38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2944 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2944  ribonuclease H-related protein  100 
 
 		 206 aa  424  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.78167e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1436  RNAse H family protein  35.75 
 
 		 209 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1703  putative ribonuclease HI  36.54 
 
 		 209 aa  121  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0820498  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0319  ribonuclease H1, putative  34.98 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.531487  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0082  ribonuclease H  36.59 
 
 		 201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000796029  decreased coverage  0.0000638977 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1622  ribonuclease H  37.67 
 
 		 209 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0000792323  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1484  ribonuclease H  38.61 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000443868  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1820  ribonuclease H  37.07 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1536  ribonuclease H  36.22 
 
 		 194 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000285387  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1097  ribonuclease H  35.12 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl475  ribonuclease HI  33.66 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1523  ribonuclease H  33.83 
 
 		 221 aa  91.7  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf660  ribonuclease HI  30.05 
 
 		 487 aa  82  0.000000000000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.218986  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0683  ribonuclease H  36.57 
 
 		 754 aa  71.2  0.000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0717  ribonuclease H  35.1 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0675  RNase HI  28.51 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00564267  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02480  mitochondrial DNA repair and recombination protein PIF1 precursor, putative  41.1 
 
 		 691 aa  59.7  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.255709  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1677  ribonuclease H  30.83 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.157391  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0558  RNAse H family protein  28.89 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05188  ribonuclease H, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07180)  45.16 
 
 		 463 aa  56.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.484152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1491  putative ribonuclease HI  28.02 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0175251  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03160  ribonuclease H-related protein  36 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0066  putative ribonuclease HI  49.02 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0792726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0096  RNase H  38.1 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5118  ribonuclease H-related protein  51.06 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.465125 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3543  hypothetical protein  28.03 
 
 		 321 aa  50.8  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0291623  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1682  ribonuclease H  26.55 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240069  unclonable  0.00000212508 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1954  ribonuclease H-related protein  48.94 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44751  predicted protein  40 
 
 		 376 aa  48.9  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155872  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0617  ribonuclease H-related protein  46 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0129838 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3175  ribonuclease H  25.42 
 
 		 262 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.983549  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2542  putative ribonuclease H1  41.3 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2757  ribonuclease H  48.65 
 
 		 254 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.107855  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1906  Ribonuclease H  31.86 
 
 		 241 aa  42.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000526772  normal  0.35014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2423  double-stranded RNA/RNA-DNA hybrid binding protein-like protein  40.38 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.214407  normal  0.798779 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03470  ribonuclease H, putative  43.18 
 
 		 321 aa  42.7  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0869  hypothetical protein  42.55 
 
 		 199 aa  42.4  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.449554  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1189  ribonuclease H  41.94 
 
 		 245 aa  42.4  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.842568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>