76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0961 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0961  GumN family protein  100 
 
 
264 aa  532  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.361716  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0526  GumN family protein  63.64 
 
 
264 aa  353  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0417  GumN family protein  63.64 
 
 
264 aa  353  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0559  GumN family protein  63.64 
 
 
264 aa  353  2e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0574  GumN family protein  63.64 
 
 
264 aa  353  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.911473  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3128  GumN family protein  63.64 
 
 
264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.485746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0521  GumN family protein  63.26 
 
 
264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3134  GumN family protein  63.64 
 
 
264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0811672  unclonable  0.0000000151783 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00438  hypothetical protein  63.64 
 
 
264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.33911  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00433  hypothetical protein  63.64 
 
 
264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0560  GumN family protein  65.53 
 
 
264 aa  343  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.929078  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0545  GumN family protein  65.53 
 
 
264 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0568025  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0543  GumN family protein  65.53 
 
 
264 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0604  GumN family protein  65.53 
 
 
264 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0456254  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0550  GumN family protein  65.53 
 
 
264 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.234425  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1149  GumN family protein  58.4 
 
 
267 aa  311  4.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0189733  hitchhiker  0.000000336245 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3028  GumN family protein  56.65 
 
 
269 aa  290  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3166  GumN family protein  57.03 
 
 
269 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.288645  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1264  hypothetical protein  57.03 
 
 
269 aa  290  2e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0145609 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1030  hypothetical protein  55.56 
 
 
275 aa  275  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3221  GumN family protein  54.58 
 
 
272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1094  GumN family protein  54.58 
 
 
272 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3028  GumN family protein  54.58 
 
 
270 aa  259  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004192  hypothetical protein  31.58 
 
 
290 aa  112  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000160824  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1812  hypothetical protein  31.97 
 
 
298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01264  hypothetical protein  28.8 
 
 
310 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3317  GumN family protein  28.12 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.174561  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3524  GumN family protein  27.46 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3151  hypothetical protein  29.57 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0272  GumN family protein  22.87 
 
 
312 aa  67  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1648  GumN family protein  26.05 
 
 
295 aa  65.5  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.54931  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3077  GumN family protein  26.09 
 
 
310 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.916248  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4096  GumN  25.71 
 
 
287 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1615  GumN  24.31 
 
 
323 aa  63.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.733049  normal  0.353745 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0672  GumN  27.89 
 
 
324 aa  62.8  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2114  GumN  28.63 
 
 
300 aa  62  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00408  GumN protein  27.52 
 
 
323 aa  61.6  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0516  GumN family protein  29.44 
 
 
300 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131008  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3934  GumN family protein  29.44 
 
 
300 aa  60.1  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1668  GumN family protein  24.38 
 
 
294 aa  60.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3752  GumN family protein  29.44 
 
 
300 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00922347  normal  0.122276 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0593  GumN  26.02 
 
 
353 aa  60.1  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.166744  normal  0.0303049 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3808  GumN family protein  28.89 
 
 
300 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133222  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3263  GumN family protein  27.14 
 
 
329 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4737  hypothetical protein  23.53 
 
 
296 aa  55.8  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0615  hypothetical protein  23.64 
 
 
293 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03569  GumN  26.48 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0208188  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3722  GumN family protein  26.46 
 
 
294 aa  53.9  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000175379  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0941  GumN family protein  24.12 
 
 
335 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0556  GumN family protein  30.34 
 
 
298 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3473  GumN family protein  30.34 
 
 
298 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0557  GumN family protein  30.34 
 
 
298 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4343  GumN family protein  25.93 
 
 
294 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2752  GumN family protein  24.81 
 
 
318 aa  52.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.597499 
 
 
-
 
NC_004310  BR1917  hypothetical protein  24.21 
 
 
333 aa  51.2  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0557  hypothetical protein  24.27 
 
 
298 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1846  hypothetical protein  24.21 
 
 
333 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.123218  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4856  GumN family protein  24.81 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0939  putative lipoprotein  23.72 
 
 
311 aa  50.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.344741  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2749  hypothetical protein  27.05 
 
 
297 aa  49.3  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4115  hypothetical protein  25 
 
 
371 aa  48.9  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4776  GumN family protein  27.91 
 
 
401 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0438  GumN family protein  29.17 
 
 
294 aa  47  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.677318  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0609  GumN family protein  26.39 
 
 
293 aa  46.2  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000097988  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3059  GumN family protein  26.52 
 
 
381 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0473829 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3040  GumN family protein  26.52 
 
 
381 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2676  GumN  22.91 
 
 
476 aa  46.2  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2426  GumN  26.52 
 
 
381 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.686082  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0594  GumN  22.14 
 
 
356 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.241158  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2951  GumN family protein  25.99 
 
 
381 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1127  GumN family protein  26.74 
 
 
337 aa  43.5  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2887  GumN family protein  26.47 
 
 
252 aa  43.5  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.301907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6387  GumN family protein  25.45 
 
 
381 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1113  GumN family protein  23.97 
 
 
323 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.052625  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3085  GumN family protein  25.63 
 
 
381 aa  42.7  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1052  hypothetical protein  19.05 
 
 
252 aa  42  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.411667  normal  0.0333644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>