51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1433 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1433  recombination regulator RecX  100 
 
 		 191 aa  373  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.130729 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1832  regulatory protein RecX  28.48 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000237613  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11880  regulatory protein RecX  26.85 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829523  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0012  regulatory protein RecX  36.3 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3632  regulatory protein RecX  34.75 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3737  regulatory protein RecX  35 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3177  regulatory protein RecX  37.06 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1509  regulatory protein RecX  36.88 
 
 		 151 aa  51.6  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.99842  normal  0.151917 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17680  hypothetical protein  34.94 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331933  normal  0.823175 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1049  regulatory protein RecX  25 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00125006  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2010  regulatory protein RecX  29.05 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.71121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3247  regulatory protein RecX  36.23 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.168045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0221  regulatory protein RecX  37.16 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2629  transcriptional regulator for RecA  24.84 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.916509 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1474  regulatory protein RecX  24.06 
 
 		 152 aa  49.7  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00176584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1746  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 221 aa  49.3  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0135931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2342  regulatory protein RecX  33.81 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1482  recombination regulator RecX  37.4 
 
 		 152 aa  48.5  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1764  recombination regulator RecX  31.25 
 
 		 150 aa  48.1  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3918  regulatory protein RecX  35.93 
 
 		 222 aa  47.8  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0071  recombination regulator RecX  30.6 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1764  recombination regulator RecX  28.87 
 
 		 150 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0944  hypothetical protein  26.24 
 
 		 265 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.399855  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3102  regulatory protein RecX  25.9 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.93172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0667  regulatory protein RecX  30.98 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.331678  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0661  regulatory protein RecX  33.52 
 
 		 225 aa  45.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2447  regulatory protein RecX  31.69 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0082  regulatory protein RecX  28.06 
 
 		 156 aa  45.1  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.358521  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2135  recombination regulator RecX  33.56 
 
 		 183 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.964085  hitchhiker  0.00278139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0228  regulatory protein RecX  30.57 
 
 		 270 aa  44.7  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3210  regulatory protein RecX  29.11 
 
 		 269 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.886971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3159  regulatory protein RecX  31.61 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.975837  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3292  regulatory protein RecX  33.33 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108519  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1982  hypothetical protein  35.14 
 
 		 411 aa  43.5  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280445 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1080  regulatory protein RecX  29.79 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.34554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2203  regulatory protein RecX  31.08 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0355  regulatory protein RecX  31.97 
 
 		 168 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.432012  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2148  recombination regulator RecX  32.88 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4182  regulatory protein RecX  30.67 
 
 		 192 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.463928  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2194  recombination regulator RecX  32.88 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0540009 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2015  putative inhibitor/regulator of RecA, RecX  25 
 
 		 373 aa  42.4  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.310936 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2350  recombination regulator RecX  26.9 
 
 		 160 aa  42.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2680  recombination regulator RecX  33.82 
 
 		 302 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.521249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1595  regulatory protein RecX  29.49 
 
 		 269 aa  41.6  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4641  regulatory protein RecX  32.56 
 
 		 156 aa  41.6  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1591  regulatory protein RecX  27.1 
 
 		 158 aa  41.6  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0406  recombination regulator RecX  28.26 
 
 		 178 aa  41.6  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.678141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1119  regulatory protein RecX  34.46 
 
 		 254 aa  41.6  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.13349  normal  0.174575 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1424  regulatory protein RecX  35.11 
 
 		 207 aa  41.2  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.562639  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0073  regulatory protein RecX  29.69 
 
 		 253 aa  41.2  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0902  regulatory protein RecX  27.95 
 
 		 270 aa  41.2  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>