More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0537 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  69.31 
 
 		 502 aa  711    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 497 aa  1014    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2596  predicted protein  51.49 
 
 		 482 aa  479  1e-134  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.283853  normal  0.0118319 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  46.09 
 
 		 524 aa  411  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  46.59 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2684  carbohydrate kinase, FGGY  37.4 
 
 		 501 aa  307  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.849942 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02610  hypothetical protein  31.33 
 
 		 526 aa  241  2e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02649  L-ribulokinase AraB-like protein  31.33 
 
 		 542 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  33.6 
 
 		 498 aa  239  9e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  32.73 
 
 		 509 aa  235  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  28.63 
 
 		 500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  31.23 
 
 		 528 aa  234  4.0000000000000004e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3574  ribitol kinase  31.71 
 
 		 523 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197802  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3411  FGGY-family pentulose kinase  30.74 
 
 		 525 aa  231  2e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  29.23 
 
 		 503 aa  228  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  32.26 
 
 		 510 aa  226  7e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  32.67 
 
 		 506 aa  220  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0368  pentulose kinase  28.84 
 
 		 545 aa  218  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0435  FGGY-family pentulose kinase  28.84 
 
 		 545 aa  218  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1227  pentulose kinase  28.84 
 
 		 545 aa  218  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.838114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  31.94 
 
 		 504 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  27.88 
 
 		 501 aa  216  7e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  30.88 
 
 		 548 aa  216  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  27.38 
 
 		 500 aa  212  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  33.53 
 
 		 493 aa  212  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  33.53 
 
 		 493 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  33.53 
 
 		 493 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4697  FGGY-family pentulose kinase  27.07 
 
 		 545 aa  211  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.921712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  33.2 
 
 		 498 aa  210  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0920  putative sugar kinase (ribulo-/ribitol kinase)  32.08 
 
 		 549 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  28.4 
 
 		 518 aa  207  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  28.77 
 
 		 499 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2899  ribulokinase  31.92 
 
 		 564 aa  205  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  29.52 
 
 		 496 aa  203  5e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  28.46 
 
 		 538 aa  203  7e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3440  FGGY-family pentulose kinase  31.41 
 
 		 544 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.243574  normal  0.308227 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3705  D-ribulokinase  31.41 
 
 		 544 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3746  FGGY-family pentulose kinase  30.02 
 
 		 527 aa  199  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2495  FGGY-family pentulose kinase  29.25 
 
 		 543 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.578248  normal  0.427048 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  29.5 
 
 		 509 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2229  ribulokinase  28.14 
 
 		 556 aa  197  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00201608  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  32.73 
 
 		 499 aa  197  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  29.4 
 
 		 512 aa  196  8.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  32.34 
 
 		 506 aa  196  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0456  FGGY-family pentulose kinase  30.06 
 
 		 547 aa  195  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.708838  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0680  pentulose kinase  30.93 
 
 		 547 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  29.48 
 
 		 505 aa  195  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2351  FGGY-family pentulose kinase  29.81 
 
 		 528 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.400628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  29.08 
 
 		 490 aa  195  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0847  FGGY-family pentulose kinase  30.45 
 
 		 543 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0389776  normal  0.126532 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  30.19 
 
 		 508 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  28.44 
 
 		 512 aa  193  5e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  29.28 
 
 		 502 aa  193  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1997  carbohydrate kinase FGGY  27.07 
 
 		 505 aa  193  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7374  ribitol kinase  30.38 
 
 		 544 aa  193  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.444357  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  29.9 
 
 		 512 aa  192  9e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  28.02 
 
 		 506 aa  192  9e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1346  pentulose kinase  29.51 
 
 		 526 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.664914  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  29.83 
 
 		 514 aa  192  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  31.27 
 
 		 498 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  28.02 
 
 		 506 aa  190  5e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6255  FGGY-family pentulose kinase  29.98 
 
 		 545 aa  190  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3444  FGGY-family pentulose kinase  29.37 
 
 		 527 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2816  FGGY-family pentulose kinase  28.9 
 
 		 538 aa  189  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  28.71 
 
 		 489 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  29.18 
 
 		 495 aa  188  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3784  FGGY-family pentulose kinase  29.13 
 
 		 529 aa  188  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0121132  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0555  ribulokinase  27.78 
 
 		 544 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  29.75 
 
 		 519 aa  188  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  27.65 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  29.05 
 
 		 505 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  30.57 
 
 		 501 aa  186  6e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  29.24 
 
 		 515 aa  186  6e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  28.97 
 
 		 509 aa  186  8e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  25.57 
 
 		 496 aa  184  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2735  ribulokinase  29.91 
 
 		 564 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0244  ribitol kinase  28.14 
 
 		 534 aa  182  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0269  ribitol kinase  28.14 
 
 		 534 aa  182  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  28.17 
 
 		 511 aa  182  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  26.59 
 
 		 506 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  30.89 
 
 		 505 aa  181  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1344  carbohydrate kinase, FGGY  29.67 
 
 		 519 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.789365  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  28.71 
 
 		 511 aa  180  5.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0222  ribulokinase  31.61 
 
 		 585 aa  179  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0379  ribulokinase  32.16 
 
 		 577 aa  178  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  27.05 
 
 		 530 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2156  FGGY-family pentulose kinase  28.82 
 
 		 540 aa  177  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  28.22 
 
 		 503 aa  176  7e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0469  L-ribulokinase  30.83 
 
 		 562 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  29.25 
 
 		 514 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1560  carbohydrate kinase, FGGY  28.05 
 
 		 519 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  26.2 
 
 		 492 aa  173  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  26.2 
 
 		 492 aa  173  5e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  29.84 
 
 		 481 aa  173  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  27.27 
 
 		 489 aa  173  6.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2615  carbohydrate kinase FGGY  28.21 
 
 		 520 aa  172  9e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  26.25 
 
 		 488 aa  172  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0575  ribulokinase  27.07 
 
 		 546 aa  171  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3662  ribulokinase  29.78 
 
 		 562 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  29.01 
 
 		 495 aa  171  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>