132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2406 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2406  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  100 
 
 
238 aa  478  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1763  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  38.69 
 
 
231 aa  113  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0690  flagellar assembly protein FliH  28.46 
 
 
249 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2042  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  32.95 
 
 
224 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0773  flagellar assembly protein FliH  31.1 
 
 
252 aa  95.1  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0467  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  25.91 
 
 
263 aa  89  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0851  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  28.84 
 
 
280 aa  82  0.000000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2049  flagellar assembly protein FliH  28.27 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1090  flagellar assembly protein FliH  32.34 
 
 
201 aa  78.2  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.486271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1018  flagellar assembly protein FliH  29.81 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4729  flagellar assembly protein H  28.29 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.249746  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3652  flagellar assembly protein H  28.29 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.526766 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0392  flagellar assembly protein H  26.9 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4211  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  27.1 
 
 
269 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16870  Flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein  24.88 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1538  flagellar assembly protein H  28.25 
 
 
268 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0361  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  23.48 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0148999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1393  H+transporting two-sector ATPase E subunit  25 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.800727 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0771  flagellar assembly protein FliH  24.26 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.24197  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0040  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.67 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.457372 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24210  Flagellar assembly protein  29.05 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0165568  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3110  flagellar assembly protein fliH, putative  24.5 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1574  flagellar assembly protein H  28.11 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4148  flagellar assembly protein FliH  25.13 
 
 
289 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1391  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.27 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3097  flagellar assembly protein FliH  24.54 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1217  flagellar assembly protein H  23.24 
 
 
308 aa  63.2  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0198  flagellar assembly protein H  31.06 
 
 
207 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6415  flagellar assembly protein H  31.76 
 
 
227 aa  62  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.491071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4268  flagellar assembly protein H  26.22 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3063  flagellar assembly protein H  31.08 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1602  flagellar assembly protein FliH  30.86 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0552  flagellar assembly protein FliH  26.4 
 
 
227 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5263  flagellar assembly protein H  28.48 
 
 
278 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.16543  normal  0.0759214 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2715  hypothetical protein  24.74 
 
 
290 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3085  flagellar assembly protein H  30.41 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0955445  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3111  flagellar assembly protein H  30.41 
 
 
227 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33418  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2977  flagellar assembly protein H  30.41 
 
 
227 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.575281 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0567  flagellar biosynthesis protein  24.03 
 
 
268 aa  58.9  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2949  flagellar assembly protein H  27.15 
 
 
234 aa  59.3  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0850  type III secretion system protein  24.37 
 
 
235 aa  58.2  0.0000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.136096  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1113  flagellar assembly protein H  25.82 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50110  flagellar assembly protein H  24.84 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00973712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2823  flagellar assembly protein H  30.17 
 
 
266 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.283065  normal  0.0158669 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2005  flagellar assembly protein H  26.06 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0295  flagellar assembly protein H  23.4 
 
 
306 aa  58.2  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3279  flagellar assembly protein H  31.2 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0415  flagellar assembly protein H  31.2 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.359601  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1976  flagellar assembly protein FliH  29.17 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2944  flagellar assembly protein H  31.2 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.122685  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0496  flagellar assembly protein FliH  26.51 
 
 
307 aa  57.4  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2144  flagellar assembly protein H  31.2 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0220  flagellar assembly protein H  30.43 
 
 
226 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.188523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0232  flagellar assembly protein H  31.2 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3402  flagellar assembly protein H  31.2 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3455  flagellar assembly protein H  25.3 
 
 
272 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1500  flagellar assembly protein H  25.6 
 
 
264 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2289  flagellar assembly protein FliH, putative  24.31 
 
 
254 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1190  flagellar biosynthesis protein  25.71 
 
 
241 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0571  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  25.83 
 
 
242 aa  55.5  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0640  flagellar assembly protein FliH  27.33 
 
 
303 aa  55.5  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0412  flagellar assembly protein fliH, putative  30 
 
 
293 aa  55.5  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01709  type III secretion system protein  26.74 
 
 
211 aa  55.5  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1115  flagellar assembly protein FliH  26.88 
 
 
247 aa  55.1  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.222897 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4367  flagellar assembly protein H  24.44 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1960  flagellar assembly protein Flih, putative  24.7 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31844  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4170  flagellar assembly protein FliH  28.95 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.299024  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0063  type III secretion system protein  28.74 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1335  flagellar assembly protein FliH  25.33 
 
 
286 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.293497  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1542  flagellar assembly protein FliH  23.7 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1691  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like protein  21.94 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3692  flagellar assembly protein H  25.9 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.438422  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2933  flagellar assembly protein H  36.36 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1967  flagellar assembly protein FliH  26.7 
 
 
242 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.147072  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2171  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  22.34 
 
 
251 aa  53.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1889  flagellar assembly protein H  25 
 
 
240 aa  53.5  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3928  flagellar assembly protein H  23.17 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5099  flagellar assembly protein H  26.55 
 
 
255 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1347  flagellar assembly protein FliH  24.54 
 
 
251 aa  52.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003346  type III secretion cytoplasmic protein (YscL)  26.79 
 
 
212 aa  52.4  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.739868  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2902  flagellar assembly protein FliH  28.48 
 
 
201 aa  52.4  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1957  flagellar assembly protein FliH  26.99 
 
 
252 aa  52  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.253082  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0711  flagellar assembly protein FliH  24.71 
 
 
295 aa  52  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.487054 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3772  flagellar assembly protein H  31.9 
 
 
227 aa  52  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.939362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0164  flagellar assembly protein H  31.9 
 
 
227 aa  52  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3920  flagellar assembly protein FliH  21.15 
 
 
237 aa  52  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0428484 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1184  flagellar assembly protein H  27.19 
 
 
403 aa  51.6  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3805  flagellar assembly protein FliH  23.46 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0570665  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3079  flagellar assembly protein FliH  23.46 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131312  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0365  flagellar assembly protein H  23.67 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1160  Flagellar assembly protein FliH/Type III secretion system HrpE  26.09 
 
 
233 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00966123 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1995  flagellar assembly protein FliH  23.08 
 
 
296 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2040  flagellar assembly protein H  25.66 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3064  flagellar assembly protein FliH  25.93 
 
 
334 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2577  flagellar assembly protein H  25.11 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0342  flagellar assembly protein H  23.67 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1595  flagellar assembly protein FliH, putative  28.45 
 
 
200 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2989  type III secretion system protein  32.95 
 
 
205 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4393  flagellar assembly protein FliH  24.56 
 
 
245 aa  49.7  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2186  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway protein-like  25 
 
 
349 aa  49.3  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>