More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2192 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2192  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 216 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1276  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.161375  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3481  two component LuxR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.016753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2158  two component LuxR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0301144 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  33.98 
 
 		 214 aa  137  8.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  32.51 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0833  response regulator  33.17 
 
 		 227 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000189156  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  39.25 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2902  two component LuxR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 212 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1247  LuxR family DNA-binding response regulator  37.44 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32702  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 239 aa  132  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1850  two component LuxR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 216 aa  131  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5903  two component LuxR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 215 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.68975  normal  0.398777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.95 
 
 		 210 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  32.51 
 
 		 218 aa  131  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4256  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 215 aa  131  9e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5989  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  30.54 
 
 		 214 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1652  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.187578  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4248  two component LuxR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3774  two component LuxR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.329832 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4365  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.902614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4002  two component LuxR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0608  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.17 
 
 		 209 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.631365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0127  LuxR family DNA-binding response regulator  36.41 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914848  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1634  LuxR family DNA-binding response regulator  36.41 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1551  LuxR family DNA-binding response regulator  36.41 
 
 		 215 aa  128  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6314  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.93 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  34.98 
 
 		 210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5584  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2052  response regulator  32.02 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000052182  hitchhiker  0.00148564 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2356  response regulator  32.02 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.996954  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 208 aa  125  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2253  response regulator  32.02 
 
 		 218 aa  126  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000726498  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 214 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6196  two component LuxR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.280791  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.98 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2669  response regulator  31.03 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000700042  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0896  LuxR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1460  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 210 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.39219  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.99 
 
 		 210 aa  124  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0998  response regulator  35.92 
 
 		 214 aa  124  7e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1570  LuxR family DNA-binding response regulator  35.9 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 215 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1725  LuxR family DNA-binding response regulator  35.9 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3271  response regulator  31.55 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0222898  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0703  LuxR family DNA-binding response regulator  35.9 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.533722  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.48 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2520  two component LuxR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.943169  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0760  LuxR family DNA-binding response regulator  35.9 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1594  response regulator  31.03 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1154  LuxR family DNA-binding response regulator  35.9 
 
 		 215 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  36.06 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  30.05 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1093  response regulator  37.85 
 
 		 217 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.120555  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0986  LuxR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 217 aa  124  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2427  LuxR family DNA-binding response regulator  35.9 
 
 		 282 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1873  two component LuxR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1228  LuxR family DNA-binding response regulator  35.9 
 
 		 215 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0904383  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6403  two component LuxR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 271 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.285313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4108  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 210 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.755468  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  30.77 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  30.73 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0180  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.5 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1614  response regulator  31.73 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000746753  normal  0.505035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  31.73 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  31.73 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  31.73 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  31.73 
 
 		 214 aa  122  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2078  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.99 
 
 		 210 aa  122  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1639  response regulator  32.21 
 
 		 226 aa  121  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00137195  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1547  response regulator  31.73 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000288339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2172  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.99 
 
 		 210 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1608  response regulator  31.73 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000660452  normal  0.150334 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1137  two component LuxR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 214 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1860  response regulator  31.73 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  30.77 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1572  two component LuxR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.972408 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1953  response regulator  31.25 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00404481  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1762  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1436  response regulator  30.77 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.794512  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2649  response regulator  30.77 
 
 		 214 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  32.2 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  31.37 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3052  two component LuxR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.317078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  32.2 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3925  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1588  two component LuxR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.731747  normal  0.987016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1551  two component LuxR family transcriptional regulator  36 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0374  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.68 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  32.2 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  32.2 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2086  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.55 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3595  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1402  two component LuxR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>