More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1107 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1107  aminotransferase class IV  100 
 
 		 314 aa  640    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.0333795 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0255  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  52.61 
 
 		 313 aa  341  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0329  aminotransferase, class IV  52.4 
 
 		 315 aa  340  2e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.13706 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2383  aminotransferase class IV  51.61 
 
 		 313 aa  331  1e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1756  aminotransferase class IV  54.43 
 
 		 316 aa  329  3e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.336644  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2275  aminotransferase class IV  44.38 
 
 		 320 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.337005  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3207  aminotransferase, class IV  36.25 
 
 		 325 aa  212  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0677  branched-chain amino acid aminotransferase  33.46 
 
 		 288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2260  branched-chain amino acid aminotransferase  33.09 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.576365 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0221  branched-chain amino acid aminotransferase  32.36 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000534273  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0672  branched-chain amino acid aminotransferase  32.71 
 
 		 297 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1306  branched-chain amino acid aminotransferase  32.85 
 
 		 297 aa  145  9e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1421  branched-chain amino acid aminotransferase  31.49 
 
 		 347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0222648 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2099  branched-chain amino acid aminotransferase  29 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1543  branched-chain amino acid aminotransferase  31.02 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  30.69 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1735  branched-chain amino acid aminotransferase  30.97 
 
 		 289 aa  136  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0351  branched-chain amino acid aminotransferase  30.37 
 
 		 293 aa  136  5e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.544925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  30.32 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1850  branched-chain amino acid aminotransferase  31.34 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  30.32 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  31.34 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2148  branched-chain amino acid aminotransferase  31.54 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0588  branched-chain amino acid aminotransferase  29.56 
 
 		 293 aa  134  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000572339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  30.32 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  30.32 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  29.96 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3492  branched-chain amino acid aminotransferase  30.97 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.892659  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  30.97 
 
 		 299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1713  branched-chain amino acid aminotransferase  30.97 
 
 		 299 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  29.89 
 
 		 298 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1690  branched-chain amino acid aminotransferase  30.97 
 
 		 299 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1665  branched-chain amino acid aminotransferase  30.97 
 
 		 299 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.291613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  30.97 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1849  branched-chain amino acid aminotransferase  30.97 
 
 		 299 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1887  branched-chain amino acid aminotransferase  30.97 
 
 		 299 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0576  branched-chain amino acid aminotransferase  29.04 
 
 		 292 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1615  branched-chain amino acid aminotransferase  28.73 
 
 		 290 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0664  branched-chain amino acid aminotransferase  29.2 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000154508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1364  branched-chain amino acid aminotransferase  28.52 
 
 		 295 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000849481  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10810  branched-chain amino acid aminotransferase  27.51 
 
 		 299 aa  129  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0476  branched-chain amino acid aminotransferase  31.11 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  29.28 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0820  branched-chain amino acid aminotransferase  30.6 
 
 		 287 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.354842  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2232  branched-chain amino acid aminotransferase  28.94 
 
 		 295 aa  125  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1195  branched-chain amino acid aminotransferase  28.37 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1546  branched-chain amino acid aminotransferase  29.1 
 
 		 287 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1131  branched-chain amino acid aminotransferase  29.85 
 
 		 287 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  27.47 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0853  branched-chain amino acid aminotransferase  29.01 
 
 		 299 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2597  branched-chain amino acid aminotransferase  29.24 
 
 		 299 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3544  branched-chain amino acid aminotransferase  28.68 
 
 		 288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.08959  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  29.81 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0723  branched-chain amino acid aminotransferase  26.39 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.863889 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1137  branched-chain amino acid aminotransferase  26.91 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3057  branched chain amino acid aminotransferase  28.85 
 
 		 282 aa  105  7e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762588 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2551  branched-chain amino acid aminotransferase  28.18 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317698  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2678  branched-chain amino acid aminotransferase  28.18 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1636  aminotransferase, class IV  27.45 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1060  branched-chain amino acid aminotransferase  28.72 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0180  branched-chain amino acid aminotransferase  28 
 
 		 304 aa  99  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3294  branched-chain amino acid aminotransferase  27.84 
 
 		 306 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.845143 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0301  branched-chain amino acid aminotransferase  28.68 
 
 		 306 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.471777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4429  D-amino-acid transaminase  28.99 
 
 		 295 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202975  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  30.97 
 
 		 303 aa  96.7  5e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2134  branched-chain amino acid aminotransferase  28.28 
 
 		 307 aa  95.5  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0547  branched-chain amino acid aminotransferase  27.41 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44880  branched-chain amino acid aminotransferase  28.63 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419974  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0703  branched-chain amino acid aminotransferase  27.41 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0316871  hitchhiker  0.000000451168 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0534  aminotransferase class IV  29.32 
 
 		 286 aa  95.1  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2037  D-amino acid aminotransferase  25.87 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00430829  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1102  branched-chain amino acid aminotransferase  27.74 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2281  D-amino acid aminotransferase  25.48 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532299999999998e-35 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0177  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  30.63 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2706  D-amino-acid transaminase  29.01 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0660  D-amino acid aminotransferase  28.57 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.574583  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0534  branched-chain amino acid aminotransferase  28.08 
 
 		 308 aa  93.6  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1818  branched-chain amino acid aminotransferase  27.59 
 
 		 307 aa  93.6  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.774485  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0960  aminotransferase class IV  30.74 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549008 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2039  D-amino acid aminotransferase  25.48 
 
 		 291 aa  93.2  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000658861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2285  D-amino acid aminotransferase  25.48 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0817941  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0464  branched-chain amino acid aminotransferase  27.15 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1052  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase / branched chain amino acid aminotransferase  30 
 
 		 304 aa  92.8  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0493  branched-chain amino acid aminotransferase  26.99 
 
 		 306 aa  92.8  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0193  branched-chain amino acid aminotransferase  30.03 
 
 		 307 aa  92.8  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1179  branched-chain amino acid aminotransferase  30 
 
 		 304 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1108  branched-chain amino acid aminotransferase  30.45 
 
 		 304 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1533  branched-chain amino acid aminotransferase  26.9 
 
 		 307 aa  92.4  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0777  branched-chain amino acid aminotransferase  27 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1721  branched-chain amino acid aminotransferase  29.66 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0205647 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5351  D-amino acid aminotransferase  26.87 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.121682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5323  D-amino acid aminotransferase  26.77 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13955e-59 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4914  D-amino acid aminotransferase  26.77 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0376508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4929  D-amino acid aminotransferase  26.77 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5962  branched-chain amino acid aminotransferase  26.8 
 
 		 307 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2256  D-amino acid aminotransferase  25.1 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.162413  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0304  branched-chain amino acid aminotransferase  27.59 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>