More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2394 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  295  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0653  AsnC family transcriptional regulator  82.89 
 
 		 152 aa  250  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.594431  normal  0.222983 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2301  AsnC family transcriptional regulator  84.21 
 
 		 152 aa  251  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0516  AsnC family transcriptional regulator  80.92 
 
 		 152 aa  245  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.904906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1867  AsnC family transcriptional regulator  80.92 
 
 		 152 aa  245  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1240  AsnC family transcriptional regulator  76.16 
 
 		 151 aa  229  9e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1758  AsnC family transcriptional regulator  73.2 
 
 		 153 aa  224  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00375085  normal  0.163096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1158  AsnC family transcriptional regulator  44.06 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.15264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5049  AsnC family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 154 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.778931 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3336  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4773  transcriptional regulator, AsnC family  41.89 
 
 		 155 aa  110  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213128  hitchhiker  0.0021999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1999  AsnC family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 155 aa  111  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267629  normal  0.0117406 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2173  AsnC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.815708  normal  0.596394 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2928  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 181 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0205  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 181 aa  110  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2987  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 181 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3382  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 181 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.51 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4074  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1615  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4000  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0079  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  38.51 
 
 		 155 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3548  transcriptional regulator, AsnC family  41.06 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.621561 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3260  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2976  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0097  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0070  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0078  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.746042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0079  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.123654  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  38.46 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4321  AsnC family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 151 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.468859  normal  0.287831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0012  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3920  transcriptional regulator, AsnC family  37.75 
 
 		 163 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2437  transcriptional regulator, AsnC family  41.84 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 156 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0368  AsnC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 154 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.937008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3054  AsnC family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 163 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 155 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  36 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5672  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3786  transcriptional regulator, AsnC family  34.25 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  36.62 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4542  AsnC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 159 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3685  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930939  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5171  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 154 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4248  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4642  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 154 aa  104  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  36.88 
 
 		 157 aa  104  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3438  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.950868 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4986  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 154 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3085  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 154 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5282  AsnC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 154 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.451768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4567  AsnC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  103  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3354  transcription regulator protein  41.06 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5122  putative transcriptional regulator  37.16 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2327  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0714715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58510  AsnC family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3386  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227667  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1745  transcriptional regulator, AsnC family  40.15 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1942  AsnC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0292999  normal  0.532082 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2047  transcriptional regulator, AsnC family  36.84 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.640465  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  36.17 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2165  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 172 aa  101  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0837  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0388954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2204  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.656309  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1570  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 174 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2118  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0611  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 174 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0809  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 174 aa  100  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2031  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0711  AsnC family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 154 aa  100  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1388  transcriptional regulator, AsnC family  43.8 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3144  AsnC family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18277  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0100  transcriptional regulator, AsnC family  38.62 
 
 		 173 aa  100  8e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3532  AsnC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 159 aa  100  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0235  AsnC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.141356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 156 aa  99.4  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1503  AsnC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.781241  normal  0.23651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.17 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05577  transcription regulator protein  38.19 
 
 		 186 aa  98.2  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47707  normal  0.300732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  35.46 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2896  AsnC family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 160 aa  98.2  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2116  AsnC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 156 aa  97.8  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0323344 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2804  AsnC family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 169 aa  98.2  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2104  AsnC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 153 aa  97.8  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0459  AsnC family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 160 aa  97.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>