More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1558 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1558  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
415 aa  816    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.881718  normal  0.799024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.97 
 
 
522 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02406  two-component system sensor protein  36.13 
 
 
461 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
471 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
902 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
463 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4186  histidine kinase  37.5 
 
 
526 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277122  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
456 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0767  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
461 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000842214  hitchhiker  0.00217616 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4229  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
836 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
458 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4607  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
836 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
733 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4295  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
836 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537586  normal  0.556945 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  35.37 
 
 
467 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  34.57 
 
 
499 aa  98.2  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2675  sensor histidine kinase/response regulator  37.39 
 
 
651 aa  98.2  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
874 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2569  ATPase domain-containing protein  34.65 
 
 
450 aa  98.2  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.704872  normal  0.286023 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
458 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1732  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
408 aa  96.7  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0544412  decreased coverage  0.000497213 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
592 aa  96.7  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233259  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 
680 aa  96.3  8e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1354  sensor histidine kinase  27.98 
 
 
426 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.43 
 
 
592 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130733  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5513  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
1124 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.168644  normal  0.269782 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4693  histidine kinase  35.02 
 
 
1120 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.027571  hitchhiker  0.0000750184 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4762  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
850 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400421  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5362  histidine kinase  35 
 
 
455 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0042038  normal  0.08787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
455 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000282703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
455 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000806381  normal  0.0598737 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2541  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
503 aa  94  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  35.59 
 
 
480 aa  94  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0301  sensory box sensor histidine kinase  28.81 
 
 
426 aa  93.6  6e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0123  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 
433 aa  93.2  8e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11046  two component system sensor histidine kinase kdpD  34.35 
 
 
860 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0901  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
374 aa  93.2  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0602893  normal  0.0705062 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
456 aa  92.8  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509903  normal  0.82327 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0258  histidine kinase  34.78 
 
 
398 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2765  histidine kinase  34.5 
 
 
450 aa  92.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000790139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3239  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
491 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.204488  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 
763 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4089  Osmosensitive K channel His kinase sensor  36.07 
 
 
845 aa  92.8  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1617  Signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
644 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0878  sensor histidine kinase/response regulator  35.14 
 
 
654 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.599003  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.67 
 
 
1436 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0943  histidine kinase  35.94 
 
 
530 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0684  sensor histidine kinase/response regulator  35.14 
 
 
654 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.439765  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  33.92 
 
 
497 aa  92  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
763 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
969 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356606  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
459 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  30.04 
 
 
1207 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
459 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1667  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
897 aa  91.7  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0474  sensor histidine kinase/response regulator  35.14 
 
 
639 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1402  sensor histidine kinase/response regulator  35.14 
 
 
654 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
459 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1639  response regulator/sensor histidine kinase  35.14 
 
 
693 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1795  sensor histidine kinase/response regulator  35.14 
 
 
654 aa  91.3  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3390  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
428 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
592 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
459 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
587 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 
862 aa  91.3  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  33.33 
 
 
459 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
502 aa  90.9  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
587 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
493 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
358 aa  90.9  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.27635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0496  two component sensor histidine kinase  28.51 
 
 
481 aa  90.9  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
546 aa  90.9  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
763 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3247  Osmosensitive K channel His kinase sensor  35.81 
 
 
853 aa  90.9  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0782  Signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
611 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
465 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2700  histidine kinase  32.42 
 
 
468 aa  90.5  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
945 aa  90.5  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  33.19 
 
 
910 aa  89.7  7e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 
1223 aa  90.1  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
1049 aa  90.1  7e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664054  normal  0.108682 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20811  Signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
496 aa  90.1  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.861206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 
591 aa  89.7  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3521  aerobic respiration control sensor protein ArcB  32.79 
 
 
778 aa  89.7  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
412 aa  89.7  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2709  histidine kinase  35.15 
 
 
855 aa  89.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6396  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.53 
 
 
464 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.283278  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3638  osmolarity sensor protein  32.14 
 
 
436 aa  89.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  34.53 
 
 
505 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
530 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2092  histidine kinase  30.22 
 
 
534 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.865135  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.34 
 
 
1348 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3868  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 
1127 aa  89.4  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
593 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
556 aa  89  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.928385  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2038  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
363 aa  89.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.253762  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2025  two component sensor histidine kinase  32.44 
 
 
613 aa  88.6  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 
768 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3165  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
389 aa  88.2  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00426594  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>