More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1580 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1580  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
456 aa  925    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.809434 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0562  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.78 
 
 
453 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.258161  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1653  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.25 
 
 
456 aa  385  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000183758  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.06 
 
 
473 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100657 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1690  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.91 
 
 
460 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416898  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1416  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.19 
 
 
461 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.94 
 
 
465 aa  249  6e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
468 aa  249  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.93 
 
 
472 aa  248  1e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 
473 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.98 
 
 
480 aa  247  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.2 
 
 
482 aa  247  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.82 
 
 
462 aa  246  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.59 
 
 
473 aa  244  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.05 
 
 
481 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.94 
 
 
473 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 
473 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.75 
 
 
477 aa  242  9e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.28 
 
 
465 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1632  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.44 
 
 
483 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.41 
 
 
481 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 
469 aa  240  4e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.31 
 
 
464 aa  238  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.42 
 
 
481 aa  238  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.22 
 
 
486 aa  236  6e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.36 
 
 
459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.3 
 
 
470 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.7 
 
 
467 aa  234  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
474 aa  234  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.5 
 
 
468 aa  233  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  34 
 
 
469 aa  233  8.000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.89 
 
 
465 aa  232  8.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.65 
 
 
487 aa  232  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.26 
 
 
480 aa  231  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.96 
 
 
466 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.55 
 
 
479 aa  231  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
479 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.17 
 
 
463 aa  230  4e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
463 aa  230  5e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3894  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.84 
 
 
471 aa  230  5e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
479 aa  229  6e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.03 
 
 
466 aa  229  7e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.76 
 
 
479 aa  229  8e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.83 
 
 
487 aa  229  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.76 
 
 
468 aa  228  2e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.96 
 
 
477 aa  228  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.83 
 
 
539 aa  228  2e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.69 
 
 
462 aa  227  4e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.72 
 
 
458 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.2 
 
 
471 aa  226  6e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0421  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.7 
 
 
475 aa  226  9e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000187748  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0703  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 
454 aa  225  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.09 
 
 
465 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2076  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.75 
 
 
588 aa  225  1e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.52 
 
 
471 aa  225  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.57 
 
 
462 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.61 
 
 
478 aa  225  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.13 
 
 
465 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3597  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.92 
 
 
475 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000546829  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.13 
 
 
562 aa  224  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0428  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.92 
 
 
475 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00251394  normal  0.166632 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3092  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.79 
 
 
463 aa  224  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347569  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0426  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.7 
 
 
475 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3854  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 
475 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.075768  hitchhiker  0.000000345632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0430  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.7 
 
 
475 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 
603 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  31.48 
 
 
457 aa  223  6e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.82 
 
 
461 aa  223  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.96 
 
 
487 aa  223  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.81 
 
 
459 aa  223  7e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.4 
 
 
478 aa  223  7e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0463  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.8 
 
 
457 aa  222  8e-57  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.3 
 
 
474 aa  222  9e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3775  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
476 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.64 
 
 
473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  33.26 
 
 
500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3415  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
475 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000233503  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.09 
 
 
581 aa  221  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4805  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.31 
 
 
477 aa  221  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.97 
 
 
460 aa  221  3e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3381  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 
476 aa  221  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000696126  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3932  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
475 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000133391  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.32 
 
 
466 aa  220  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  32.89 
 
 
459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 
466 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.66 
 
 
469 aa  220  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.82 
 
 
465 aa  220  5e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4052  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
475 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00676379  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.03 
 
 
603 aa  220  5e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0676  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
474 aa  220  5e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.9 
 
 
466 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3911  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
475 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000450783  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0433  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.59 
 
 
475 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3429  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.04 
 
 
475 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0358795  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.31 
 
 
491 aa  218  2e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.65 
 
 
602 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0377  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.82 
 
 
476 aa  218  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349282 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.66 
 
 
470 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.02 
 
 
470 aa  217  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>