More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2389 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  98.23 
 
 		 396 aa  780    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2465  quinolone resistence NorA protein  85.64 
 
 		 396 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.109645 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  100 
 
 		 396 aa  795    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2416  quinolone resistence NorA protein  85.64 
 
 		 396 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2520  quinolone resistence NorA protein  85.89 
 
 		 396 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.531616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2624  quinolone resistence NorA protein  85.89 
 
 		 405 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.321756 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  37.3 
 
 		 399 aa  263  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  37.03 
 
 		 399 aa  262  8e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  37.03 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  37.03 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  37.03 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  36.76 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  36.76 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  36.76 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  36.76 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 399 aa  259  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 399 aa  259  7e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0161  major facilitator superfamily permease  33.25 
 
 		 392 aa  227  3e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  35.18 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  34.63 
 
 		 381 aa  222  7e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  34.63 
 
 		 381 aa  222  9e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  34.35 
 
 		 381 aa  222  9e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  34.63 
 
 		 381 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  34.63 
 
 		 381 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  33.59 
 
 		 381 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  34.07 
 
 		 381 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  35.54 
 
 		 381 aa  216  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  32.53 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  32.53 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  31.99 
 
 		 400 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  31.99 
 
 		 400 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 447 aa  202  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  31.99 
 
 		 400 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  30.93 
 
 		 506 aa  202  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  30.93 
 
 		 506 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 		 396 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  31.72 
 
 		 399 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  31.28 
 
 		 505 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  31 
 
 		 400 aa  196  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0859  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 392 aa  195  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0779816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2252  major facilitator superfamily MFS_1  34.87 
 
 		 401 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  30.91 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  30.49 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0038  major facilitator superfamily permease  31.84 
 
 		 401 aa  187  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1734  transporter, putative  30.26 
 
 		 400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2291  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 403 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0195371  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2333  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 403 aa  181  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00380329  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 		 401 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1847  drug transporter, putative  29.4 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.350874  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23210  arabinose efflux permease family protein  31.06 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2540  major facilitator superfamily permease  31.16 
 
 		 405 aa  157  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.937088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 404 aa  155  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0967  major facilitator superfamily transporter  28.65 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.955052  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2815  major facilitator superfamily MFS_1  28.67 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0033693  hitchhiker  0.00275134 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  29.41 
 
 		 402 aa  137  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 		 410 aa  133  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 		 419 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0367  quinolone resistence protein major facilitator family transporter  26.94 
 
 		 370 aa  114  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  22.79 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  27.06 
 
 		 409 aa  101  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 410 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1880  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  23.32 
 
 		 395 aa  93.6  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 406 aa  93.2  7e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  24.56 
 
 		 411 aa  92.8  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0375  major facilitator superfamily permease  23.44 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00039813  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4610  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 395 aa  89.7  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000316795  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 412 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 376 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 387 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2468  putative transport protein  23.47 
 
 		 390 aa  86.7  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 386 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  25.88 
 
 		 400 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 408 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2991  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  26.76 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1378  major facilitator superfamily permease  25.16 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000192638  hitchhiker  0.00000000000893216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0424  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  24.61 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2489  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2538  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000106699  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  26.04 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2764  transporter, putative  25.53 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0479681  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  25.52 
 
 		 391 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  25.22 
 
 		 383 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  25.78 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  25.45 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  24.12 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  21.94 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  25.26 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2367  transporter, putative  25.38 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>