65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5054 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  100 
 
 
934 aa  1919    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  40.94 
 
 
1084 aa  394  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  36.54 
 
 
2795 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  36.68 
 
 
1976 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  40.17 
 
 
4953 aa  366  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  40.17 
 
 
5337 aa  366  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  36.71 
 
 
2933 aa  363  1e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  40.23 
 
 
1418 aa  343  5.999999999999999e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  40.23 
 
 
1396 aa  343  7e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  40.23 
 
 
1417 aa  343  7e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  40.23 
 
 
1417 aa  342  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  43.14 
 
 
1050 aa  340  5.9999999999999996e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  43.14 
 
 
1075 aa  340  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  42.89 
 
 
1075 aa  339  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  37.18 
 
 
941 aa  337  5.999999999999999e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  37.18 
 
 
969 aa  337  9e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  39.54 
 
 
1417 aa  335  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  39.9 
 
 
2620 aa  297  5e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  39.9 
 
 
2296 aa  295  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  39.9 
 
 
2367 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  39.9 
 
 
2383 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  39.9 
 
 
2358 aa  295  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  39.8 
 
 
2358 aa  291  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  35.22 
 
 
2933 aa  289  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  38.79 
 
 
1746 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  35.08 
 
 
730 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  34.66 
 
 
730 aa  263  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  34.66 
 
 
730 aa  263  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  34.46 
 
 
730 aa  261  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  32.59 
 
 
724 aa  245  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.440388 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  34.13 
 
 
730 aa  243  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  41.7 
 
 
410 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  43.58 
 
 
295 aa  208  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  43.58 
 
 
292 aa  207  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  29.24 
 
 
497 aa  188  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  32.13 
 
 
417 aa  183  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  32.13 
 
 
476 aa  183  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  32.13 
 
 
417 aa  183  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  32.13 
 
 
464 aa  183  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  32.13 
 
 
464 aa  183  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  32.13 
 
 
476 aa  183  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  32.13 
 
 
464 aa  182  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  31.88 
 
 
464 aa  181  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  31.88 
 
 
464 aa  181  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.10975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  28.57 
 
 
509 aa  177  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  28.89 
 
 
474 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  28.89 
 
 
474 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  28.89 
 
 
474 aa  176  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  28.89 
 
 
468 aa  173  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  28.67 
 
 
474 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.125708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  31.01 
 
 
660 aa  165  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  31.01 
 
 
660 aa  164  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  31.01 
 
 
660 aa  164  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  31.01 
 
 
660 aa  164  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  30.73 
 
 
660 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  32.1 
 
 
690 aa  159  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  25.81 
 
 
543 aa  108  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  29.54 
 
 
1459 aa  95.9  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  33.15 
 
 
878 aa  55.1  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  29.73 
 
 
845 aa  52.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07115  hypothetical protein  27.67 
 
 
1164 aa  53.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1179  adhesin-like protein  30.86 
 
 
372 aa  46.2  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00551453  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  32.89 
 
 
614 aa  45.1  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  30.15 
 
 
4630 aa  45.1  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2009  intimin/invasin family protein  29.29 
 
 
507 aa  44.7  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>