233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1798 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1798  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  100 
 
 		 197 aa  398  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.138552  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1999  gluconolactonase  99.25 
 
 		 352 aa  278  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.799768  normal  0.270906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0257  gluconolactonase  90.08 
 
 		 350 aa  249  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2596  gluconolactonase  78.03 
 
 		 357 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.260524  normal  0.0898452 
 
 
-
 
NC_003296  RS05371  putative gluconolactonase precursor (D-glucono-DELTA-lactone lactonohydrolase) protein  67.42 
 
 		 353 aa  186  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2803  gluconolactonase  65.15 
 
 		 372 aa  185  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1111  gluconolactonase  66.67 
 
 		 324 aa  184  9e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0894988 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2470  senescence marker protein-30 family protein  64.39 
 
 		 363 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.183439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2235  twin-arginine translocation pathway signal  63.64 
 
 		 366 aa  178  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.613312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6492  gluconolactonase  59.86 
 
 		 362 aa  178  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0705  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  59.06 
 
 		 368 aa  170  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0609  gluconolactonase  63.85 
 
 		 312 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0512442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2832  gluconolactonase  62.41 
 
 		 322 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5439  gluconolactonase  60 
 
 		 316 aa  154  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.1076  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4278  Gluconolactonase  59.54 
 
 		 313 aa  150  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.469219 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2591  gluconolactonase  59.23 
 
 		 315 aa  148  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1542  gluconolactonase precursor  46.91 
 
 		 313 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.572471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0044  gluconolactonase  46.91 
 
 		 313 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0611  gluconolactonase  58.02 
 
 		 312 aa  141  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2122  gluconolactonase  54.55 
 
 		 332 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.282778 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0036  putative gluconolactonase  46.39 
 
 		 313 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1190  putative gluconolactonase  46.39 
 
 		 316 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0058  gluconolactonase  46.39 
 
 		 313 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.916803  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1474  putative gluconolactonase  57.25 
 
 		 183 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.551174  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0046  gluconolactonase  57.25 
 
 		 183 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4442  gluconolactonase  57.25 
 
 		 316 aa  138  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1998  galactarate dehydratase  84.15 
 
 		 520 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.257982  normal  0.434412 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3069  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  47.52 
 
 		 406 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.976711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0597  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  46.21 
 
 		 407 aa  112  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0256  galactarate dehydratase  86.36 
 
 		 521 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.808997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5446  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  44.14 
 
 		 415 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1721  galactarate dehydratase  87.88 
 
 		 529 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0799571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2929  gluconolactonase  44.37 
 
 		 371 aa  108  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.775467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2595  galactarate dehydratase  67.07 
 
 		 518 aa  100  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.865762  normal  0.097428 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5734  Gluconolactonase  45.26 
 
 		 304 aa  99.4  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.402345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4647  Gluconolactonase  44.53 
 
 		 304 aa  98.2  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5415  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  43.7 
 
 		 300 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1597  galactarate dehydratase  74.24 
 
 		 532 aa  95.9  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3486  Gluconolactonase  39.71 
 
 		 303 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.656299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4321  gluconolactonase  39.71 
 
 		 304 aa  95.9  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0658  gluconolactonase  39.26 
 
 		 307 aa  92.4  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3774  Gluconolactonase  38.24 
 
 		 303 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5316  gluconolactonase  41.61 
 
 		 303 aa  89.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2596  gluconolactonase  40.3 
 
 		 304 aa  88.6  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0633  gluconolactonase  37.78 
 
 		 307 aa  88.6  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.255721  normal  0.17979 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  38.52 
 
 		 302 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1059  Gluconolactonase  35.82 
 
 		 304 aa  87  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.755366  normal  0.0949002 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3913  gluconolactonase  39.86 
 
 		 306 aa  87  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201835  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3104  galactarate dehydratase  69.7 
 
 		 548 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9336  Gluconolactonase  38.17 
 
 		 299 aa  85.9  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2484  galactarate dehydratase  69.7 
 
 		 533 aa  85.9  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000132334 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3690  galactarate dehydratase  66.67 
 
 		 524 aa  84.7  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4803  gluconolactonase  37.25 
 
 		 533 aa  84.7  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1531  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  39.71 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0805032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6382  galactarate dehydratase  63.64 
 
 		 530 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.695023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1138  galactarate dehydratase  64.79 
 
 		 523 aa  81.6  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5723  gluconolactonase precursor  39.26 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.299972  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4734  galactarate dehydratase  62.12 
 
 		 530 aa  80.5  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.481286  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0588  Gluconolactonase  39.85 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4507  Gluconolactonase  37.78 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2848  gluconolactonase  38.64 
 
 		 281 aa  80.5  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2498  gluconolactonase  39.39 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2779  gluconolactonase  36.57 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6418  Gluconolactonase  36.3 
 
 		 308 aa  79  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.632386  normal  0.406976 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0623  Gluconolactonase  37.59 
 
 		 328 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.515505  normal  0.235639 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3265  galactarate dehydratase  63.64 
 
 		 530 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.133789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4631  Gluconolactonase  35.61 
 
 		 302 aa  78.6  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0459934 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4582  galactarate dehydratase  63.64 
 
 		 533 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.699937  normal  0.473159 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4952  galactarate dehydratase  62.12 
 
 		 517 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.966649  normal  0.0126934 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4448  galactarate dehydratase  63.64 
 
 		 533 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0860733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1801  galactarate dehydratase  60.61 
 
 		 529 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.335556  hitchhiker  0.00101481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4865  galactarate dehydratase  60.61 
 
 		 529 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0784645  normal  0.0391217 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3050  galactarate dehydratase  62.12 
 
 		 517 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5316  galactarate dehydratase  62.12 
 
 		 517 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.522817 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0830  D-galactarate dehydratase  62.12 
 
 		 533 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.107434 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4675  galactarate dehydratase  59.09 
 
 		 517 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.654315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3932  gluconolactonase  34.53 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.1586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3409  galactarate dehydratase  59.09 
 
 		 518 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219407  normal  0.594385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0612  gluconolactonase  36.09 
 
 		 328 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.110443 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5203  galactarate dehydratase  59.09 
 
 		 517 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.175909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3318  galactarate dehydratase  54.55 
 
 		 523 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02993  (D)-galactarate dehydrogenase  54.55 
 
 		 523 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0577  galactarate dehydratase  54.55 
 
 		 523 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3425  galactarate dehydratase  54.55 
 
 		 523 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02944  hypothetical protein  54.55 
 
 		 523 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1218  galactarate dehydratase  51.25 
 
 		 518 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0502126  normal  0.0293032 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4442  galactarate dehydratase  54.55 
 
 		 523 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.648393 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0572  galactarate dehydratase  54.55 
 
 		 523 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3608  galactarate dehydratase  54.55 
 
 		 523 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3570  galactarate dehydratase  53.03 
 
 		 523 aa  72.4  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.631935 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3442  galactarate dehydratase  54.55 
 
 		 523 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3558  galactarate dehydratase  56.06 
 
 		 524 aa  71.6  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3444  galactarate dehydratase  54.55 
 
 		 523 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00343558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3550  galactarate dehydratase  54.55 
 
 		 523 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0864027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3513  galactarate dehydratase  54.55 
 
 		 523 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0333  galactarate dehydratase  61.67 
 
 		 517 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0806  galactarate dehydratase  56.06 
 
 		 524 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1778  galactarate dehydratase  62.9 
 
 		 534 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.479447  normal  0.643906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  36.97 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6490  (D)-galactarate dehydrogenase  57.58 
 
 		 513 aa  70.5  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>