More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0684 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1354  prolyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 
570 aa  644    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000653795  hitchhiker  4.6338400000000005e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0684  prolyl-tRNA synthetase  100 
 
 
573 aa  1186    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975412  hitchhiker  0.000000000000032501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2798  prolyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 
585 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0211656  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1460  prolyl-tRNA synthetase  54.45 
 
 
570 aa  630  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0869811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1334  prolyl-tRNA synthetase  54.18 
 
 
573 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000102845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2891  prolyl-tRNA synthetase  54.01 
 
 
573 aa  625  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1753  prolyl-tRNA synthetase  54.12 
 
 
576 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000186483  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2206  prolyl-tRNA synthetase  52.71 
 
 
574 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0121  prolyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 
575 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.367182 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0682  prolyl-tRNA synthetase  51.04 
 
 
571 aa  592  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00474579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1723  prolyl-tRNA synthetase  50.44 
 
 
574 aa  590  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0632961  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0938  prolyl-tRNA synthetase  50.26 
 
 
580 aa  588  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140271  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0951  prolyl-tRNA synthetase  50 
 
 
574 aa  585  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.789316  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1909  prolyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 
576 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000767961  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1762  prolyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
579 aa  581  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.89022  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07770  prolyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 
568 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1967  prolyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 
569 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3670  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 
566 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3957  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 
566 aa  565  1e-160  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1044  prolyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 
573 aa  565  1e-160  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.000000019894 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3831  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 
566 aa  565  1e-160  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.08087e-60 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1791  prolyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
570 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3560  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 
566 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3578  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 
566 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2132  prolyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 
570 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.490452  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1149  prolyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 
567 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3860  prolyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 
566 aa  561  1e-158  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0450  prolyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
569 aa  561  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.543628  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3866  prolyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 
566 aa  561  1e-158  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.105071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3917  prolyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 
566 aa  560  1e-158  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2471  prolyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 
566 aa  559  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1327  prolyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
566 aa  560  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145538 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3642  prolyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
566 aa  560  1e-158  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3862  prolyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 
584 aa  556  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7101  normal  0.0492158 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0680  prolyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 
574 aa  557  1e-157  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0408  prolyl-tRNA synthetase  49.55 
 
 
577 aa  556  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0380971  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2112  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 
579 aa  555  1e-157  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0680  prolyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 
571 aa  556  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0713263  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0842  prolyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 
570 aa  558  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00522036  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0572  prolyl-tRNA synthetase  50.36 
 
 
572 aa  553  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00211854  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2041  prolyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 
567 aa  548  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0423  prolyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 
577 aa  551  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0420  prolyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 
573 aa  550  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0589  prolyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 
574 aa  549  1e-155  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0635  prolyl-tRNA synthetase  52.52 
 
 
568 aa  547  1e-154  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.401523  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0749  prolyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 
569 aa  546  1e-154  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3699  prolyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
575 aa  545  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000546929  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0618  prolyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 
566 aa  545  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0892  prolyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 
570 aa  548  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000147274  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2796  prolyl-tRNA synthetase  48.75 
 
 
578 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2947  prolyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 
572 aa  547  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000162722  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2026  prolyl-tRNA synthetase  50.45 
 
 
566 aa  542  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0731  prolyl-tRNA synthetase  49.73 
 
 
569 aa  543  1e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0557  prolyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 
578 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102266  hitchhiker  0.00106773 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3672  prolyl-tRNA synthetase  49.2 
 
 
578 aa  544  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.371804  normal  0.861053 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0515  prolyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 
578 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.6472  normal  0.702798 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0701  prolyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 
568 aa  544  1e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2139  prolyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 
573 aa  543  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0105  prolyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 
578 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0490  prolyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 
578 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0401161  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0587  prolyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 
578 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1767  prolyl-tRNA synthetase  51.17 
 
 
576 aa  543  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.621911  hitchhiker  0.00303994 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1161  prolyl-tRNA synthetase  48.1 
 
 
572 aa  542  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2517  prolyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
578 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0644  prolyl-tRNA synthetase  48.86 
 
 
576 aa  539  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0351712  normal  0.29451 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3201  prolyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 
572 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154366  hitchhiker  0.0000045968 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2738  prolyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 
570 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0503  prolyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 
570 aa  541  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1258  prolyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 
571 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0547668  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0168  prolyl-tRNA synthetase  50.27 
 
 
564 aa  541  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3482  prolyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
578 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.373941  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3520  prolyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
578 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2596  prolyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 
569 aa  537  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.607572  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0439  prolyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
578 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3518  prolyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
578 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0897  prolyl-tRNA synthetase  49.91 
 
 
574 aa  538  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1075  prolyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 
572 aa  536  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1146  prolyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
578 aa  537  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2544  prolyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 
571 aa  536  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.54671  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1125  prolyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 
574 aa  538  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0610859  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2425  prolyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 
570 aa  538  1e-151  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0539  prolyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 
568 aa  535  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847816 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3265  prolyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
578 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1298  prolyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
578 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1503  prolyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
571 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0974844  normal  0.459813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1205  prolyl-tRNA synthetase  50.71 
 
 
571 aa  535  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.363423  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1399  prolyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 
571 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36750  prolyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
571 aa  533  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1234  prolyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 
571 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1276  prolyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 
571 aa  535  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.695644  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1345  prolyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 
570 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0163482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4213  prolyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 
571 aa  532  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.280151  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2873  prolyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
571 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2856  prolyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
571 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.521169  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1735  prolyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 
577 aa  533  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3002  prolyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 
571 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2518  prolyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 
571 aa  529  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.468149  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2646  prolyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 
578 aa  529  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4552  prolyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 
571 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0873  prolyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 
572 aa  529  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.922522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>