More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1157 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1421  putative PAS/PAC sensor protein  50.56 
 
 		 687 aa  670    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.377844  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1157  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 723 aa  1462    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0148223 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1974  putative PAS/PAC sensor protein  55.68 
 
 		 701 aa  728    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0002  putative PAS/PAC sensor protein  38.22 
 
 		 690 aa  486  1e-136  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0567  putative PAS/PAC sensor protein  39.73 
 
 		 693 aa  481  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0637  putative PAS/PAC sensor protein  36.41 
 
 		 716 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1154  putative PAS/PAC sensor protein  33.13 
 
 		 706 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.986646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1559  metal-dependent phosphohydrolase  32.04 
 
 		 698 aa  195  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000474129  normal  0.225702 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0497  metal dependent phosphohydrolase  39.29 
 
 		 389 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1320  HD-GYP domain-containing protein  37.39 
 
 		 471 aa  135  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2070  sensory box protein  37.06 
 
 		 771 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.794479  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2835  putative PAS/PAC sensor protein  32.63 
 
 		 452 aa  127  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0837096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  38.34 
 
 		 848 aa  127  7e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3421  putative PAS/PAC sensor protein  35.59 
 
 		 341 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1285  metal dependent phosphohydrolase  42.5 
 
 		 465 aa  126  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2645  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  40.8 
 
 		 364 aa  125  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1729  metal-dependent phosphohydrolase  33.48 
 
 		 359 aa  125  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0757929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 474 aa  125  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  29.47 
 
 		 458 aa  124  5e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  40.62 
 
 		 1301 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1148  metal dependent phosphohydrolase  39.34 
 
 		 405 aa  122  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2727  metal dependent phosphohydrolase  38.76 
 
 		 387 aa  120  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.328155  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0387  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 		 487 aa  120  9e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0207452  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  29.6 
 
 		 469 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1175  metal dependent phosphohydrolase  35.64 
 
 		 389 aa  120  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2130  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 334 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1889  metal dependent phosphohydrolase  40 
 
 		 487 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.562954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1612  putative PAS/PAC sensor protein  39.78 
 
 		 305 aa  118  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244603  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2306  metal dependent phosphohydrolase  36.68 
 
 		 531 aa  117  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2457  metal dependent phosphohydrolase  33.98 
 
 		 358 aa  117  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 1171 aa  117  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2395  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  45 
 
 		 491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.357639  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2919  metal dependent phosphohydrolase  35.14 
 
 		 451 aa  115  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2429  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.5 
 
 		 480 aa  114  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129673 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0887  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.7 
 
 		 496 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.384329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1756  metal dependent phosphohydrolase  34.83 
 
 		 710 aa  114  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0065  metal dependent phosphohydrolase  30.14 
 
 		 452 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.041414  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2856  putative PAS/PAC sensor protein  31.83 
 
 		 339 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0220538  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1659  metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 		 407 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.244374  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8321  putative metal dependent phosphohydrolase  34.78 
 
 		 451 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2753  hypothetical protein  38.1 
 
 		 308 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1178  metal dependent phosphohydrolase  33.85 
 
 		 539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  35.56 
 
 		 876 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0362  metal dependent phosphohydrolase  36.02 
 
 		 518 aa  112  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  35.07 
 
 		 453 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1202  metal dependent phosphohydrolase  36.36 
 
 		 177 aa  111  4.0000000000000004e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0798  metal dependent phosphohydrolase  33.68 
 
 		 545 aa  111  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3173  metal dependent phosphohydrolase  33.84 
 
 		 713 aa  111  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1183  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.42 
 
 		 363 aa  110  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0639  metal dependent phosphohydrolase  39.74 
 
 		 210 aa  110  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000043249  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1090  metal dependent phosphohydrolase  34.64 
 
 		 698 aa  110  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3074  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.81 
 
 		 363 aa  110  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1135  metal dependent phosphohydrolase  39.02 
 
 		 547 aa  109  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0995  metal dependent phosphohydrolase  39.02 
 
 		 547 aa  109  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.656707  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3371  putative PAS/PAC sensor protein  33.76 
 
 		 649 aa  109  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3570  metal dependent phosphohydrolase  39.55 
 
 		 571 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0226  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 770 aa  109  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0129  metal dependent phosphohydrolase  37.58 
 
 		 505 aa  109  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0880  metal dependent phosphohydrolase  34.95 
 
 		 311 aa  108  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45566  normal  0.533895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2559  metal dependent phosphohydrolase  35.68 
 
 		 553 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107172 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2748  metal dependent phosphohydrolase  38.55 
 
 		 574 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.941576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0032  putative PAS/PAC sensor protein  36.81 
 
 		 632 aa  108  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0790714  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00070  Two-component system response regulator RpfG  35.65 
 
 		 353 aa  108  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0844737  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1688  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 		 648 aa  107  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.74 
 
 		 1125 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4135  putative PAS/PAC sensor protein  38.37 
 
 		 650 aa  106  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.479739  hitchhiker  0.00000143987 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1007  GAF domain/HD domain-containing protein  35.12 
 
 		 550 aa  106  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  34.17 
 
 		 841 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1344  metal dependent phosphohydrolase  30.93 
 
 		 643 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1217  metal dependent phosphohydrolase  33.52 
 
 		 371 aa  105  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0568  metal dependent phosphohydrolase  33.86 
 
 		 495 aa  105  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.17826  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1875  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.29 
 
 		 361 aa  105  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3269  response regulator  33.53 
 
 		 600 aa  105  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.633194  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0550  metal-dependent phosphohydrolase, HD region  33.89 
 
 		 509 aa  105  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  36.87 
 
 		 1335 aa  105  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0011  metal dependent phosphohydrolase  30.05 
 
 		 414 aa  104  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000714378  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  33.65 
 
 		 545 aa  104  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22020  metal dependent phosphohydrolase  32.8 
 
 		 362 aa  104  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0244  metal dependent phosphohydrolase  34.43 
 
 		 220 aa  104  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100694  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1779  metal dependent phosphohydrolase  36.46 
 
 		 703 aa  104  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000172323 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1441  metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 		 643 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1446  metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 		 643 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1477  metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 		 643 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2059  metal dependent phosphohydrolase  32.43 
 
 		 430 aa  103  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000152605  hitchhiker  0.00000484417 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2906  metal dependent phosphohydrolase  31.02 
 
 		 643 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.19603  normal  0.482942 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3564  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.87 
 
 		 492 aa  103  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2699  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.3 
 
 		 328 aa  103  9e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2150  metal dependent phosphohydrolase  37.99 
 
 		 718 aa  103  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0018  metal dependent phosphohydrolase  34.48 
 
 		 481 aa  103  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2438  metal dependent phosphohydrolase  36.46 
 
 		 703 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3335  metal dependent phosphohydrolase  34.54 
 
 		 611 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2646  metal dependent phosphohydrolase  30.41 
 
 		 642 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1266  metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 		 631 aa  103  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0488  metal dependent phosphohydrolase  39.26 
 
 		 462 aa  103  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.354545  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3738  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  35.2 
 
 		 384 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0725  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  34.92 
 
 		 498 aa  103  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1049  HD domain-containing protein  28.63 
 
 		 311 aa  102  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0090576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7735  metal dependent phosphohydrolase  35.75 
 
 		 905 aa  103  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1828  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  36.98 
 
 		 379 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.723665 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2713  metal dependent phosphohydrolase  29.9 
 
 		 642 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>