257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2644 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2644  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 213 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1022  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 		 208 aa  291  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2393  NUDIX hydrolase  38.65 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.024172  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0985  NUDIX hydrolase  39.59 
 
 		 211 aa  132  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585985  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2914  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0196675  normal  0.174596 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0776  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 		 219 aa  122  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.304967  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09303  hypothetical protein  34.57 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.231725  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1295  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1651  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.295983  hitchhiker  0.00316867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1211  NUDIX hydrolase  40.12 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2111  NUDIX hydrolase  40.49 
 
 		 194 aa  102  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.108274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0239  hypothetical protein  33.97 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0367  NUDIX hydrolase  39.08 
 
 		 243 aa  97.1  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0775578  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  36.41 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 200 aa  91.7  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1273  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3351  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 244 aa  90.5  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.162982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2699  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.663503  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1464  mutT/nudix family protein  40.14 
 
 		 198 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2642  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 207 aa  89  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2360  NUDIX hydrolase  33.16 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000190371  hitchhiker  0.00362317 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2225  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 		 189 aa  89  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000124127  hitchhiker  0.00567873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 		 195 aa  89  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 195 aa  88.6  6e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1986  hypothetical protein  35.16 
 
 		 217 aa  88.2  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2354  hypothetical protein  39.38 
 
 		 199 aa  88.2  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.921184  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2450  hypothetical protein  39.38 
 
 		 199 aa  88.2  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1637  hypothetical protein  39.38 
 
 		 199 aa  88.2  8e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  32.99 
 
 		 203 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2036  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 		 197 aa  88.2  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000390793  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 195 aa  88.2  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  38.03 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1694  NUDIX hydrolase  35.63 
 
 		 235 aa  87.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  32.87 
 
 		 267 aa  87.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  35.93 
 
 		 242 aa  87.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2536  NUDIX hydrolase  39.41 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.299915  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  35.76 
 
 		 204 aa  86.3  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003157  hypothetical nudix hydrolase YeaB  33.33 
 
 		 199 aa  85.9  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1929  hypothetical protein  36.72 
 
 		 197 aa  85.9  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3409  NUDIX hydrolase  36.24 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.227802  normal  0.542448 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2220  MutT/nudix family protein  33.16 
 
 		 195 aa  85.5  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0752  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 244 aa  85.9  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 190 aa  85.5  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3615  MutT/nudix family protein  35.81 
 
 		 191 aa  85.5  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3024  NUDIX hydrolase  40.24 
 
 		 198 aa  85.5  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.43822  normal  0.894324 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0937  hypothetical protein  36.63 
 
 		 202 aa  84.7  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0131467 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0521  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 254 aa  84.7  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4847  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 203 aa  85.1  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00778  MutT/nudix family protein  38.85 
 
 		 285 aa  85.1  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.025286  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 199 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1686  MutT/nudix family protein  34.34 
 
 		 202 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.231925  normal  0.379553 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0521  NUDIX hydrolase  36.09 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.661222  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01910  hypothetical protein  34.12 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0176  NUDIX hydrolase  34.16 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0165  NUDIX hydrolase  34.16 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  37.32 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  37.32 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0920  MutT/nudix family protein  31.82 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000137822  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2224  hypothetical protein  35.54 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.888042  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0119  hypothetical protein  34.12 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1902  NUDIX hydrolase  35.8 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0854349  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36090  ADP-ribose pyrophosphatase  35.33 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.453332  normal  0.430111 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1108  hypothetical protein  34.88 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0158  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.226319  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2167  NUDIX hydrolase  35.47 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1465  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.720683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3165  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.036982 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0778  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0788  NUDIX hydrolase  36.54 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1956  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00026609  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1626  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.706755  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0696  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  31.85 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0879  NUDIX hydrolase  31.64 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0808  NUDIX hydrolase  31.64 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2382  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0773  NUDIX hydrolase  37.42 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2853  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.26 
 
 		 427 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2018  hypothetical protein  32.99 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1462  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4290  NUDIX hydrolase  34.97 
 
 		 300 aa  78.2  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1739  NUDIX hydrolase  35.67 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881669  normal  0.05892 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2963  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.26 
 
 		 483 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.980156  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2540  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.26 
 
 		 333 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.209584  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0397  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.26 
 
 		 199 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0234  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.26 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0325  NUDIX hydrolase  33.13 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760343  normal  0.0266533 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1585  NUDIX hydrolase  38.52 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.254951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0319  NUDIX hydrolase  38.06 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0342181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.26 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1459  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74222  normal  0.52562 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2913  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.26 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.916312  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0599  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0172735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0509  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4814  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.572707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4900  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5201  NUDIX hydrolase  30.51 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.839635  hitchhiker  0.000709273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16300  NTP pyrophosphohydrolase  34.48 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0949  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5431  NUDIX hydrolase  29.55 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>