72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0331 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  93.23 
 
 		 1417 aa  2646    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  100 
 
 		 1417 aa  2875    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  91.32 
 
 		 1418 aa  2630    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  98.75 
 
 		 410 aa  686    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  94.41 
 
 		 1396 aa  2660    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  94.7 
 
 		 1417 aa  2723    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  98.97 
 
 		 295 aa  629  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  98.63 
 
 		 292 aa  629  1e-178  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  34.05 
 
 		 2933 aa  612  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  33.55 
 
 		 2296 aa  544  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  33.69 
 
 		 2795 aa  529  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  31.37 
 
 		 1746 aa  523  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  33.74 
 
 		 1976 aa  522  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  33.05 
 
 		 2933 aa  473  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  38.7 
 
 		 1075 aa  474  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  38.76 
 
 		 1050 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  38.76 
 
 		 1075 aa  473  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  45.47 
 
 		 2367 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  45.47 
 
 		 2383 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  45.47 
 
 		 2358 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  45.47 
 
 		 2620 aa  470  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  45.47 
 
 		 2358 aa  465  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  33.41 
 
 		 5337 aa  462  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  33.28 
 
 		 4953 aa  460  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  34.91 
 
 		 1084 aa  416  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  37.26 
 
 		 969 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  37.26 
 
 		 941 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  39.54 
 
 		 934 aa  335  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  38.07 
 
 		 730 aa  280  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  37.31 
 
 		 730 aa  273  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  37.31 
 
 		 730 aa  273  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  37.31 
 
 		 730 aa  273  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  37.31 
 
 		 730 aa  265  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  35.53 
 
 		 724 aa  261  8e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.440388 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  33.85 
 
 		 497 aa  221  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  35.79 
 
 		 468 aa  214  7.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  34.11 
 
 		 509 aa  205  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  34.11 
 
 		 474 aa  204  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  34.11 
 
 		 474 aa  204  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  33.68 
 
 		 474 aa  201  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.125708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  33.59 
 
 		 474 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  35.64 
 
 		 476 aa  198  5.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  35.64 
 
 		 464 aa  198  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  35.64 
 
 		 476 aa  198  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  35.64 
 
 		 464 aa  198  8.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  35.64 
 
 		 464 aa  197  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10975 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  35.64 
 
 		 417 aa  197  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  35.64 
 
 		 417 aa  197  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  35.36 
 
 		 464 aa  196  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  35.08 
 
 		 464 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  33.24 
 
 		 660 aa  187  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  32.77 
 
 		 660 aa  187  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  32.77 
 
 		 660 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  33.05 
 
 		 660 aa  185  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  33.24 
 
 		 660 aa  184  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  30.89 
 
 		 690 aa  179  3e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  29.69 
 
 		 4672 aa  144  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  30.37 
 
 		 1459 aa  125  5e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  33.33 
 
 		 543 aa  104  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  25.85 
 
 		 3209 aa  96.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  32.28 
 
 		 845 aa  65.9  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1179  adhesin-like protein  36.51 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00551453  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07115  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1164 aa  58.5  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0559  hypothetical protein  28.07 
 
 		 302 aa  54.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0270722  normal  0.124487 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0821  Ig domain-containing protein  27.05 
 
 		 609 aa  50.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0946552  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0587  Ig domain-containing protein  38.64 
 
 		 980 aa  48.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07116  hypothetical protein  28.12 
 
 		 330 aa  48.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0618  Ig domain protein group 1 domain protein  38.64 
 
 		 980 aa  48.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0627  Ig domain protein group 1 domain protein  38.64 
 
 		 979 aa  48.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0614  Ig domain-containing protein  38.64 
 
 		 980 aa  48.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0595  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 		 974 aa  46.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0622  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 		 974 aa  46.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.152382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>