More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4319 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  100 
 
 		 312 aa  650    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  66.46 
 
 		 317 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  38.34 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  34.76 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  35.87 
 
 		 335 aa  172  9e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  35.37 
 
 		 335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  35.51 
 
 		 313 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  34.81 
 
 		 308 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  32.4 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  31.46 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  34.12 
 
 		 368 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  31.27 
 
 		 356 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  42.7 
 
 		 406 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  29.54 
 
 		 361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  29.29 
 
 		 342 aa  120  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.66 
 
 		 357 aa  120  3e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  28.45 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  28.87 
 
 		 414 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 		 313 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.2 
 
 		 370 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2462  DNA-cytosine methyltransferase  31.27 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.017331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  31.18 
 
 		 323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  30.23 
 
 		 468 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.79 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  28.91 
 
 		 431 aa  113  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0598  DNA-cytosine methyltransferase  36.6 
 
 		 440 aa  112  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0631504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0394  DNA-cytosine methyltransferase  36.6 
 
 		 440 aa  112  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0349953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  29.02 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 		 418 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 		 418 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  26.98 
 
 		 361 aa  109  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  29.01 
 
 		 374 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  30.38 
 
 		 379 aa  108  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  26.86 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  26.98 
 
 		 398 aa  108  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  33.96 
 
 		 373 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  31.82 
 
 		 345 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  27.6 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  28.93 
 
 		 415 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6992  DNA-cytosine methyltransferase  31.73 
 
 		 454 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_257  DNA-cytosine methyltransferase  29.24 
 
 		 365 aa  105  7e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.62 
 
 		 405 aa  105  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  26.29 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  27.2 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  29.15 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3325  DNA-cytosine methyltransferase  38.69 
 
 		 438 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  27.93 
 
 		 443 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  27.94 
 
 		 434 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  28.13 
 
 		 340 aa  102  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  27.35 
 
 		 361 aa  102  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1377  DNA-cytosine methyltransferase  28.69 
 
 		 362 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  30.37 
 
 		 495 aa  99.8  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5064  DNA-cytosine methyltransferase  34.9 
 
 		 424 aa  99.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 		 386 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.11 
 
 		 395 aa  99  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  28.79 
 
 		 311 aa  99  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  29.39 
 
 		 373 aa  98.2  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4036  DNA-cytosine methyltransferase  27.3 
 
 		 365 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3950  DNA-cytosine methyltransferase  34.47 
 
 		 508 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  27.07 
 
 		 416 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  30.39 
 
 		 421 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  24.62 
 
 		 399 aa  97.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  28.71 
 
 		 305 aa  97.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  32.06 
 
 		 395 aa  96.7  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0528  DNA-cytosine methyltransferase  25.9 
 
 		 354 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  26.58 
 
 		 662 aa  96.3  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  34.48 
 
 		 489 aa  96.3  6e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  33.52 
 
 		 324 aa  95.9  7e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1127  DNA-cytosine methyltransferase  26.85 
 
 		 359 aa  95.9  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000503374  unclonable  0.0000088158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  26.76 
 
 		 348 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4962  DNA-cytosine methyltransferase  30.16 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  26.32 
 
 		 465 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  27.12 
 
 		 364 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.88 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  26.86 
 
 		 348 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1628  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.57 
 
 		 359 aa  94  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0302  DNA-cytosine methyltransferase  26.61 
 
 		 375 aa  94  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  35.75 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  27.88 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  30.8 
 
 		 385 aa  92.8  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7048  DNA-cytosine methyltransferase  24.93 
 
 		 358 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4233  DNA-cytosine methyltransferase  34.62 
 
 		 283 aa  92.8  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0232  C-5 cytosine-specific DNA methylase  27.27 
 
 		 415 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.547554  decreased coverage  0.000406028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 		 446 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  26.39 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  26.84 
 
 		 350 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  31.87 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3920  DNA-cytosine methyltransferase  26.57 
 
 		 358 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0526  DNA-cytosine methyltransferase  25.91 
 
 		 377 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000243641  normal  0.870196 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  27.12 
 
 		 425 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  31.02 
 
 		 431 aa  90.1  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  28.43 
 
 		 409 aa  90.1  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  32.18 
 
 		 437 aa  89.7  5e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  27.41 
 
 		 320 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  26.75 
 
 		 388 aa  89.4  7e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  28.4 
 
 		 320 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  32.95 
 
 		 338 aa  89.4  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  26.55 
 
 		 350 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  32.09 
 
 		 460 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  25.75 
 
 		 337 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.301699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>