More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1967 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0071  UvrD/REP helicase  56.89 
 
 		 768 aa  862    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1967  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 789 aa  1602    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3571  ATP-dependent DNA helicase UvrD  67.96 
 
 		 719 aa  929    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  49.43 
 
 		 714 aa  730    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2469  UvrD/REP helicase  50.63 
 
 		 724 aa  697    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.5744  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  68.61 
 
 		 719 aa  1070    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  41.85 
 
 		 681 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  38.6 
 
 		 754 aa  426  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  36.07 
 
 		 742 aa  385  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  37.67 
 
 		 669 aa  380  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1017  UvrD/REP helicase  35.95 
 
 		 733 aa  378  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1306  ATP-dependent DNA helicase  38.19 
 
 		 702 aa  371  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0100895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  36.35 
 
 		 655 aa  362  1e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  37.48 
 
 		 702 aa  355  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  37.34 
 
 		 725 aa  349  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3457  UvrD/REP helicase  34.72 
 
 		 700 aa  349  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  36.35 
 
 		 745 aa  348  3e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_003296  RS05321  ATP-dependent DNA helicase II protein  36.88 
 
 		 710 aa  344  4e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  36.07 
 
 		 725 aa  341  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2122  UvrD/REP helicase  36.53 
 
 		 726 aa  340  5e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  36.53 
 
 		 726 aa  340  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  34.72 
 
 		 648 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  34.72 
 
 		 648 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2743  UvrD/REP helicase  34.65 
 
 		 688 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0230  UvrD/REP helicase  35.43 
 
 		 686 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0402  UvrD/REP helicase  36.42 
 
 		 712 aa  334  3e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3295  UvrD/REP helicase  34.29 
 
 		 717 aa  335  3e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.763792  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  31.6 
 
 		 769 aa  333  8e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3768  UvrD/REP helicase  35.51 
 
 		 689 aa  331  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.528765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7513  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.19 
 
 		 686 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.556127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3142  UvrD/REP helicase  35.34 
 
 		 687 aa  330  6e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345803  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  33.18 
 
 		 749 aa  330  8e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4129  UvrD/REP helicase  36.35 
 
 		 716 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.188822 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4241  UvrD/REP helicase  36.35 
 
 		 716 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5901  UvrD/REP helicase  34.38 
 
 		 689 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0361362  normal  0.5857 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0258  UvrD/REP helicase  34.8 
 
 		 685 aa  328  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1045  putative DNA helicase  35.67 
 
 		 708 aa  325  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  33.43 
 
 		 668 aa  324  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2701  UvrD/REP helicase  34.55 
 
 		 686 aa  323  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.311884  normal  0.28531 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2939  UvrD/REP helicase  35 
 
 		 720 aa  323  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  32.32 
 
 		 706 aa  320  6e-86  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.32 
 
 		 765 aa  318  3e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3335  UvrD/REP helicase  33.94 
 
 		 694 aa  316  9e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.667259 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2745  UvrD/REP helicase  34.33 
 
 		 687 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223218  normal  0.57974 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0801  UvrD/REP helicase  34.83 
 
 		 750 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.205146 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  36.28 
 
 		 739 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0548  UvrD/REP helicase  35.86 
 
 		 745 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254513  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.93 
 
 		 741 aa  309  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.95 
 
 		 751 aa  308  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0779  UvrD/REP helicase  31.54 
 
 		 630 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  35.27 
 
 		 707 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  35.73 
 
 		 768 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.05 
 
 		 751 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2836  DNA helicase II  35.14 
 
 		 858 aa  305  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0594  UvrD/REP helicase  35.39 
 
 		 676 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  34.44 
 
 		 765 aa  304  5.000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2037  UvrD/REP helicase  31.49 
 
 		 850 aa  303  8.000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114912  normal  0.635195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.36 
 
 		 755 aa  301  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.2 
 
 		 729 aa  300  5e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  35.85 
 
 		 825 aa  300  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  30.29 
 
 		 656 aa  300  7e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.82 
 
 		 785 aa  300  7e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2822  UvrD/REP helicase  35.7 
 
 		 826 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.467404 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.99 
 
 		 730 aa  298  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  31.21 
 
 		 735 aa  299  2e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.99 
 
 		 730 aa  298  2e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  33.65 
 
 		 762 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  31.79 
 
 		 755 aa  295  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  34.23 
 
 		 736 aa  295  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.99 
 
 		 715 aa  295  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  33.43 
 
 		 723 aa  295  3e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.47 
 
 		 737 aa  294  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  31.83 
 
 		 778 aa  294  4e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  31.9 
 
 		 764 aa  293  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  34.46 
 
 		 724 aa  292  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  33.7 
 
 		 728 aa  292  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35 
 
 		 718 aa  291  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  34.3 
 
 		 817 aa  292  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  34.16 
 
 		 678 aa  291  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  33.43 
 
 		 723 aa  291  3e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  33.23 
 
 		 678 aa  290  6e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  33.53 
 
 		 728 aa  290  9e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.43 
 
 		 742 aa  289  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.99 
 
 		 694 aa  289  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  34.69 
 
 		 726 aa  288  2.9999999999999996e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  33.98 
 
 		 760 aa  288  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  33.54 
 
 		 706 aa  288  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.33 
 
 		 772 aa  285  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  31.92 
 
 		 779 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.93 
 
 		 766 aa  285  2.0000000000000002e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  32.97 
 
 		 757 aa  285  3.0000000000000004e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  32.88 
 
 		 789 aa  284  4.0000000000000003e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2360  UvrD/REP helicase  33.68 
 
 		 816 aa  283  9e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  31.67 
 
 		 668 aa  283  9e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1824  UvrD/REP helicase  32.2 
 
 		 679 aa  283  1e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000550793  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  31.17 
 
 		 726 aa  283  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  30.41 
 
 		 787 aa  283  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0766  UvrD/REP helicase  32.52 
 
 		 786 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  32.49 
 
 		 744 aa  282  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.13 
 
 		 753 aa  282  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>