44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1756 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1756  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  710    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0425875 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1311  Beta-mannanase  50.65 
 
 		 348 aa  287  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0780804 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3203  hypothetical protein  37.93 
 
 		 367 aa  225  9e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1016  hypothetical protein  34.08 
 
 		 345 aa  212  9e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0602  hypothetical protein  30.87 
 
 		 360 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  31.54 
 
 		 490 aa  102  8e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2139  Beta-mannanase-like  29.44 
 
 		 519 aa  101  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.926185 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  30.35 
 
 		 415 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  30.3 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  31.08 
 
 		 285 aa  86.7  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  31.08 
 
 		 300 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  31.08 
 
 		 285 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  28.7 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  30.2 
 
 		 442 aa  79.7  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  26.98 
 
 		 900 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3193  glycoside hydrolase family 26  27.59 
 
 		 519 aa  77.4  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000819014 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1162  putative endoglucanase  29.77 
 
 		 520 aa  75.9  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1517  endoglucanase  28.29 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.966231 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0209  endoglucanase  26.64 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.405756  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1096  hypothetical protein  23.61 
 
 		 533 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  26.23 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  28.91 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3975  hypothetical protein  27.19 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.125368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1791  beta-mannanase  28.14 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0568404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0157  Beta-mannanase  28.14 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.252678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3128  glycosyl transferase family 2  25.48 
 
 		 1231 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2752  PKD domain containing protein  29.2 
 
 		 620 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.215191  hitchhiker  0.0000249109 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3669  putative cellulase H precursor protein  27.27 
 
 		 325 aa  52.8  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  hitchhiker  0.00741413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.33 
 
 		 506 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  30 
 
 		 901 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0206  putative cellulase H precursor protein  23.23 
 
 		 321 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147392 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1334  Beta-mannanase-like protein  25.63 
 
 		 307 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.65985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4005  putative polysaccharide degradation protein  23.62 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2043  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  26.32 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89512  normal  0.955908 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0558  hypothetical protein  28.11 
 
 		 380 aa  46.6  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.161142  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  24.42 
 
 		 427 aa  46.2  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4334  putative polysaccharide degradation protein  23 
 
 		 322 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00591589  hitchhiker  0.00216824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0865  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  25.87 
 
 		 886 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0478  endoglucanase family protein  21.95 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.634525  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3022  hypothetical protein  23.08 
 
 		 644 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000919721 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3138  hypothetical protein  26.7 
 
 		 344 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.368738  normal  0.136262 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0547  endoglucanase family protein  22 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06050  hypothetical protein  25.81 
 
 		 314 aa  43.5  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2423  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48536  predicted protein  27.23 
 
 		 486 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0226991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>