More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1244 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1244  Patatin  100 
 
 		 320 aa  646    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0438678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  52.57 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1081  patatin  51.64 
 
 		 322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.983144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1839  patatin  39.08 
 
 		 264 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0742983  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1382  Patatin  40.08 
 
 		 330 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.169979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0432  patatin  42.24 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  37.59 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0906  hypothetical protein  37.69 
 
 		 292 aa  149  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3310  patatin-like phospholipase  35.56 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  32.55 
 
 		 323 aa  146  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0479  Patatin  35.23 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.382119  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0418  patatin  36.99 
 
 		 294 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0209  hypothetical protein  33.45 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0189  hypothetical protein  32.75 
 
 		 303 aa  135  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  33.09 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  33.92 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  33.09 
 
 		 260 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  32.37 
 
 		 263 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  31.05 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  32.01 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  31.05 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  31.21 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  32.01 
 
 		 263 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  32.01 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  32.01 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  32.01 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  32.01 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  30.94 
 
 		 263 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  28.29 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1338  Patatin  31.34 
 
 		 280 aa  126  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  29.49 
 
 		 300 aa  126  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0524  Patatin  34.56 
 
 		 293 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.607937 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  33.1 
 
 		 275 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  31.72 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  27.78 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  30.2 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  42.53 
 
 		 324 aa  122  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0190  Patatin  28.57 
 
 		 314 aa  122  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  33.57 
 
 		 275 aa  122  7e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  31.49 
 
 		 760 aa  122  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  122  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  33.69 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  32.75 
 
 		 275 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  32.54 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  29.32 
 
 		 322 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  30.41 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  33.72 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  35.98 
 
 		 273 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  31.1 
 
 		 323 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1047  patatin  31.76 
 
 		 321 aa  119  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  37.25 
 
 		 335 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  27.08 
 
 		 333 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  31.98 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  29.87 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  29.89 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  32.56 
 
 		 345 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  29.67 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  30.3 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4504  patatin  29.86 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  29.03 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1002  patatin  30.74 
 
 		 326 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  32.92 
 
 		 253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  31.38 
 
 		 348 aa  115  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  28.85 
 
 		 298 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  27.68 
 
 		 358 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1593  Patatin  38.38 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  30 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  28.09 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2188  putative phospholipase  29.35 
 
 		 293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1718  Patatin  32.06 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  29.8 
 
 		 319 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  28.41 
 
 		 306 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  27.82 
 
 		 474 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  29.66 
 
 		 347 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  29.84 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  30.46 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  29.66 
 
 		 347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  28.81 
 
 		 318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  31.45 
 
 		 346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  31.52 
 
 		 272 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  31.45 
 
 		 346 aa  113  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  30.93 
 
 		 347 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  26.71 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  30.34 
 
 		 308 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  31.32 
 
 		 262 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0898  hypothetical protein  33.02 
 
 		 263 aa  112  7.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  33.47 
 
 		 301 aa  112  8.000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0262  Patatin  27.7 
 
 		 276 aa  112  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.129262  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2051  Patatin  28.75 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  29.37 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  31.8 
 
 		 257 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1230  Patatin  30.74 
 
 		 252 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  28.2 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  26.54 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  28.91 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  28.2 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  32.21 
 
 		 741 aa  109  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  29.82 
 
 		 740 aa  109  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  32.08 
 
 		 767 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  30.51 
 
 		 728 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>