  80.92 
 
 
415 aa  671    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.352797  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1276  nucleoside:H symporter  76.76 
 
 
414 aa  628  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3058  nucleoside:H symporter  75.36 
 
 
414 aa  624  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4570  nucleoside:H symporter  60.19 
 
 
419 aa  493  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3651  nucleoside:H symporter  45.71 
 
 
400 aa  344  2e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1744  nucleoside:H symporter  44.66 
 
 
421 aa  339  5e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2688  nucleoside:H+ symporter  42.75 
 
 
406 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00432  putative nucleoside permease protein  42.61 
 
 
397 aa  310  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1048  nucleoside:H symporter  45.12 
 
 
405 aa  306  5.0000000000000004e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0520  nucleoside:H symporter  42.64 
 
 
404 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000056918  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0765  nucleoside:H+ symporter  42.75 
 
 
410 aa  300  4e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1157  nucleoside:H symporter  40.79 
 
 
402 aa  299  8e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.909925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2982  nucleoside:H symporter  40.32 
 
 
396 aa  282  9e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.191315  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2374  nucleoside transporter  37.99 
 
 
438 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2285  nucleoside transporter  37.99 
 
 
438 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2486  nucleoside transporter  37.99 
 
 
423 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2329  nucleoside transporter  37.99 
 
 
423 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2378  nucleoside transporter  37.99 
 
 
423 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0966  nucleoside transporter  37.28 
 
 
425 aa  268  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.998859 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3077  nucleoside transporter  37.28 
 
 
425 aa  268  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0170567 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02026  predicted nucleoside transporter  37.28 
 
 
425 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01990  hypothetical protein  37.28 
 
 
425 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1559  nucleoside transporter  37.28 
 
 
425 aa  267  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0908002  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2234  nucleoside transporter  37.28 
 
 
425 aa  267  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.631238  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2386  nucleoside transporter  37.28 
 
 
425 aa  267  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1549  nucleoside transporter  37.28 
 
 
425 aa  267  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364753  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1140  nucleoside transporter  37.28 
 
 
425 aa  267  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.102088  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0999  nucleoside transporter  38.95 
 
 
425 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.501568  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3311  nucleoside transporter  38.14 
 
 
425 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1836  nucleoside permease NupG  35.37 
 
 
411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0135  nucleoside transporter  35.63 
 
 
414 aa  216  8e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2054  nucleoside transporter  31.78 
 
 
422 aa  215  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0184086 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3369  nucleoside transporter  31.62 
 
 
418 aa  195  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0464551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4254  nucleoside transporter  32.76 
 
 
419 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394027 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2823  xanthosine transporter XapB  31.51 
 
 
418 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2910  nucleoside transporter  31.51 
 
 
418 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2933  nucleoside transporter  31.94 
 
 
418 aa  191  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000555084  normal  0.107276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2757  nucleoside transporter  30.2 
 
 
458 aa  189  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3362  nucleoside permease NupG  31.37 
 
 
418 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.315721  normal  0.195044 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3354  nucleoside permease NupG  31.37 
 
 
418 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.650502  normal  0.93107 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3288  nucleoside permease NupG  31.37 
 
 
418 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.407193  normal  0.0115018 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3277  nucleoside permease NupG  31.37 
 
 
418 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3457  nucleoside permease NupG  31.37 
 
 
418 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.693342  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02794  nucleoside transporter  32.03 
 
 
418 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.330512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0731  nucleoside transporter  32.03 
 
 
418 aa  182  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1256  nucleoside transporter  31.2 
 
 
418 aa  182  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000485515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3125  nucleoside permease NupG  32.03 
 
 
418 aa  182  7e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0750  nucleoside transporter  32.03 
 
 
418 aa  182  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0641678 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02757  hypothetical protein  32.03 
 
 
418 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3108  nucleoside permease NupG  32.03 
 
 
418 aa  182  7e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00661547 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3397  nucleoside permease NupG  32.03 
 
 
418 aa  182  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4268  nucleoside permease NupG  32.03 
 
 
418 aa  182  7e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.218652  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2560  xanthosine permease XapB  31.2 
 
 
418 aa  181  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000874021  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3310  nucleoside permease NupG  31.78 
 
 
418 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2656  nucleoside permease NupG  32.11 
 
 
418 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00901529  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2614  nucleoside permease NupG  32.11 
 
 
418 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2680  nucleoside permease NupG  32.11 
 
 
418 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2786  nucleoside permease NupG  32.11 
 
 
418 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.055348  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2565  nucleoside permease NupG  32.11 
 
 
418 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000926787  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2951  nucleoside:H symporter  29.77 
 
 
459 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.291291  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3166  nucleoside:H+ symporter  32.96 
 
 
406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.306334  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4612  nucleoside:H symporter  32.12 
 
 
416 aa  131  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.913784  normal  0.258863 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2676  major facilitator transporter  24.92 
 
 
387 aa  87.4  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2136  major facilitator transporter  25.47 
 
 
383 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0149508  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  24.46 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1470  major facilitator transporter  25 
 
 
389 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1417  major facilitator transporter  24.68 
 
 
389 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1482  major facilitator transporter  24.68 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.51867  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2382  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1537  major facilitator transporter  22.31 
 
 
385 aa  67  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3078  major facilitator family protein, putative  25.4 
 
 
389 aa  66.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1608  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 
391 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111571  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2666  major facilitator transporter  24.21 
 
 
390 aa  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2751  major facilitator transporter  25.82 
 
 
391 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2450  major facilitator transporter  24.43 
 
 
391 aa  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.144004  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2845  major facilitator transporter  25.82 
 
 
391 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000827001 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2768  major facilitator transporter  25.45 
 
 
391 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0162365  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  23.88 
 
 
384 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1227  major facilitator transporter  25 
 
 
380 aa  60.8  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0164577 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1813  major facilitator transporter  25.23 
 
 
389 aa  60.8  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.652379  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1922  major facilitator transporter  22.35 
 
 
382 aa  60.1  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1923  putative transporter  23.29 
 
 
386 aa  59.7  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.598404 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1538  major facilitator transporter  24.13 
 
 
399 aa  59.7  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3016  major facilitator transporter  23.42 
 
 
389 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  normal  0.571709 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3834  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 
397 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.494321  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2090  transporter, putative  22.62 
 
 
380 aa  58.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0703  transporter, putative  22.89 
 
 
382 aa  57.4  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405472  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  24.14 
 
 
389 aa  57.8  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3751  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 
397 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.149553  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2587  major facilitator transporter  24.15 
 
 
387 aa  57  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1162  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.61 
 
 
385 aa  56.2  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.92917e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1269  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.61 
 
 
385 aa  56.6  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000298411  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  24.48 
 
 
378 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1639  major facilitator transporter  21.8 
 
 
385 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0442  putative 3-phenylpropionic acid transporter  23.61 
 
 
385 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000923694  hitchhiker  0.00000109334 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3590  putative MFS metabolite transporter  25.5 
 
 
383 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3693  major facilitator transporter  25.6 
 
 
397 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.14571  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  21.83 
 
 
378 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2415  major facilitator transporter  24.41 
 
 
402 aa  52.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>